| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 123904 = | 113 (1.210) | 6 (0.070) | 5/236 | NT | 6.0% | coding (730/774 nt) | znuC | zinc ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 123939 = | 83 (0.940) | coding (695/774 nt) | znuC | zinc ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
GGTGTGCCTGAACCGCCACGTGTGCTGCTCGGGCCACCCTGAGCAAGTCAGCGGTGACCCGGCGTTCGTCGAGCTGTTCGGCAAGACCGCACCGAGCCTGGCCATCTACCACCACCATCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGTGGTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/124058‑123904‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtggtcgTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGGCGCTCATGACCAGGTG > NC_002947/123939‑124087 GGTGTGCCTGAACCGCCACGTGTGCTGCTCGGGCCACCCTGAGCAAGTCAGCGGTGACCCGGCGTTCGTCGAGCTGTTCGGCAAGACCGCACCGAGCCTGGCCATCTACCACCACCATCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGT < 1:357448/150‑1GGTGTGCCTGAACCGCCACGTGTGCTGCTCGGGCCACCCTGAGCAAGTCAGCGGTGACCCGGCGTTCGTCGAGCTGTTCGGCAAGACCGCACCATGTTGGGCCTGCTACCACCACCATCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGT < 2:1165287/150‑1 GTGTGCCTGAACCGCCACGTGTGCTGCTCGGGCCACCCTGAGCAAGTCAGCGGTGACCCGGCGTTCGTCGAGCTGTTCGGCAAGACCGCACCGAGCCTGGCCATCTACCACCACCGTCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGTG < 1:805593/150‑1 GTGTGCCTGAACCGCCACGTGTGCTGCTCGGGCCACCCTGAGCAAGTCAGCGGTGACCCGGCGTTCGTCGAGCTGTTCGGCAAGACCGCACCGAGCCTGGCCATCTACCACCACCATCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGTG < 1:508086/150‑1 TGCCTGAACCGCCACGTGTGCTGCTCGGGCCACCCTGAGCAAGTCAACGGTGACCCGGCGTTCGTCGAGCTGTTCGGCAAGACCGCACCGAGCCTGGCCATCTACCACCACCATCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGTGGTC > 1:1636578/1‑150 CGCCACGTGTGCTGCTCGGGCCACCCTGAGCAAGTCAGCGGTGACCCGGCGTTCGTCGAGCTGTTCGGCAAGACCGCACCGAGCCTGGCCATCTACCACCACCATCACGACCACAGCCATG‑CAGGTCATGGCT‑‑GTGGTCGTGATGGTGGT < 1:446243/150‑1 TTCGGCAAGACCGCACCGAGCCTGGCCATCTACCACCACCATCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGTG > 1:1453462/1‑75 TTCGGCAAGACCGCACCGAGCCTGGCCATCTACCACCACCATCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGTG < 2:1453462/75‑1 GAGCCTGGCCATCTACCACCACCATCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGG > 1:2193290/1‑56 GAGCCTGGCCATCTACCACCACCATCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGG < 2:2193290/56‑1 CATCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGAC < 1:338037/93‑1 CATCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGAC > 2:338037/1‑93 TCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCA > 2:184936/1‑150 TCACGACCACAGCAATGACCTG‑CATGGCTCGGTGGTCGTGATGGTGGTGGGAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCA > 2:628413/1‑150 CACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACAC > 1:1785052/1‑150 GGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGGCGCTCATGACCA < 1:2394460/150‑1 GGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGGCGCTCATGACCA < 1:385494/150‑1 GTGNTGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGGCGCTCATGACCAGGTG > 2:1515093/1‑150 GTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGATCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGGCGCTCATGACCAGGTG > 2:1100280/1‑150 GGTGTGCCTGAACCGCCACGTGTGCTGCTCGGGCCACCCTGAGCAAGTCAGCGGTGACCCGGCGTTCGTCGAGCTGTTCGGCAAGACCGCACCGAGCCTGGCCATCTACCACCACCATCACGACCACAGCCATGACCTG‑CATGGCTCGGTGGTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/124058‑123904‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtggtcgTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGGCGCTCATGACCAGGTG > NC_002947/123939‑124087 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |