New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 123904 = | 113 (1.210) | 6 (0.070) | 5/236 | NT | 6.0% | coding (730/774 nt) | znuC | zinc ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 123939 = | 83 (0.940) | coding (695/774 nt) | znuC | zinc ABC transporter ATP‑binding protein |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
AGGGTGTCGCCAAAATAGGCCATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGG > NC_002947/123755‑124052 | cacctggtcatgagcgccaccgaccaggtggtgtgcctgaaccgccacgtgtgctgctcgggccaccctgagcaagtcagcggtgacccggcgttcgtcgagctgttcggcaagaccgcaccgagcctggccatctaccaccaccancac > 2:1515093‑M1/150‑150 (MQ=255) ggTGTCGCGAAAATAGGCCATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGa < 2:254864/150‑1 (MQ=255) gtgtCGCCAAAATAGGCCATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGac < 1:2164134/150‑1 (MQ=255) tggtcatgagcgccaccgaccaggtggtgtgcctgaaccgccacgtgtgctgctcgggccaccctgagcaagtcagcggtgacccggcgttcgtcgagctgttcggcaagaccgcaccgagcctggccatctaccaccaccatcaCGacc < 1:385494‑M1/5‑1 (MQ=255) gCCAAAATAGGCCATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCg > 2:1048755/1‑150 (MQ=255) aaaaaTAGGCCATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTCCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTACGTGAACATTGGTGCCAGGGGCGACCACCGAg < 1:305867/149‑1 (MQ=255) aaaaTAGGCCATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACCTGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGc < 1:655400/150‑1 (MQ=255) aaTAGGCCATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGCGGCGACCCCCGAGcct < 2:1912452/150‑2 (MQ=255) gCCATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAg < 1:358061/150‑1 (MQ=255) gCCATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAg < 1:2228841/150‑1 (MQ=255) ccATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACTAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGTAGTGCTCTCCGTGAACACGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCcagg‑cagg > 2:1260811/1‑150 (MQ=255) ccATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAgg < 1:966758/150‑1 (MQ=255) cATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGt < 1:422444/150‑1 (MQ=255) 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1:2146578/150‑1 (MQ=255) gaaAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGAtggtgg > 2:332002/1‑93 (MQ=255) gaaAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGAtggtgg < 1:332002/93‑1 (MQ=255) gaaAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCa > 2:2449591/1‑150 (MQ=255) aaaaTCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCAc < 2:2274362/150‑1 (MQ=255) aaaaTCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCAc < 1:347930/150‑1 (MQ=255) aaTCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCg > 1:1714169/1‑150 (MQ=255) aaTCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCg > 2:1636578/1‑150 (MQ=255) aGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGa < 1:867910/150‑1 (MQ=255) gCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGCGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGAc > 1:1586197/1‑150 (MQ=255) ccATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACt > 1:1701028/1‑150 (MQ=255) ttGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCt > 1:1818520/1‑118 (MQ=255) cAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAggg < 1:1260811/150‑1 (MQ=255) aGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGACAAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGt > 1:623285/1‑150 (MQ=255) aGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGt < 1:120339/150‑1 (MQ=255) aGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGATCATTGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGt < 1:1969648/150‑1 (MQ=255) cctcCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGccc < 1:2416109/149‑1 (MQ=255) tcCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGcc > 2:1323139/1‑79 (MQ=255) tcCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGcc < 1:1323139/79‑1 (MQ=255) tcCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGa < 1:1935613/150‑1 (MQ=255) gTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCtt < 2:176462/93‑1 (MQ=255) gTGNCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTgg > 2:1499360/1‑150 (MQ=255) accaccatcaCGACCAC‑‑AGCCATGACCTG‑CATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCg < 1:446243‑M1/140‑1 (MQ=255) tGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGc > 1:1558613/1‑150 (MQ=255) cAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑TAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGag > 1:1017425/1‑134 (MQ=255) cAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑TAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGag < 2:1017425/134‑1 (MQ=255) gCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAgg < 2:1290472/150‑1 (MQ=255) | AGGGTGTCGCCAAAATAGGCCATGCGCCGCCATACCACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGG > NC_002947/123755‑124052 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |