New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 123904 = | 113 (1.210) | 6 (0.070) | 5/236 | NT | 6.0% | coding (730/774 nt) | znuC | zinc ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 123939 = | 83 (0.940) | coding (695/774 nt) | znuC | zinc ABC transporter ATP‑binding protein |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGGCGCTCATGACCAGGTG > NC_002947/123790‑124087 | cACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGt > 1:779064/1‑150 (MQ=255) cACGAAGGAGCCCAGTGAACCTGCAATCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCGGTGGTCGt > 2:1969648/1‑150 (MQ=255) aCGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTg > 1:856092/1‑150 (MQ=255) tgaaccgccacgtgtgctgctcgggccaccctgagcaagtcagcggtgacccggcgttcgtcgagctgttcggcaagaccgcaccgagcctggccatctaccaccaccatcaCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGa > 2:184936‑M1/113‑150 (MQ=255) cGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGa < 2:1547474/150‑1 (MQ=255) aGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGAtgg < 1:1048755/150‑1 (MQ=255) gAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGAtggtg < 2:2279701/150‑1 (MQ=255) gCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGAtggtggt > 1:1214149/1‑150 (MQ=255) cgccacgtgtgctgctcgggccaccctgagcaagtcagcggtgacccggcgttcgtcgagctgttcggcaagaccgcaccgagcctggccatctaccaccaccatcacgaccacagccatgcaggtcatggctgtggtcgTGAtggtggt < 1:446243‑M2/10‑1 (MQ=255) cccAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGAtggtggtg < 2:622411/150‑1 (MQ=255) aGTGGACCTGCAGCCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGGGGTa < 1:1015202/150‑1 (MQ=255) aGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGa > 1:1395013/1‑139 (MQ=255) aGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGa < 2:1395013/139‑1 (MQ=255) ggACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGGTTTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGAt < 1:531526/150‑1 (MQ=255) gACCCGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATg < 1:2207771/150‑1 (MQ=255) cccTGCAACAAGTGCCAGGGACGAGCCGGCAAGCAAGGCGGAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATgg < 2:1201998/149‑1 (MQ=255) cTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACCTGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGGCGTGACGGTGGTGGTAGATGGcc > 2:1036552/1‑150 (MQ=255) cTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGcc > 2:2146578/1‑150 (MQ=255) 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cAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCgg < 2:1009208/150‑1 (MQ=255) aGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGCAAATGAGCCATGCTGGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCAGG‑CAGGTCATGGCTGGGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTTCggg > 2:867910/1‑149 (MQ=255) gggACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTc < 2:1179124/150‑1 (MQ=255) cAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGc < 2:924963/150‑1 (MQ=255) ccGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTACTCTCGGCTAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGaa > 1:2274362/1‑150 (MQ=255) 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cAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑TAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGag < 2:1017425/134‑1 (MQ=255) catcacgaccacagccatgacctgcatggctcggtggtcgTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTcgac < 1:338037‑M2/53‑1 (MQ=255) catcacgaccacagccatgacctgcatggctcggtggtcgTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTcgac > 2:338037‑M2/41‑93 (MQ=255) gggCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCAGAGCAGCACACGTGGCGGTTCa < 1:1254834/150‑1 (MQ=255) tcacgaccacagccatgacctgcatggctcggtggtcgTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCa > 2:184936‑M2/39‑150 (MQ=255) tcacgaccacagcaatgacctgcatggctcggtggtcgTGATGGTGGTGGGAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCa > 2:628413‑M2/39‑150 (MQ=255) gCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAgg < 2:1290472/150‑1 (MQ=255) CACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGaa > 1:1453462‑M1/1‑75 (MQ=255) CACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGaa < 2:1453462‑M1/75‑1 (MQ=255) CACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCacac < 1:508086‑M1/150‑1 (MQ=255) CACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGACGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCacac < 1:805593‑M1/150‑1 (MQ=255) cacagccatgacctgcatggctcggtggtcgTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCacac > 1:1785052‑M2/32‑150 (MQ=255) ACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGCAGGCCCAACATGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCAcacc < 2:1165287‑M1/150‑1 (MQ=255) ACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCAcacc < 1:357448‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTc > 1:2193290‑M1/1‑56 (MQ=255) CCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTc < 2:2193290‑M1/56‑1 (MQ=255) aGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAAc > 2:1078654/1‑83 (MQ=255) aGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAAc < 1:1078654/83‑1 (MQ=255) ccATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTgg > 2:531255/1‑150 (MQ=255) tG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCg < 2:1558613/150‑1 (MQ=255) aGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTg < 2:1645809/150‑1 (MQ=255) ggTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTgg < 1:1138310/150‑1 (MQ=255) gCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGGCGCTCAt < 2:60632/150‑1 (MQ=255) tgtgGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGCCGCTCATGa > 1:1855639/1‑150 (MQ=255) ggtcgTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGGCGCTCATGACCa < 1:2394460‑M2/145‑1 (MQ=255) ggtcgTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGGCGCTCATGACCa < 1:385494‑M2/145‑1 (MQ=255) gTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGATCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGGCGCTCATGACCAGGTg > 2:1100280‑M2/2‑150 (MQ=255) | CACGAAGGAGCCCAGTGGACCTGCAACCAGTGCCAGGGACAAGCCGGCAAGCAAGGCGTAGAGAAGAAAATCAGCCATGCTTGCAGTGCTCTCCGTGAACATGGGTGCCAGGGGCGACCACCGAGCCATG‑CAGGTCATGGCTGTGGTCGTGATGGTGGTGGTAGATGGCCAGGCTCGGTGCGGTCTTGCCGAACAGCTCGACGAACGCCGGGTCACCGCTGACTTGCTCAGGGTGGCCCGAGCAGCACACGTGGCGGTTCAGGCACACCACCTGGTCGGTGGCGCTCATGACCAGGTG > NC_002947/123790‑124087 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |