| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
GAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTGCTGG > NC_002947/261726‑262023 | gaaCCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTc > 1:466342/1‑150 (MQ=255)gaaCCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGACGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTc > 1:1989103/1‑150 (MQ=255) aaCCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTcc < 1:2425553/150‑1 (MQ=255) aaCCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTcc > 2:1770126/1‑150 (MQ=255) cGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCgcgc > 1:1349147/1‑150 (MQ=255) cGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAAAATCAGAAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCACGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCgcgc > 1:746412/1‑150 (MQ=255) gAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGGCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGcc > 1:1981183/1‑150 (MQ=255) gAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCCGGGCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGcc > 1:1639530/1‑150 (MQ=255) ttGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTg > 2:961661/1‑150 (MQ=255) tgtgCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGc < 1:1072539/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATAATGCAGTGGGTCCCGCACCACAATGTTGG‑CGCCTTCTCCAGTGCCCGACGTGcc > 2:1453046/1‑150 (MQ=255) ctgccagcgccagcaacgccggctggtgcttgagccagccaagaatgcccactgcctcacgccgtacggcggcggcgtcatcggccagcgccagcagcgcagggtcggcagcatcctccaggcgcagcCCGCGCCAGTGCCCTACGTGcc < 1:2331303‑M1/22‑1 (MQ=255) gcgctgcgctGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTTGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTgc > 1:2017762/1‑150 (MQ=255) gctgcgctgGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTgcgc < 2:1830881/150‑1 (MQ=255) gccagcaacgccggctggtgcttgagccagccatgaatgcccactgcctcacgccgtacggcggcggcgtcataggccagcgccagcagcgcagggtcggcagcatcctccaggcgcagcTCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGa > 2:1235403‑M1/121‑150 (MQ=255) tgGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTgc > 1:1246866/1‑150 (MQ=255) tgGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCGCAGCGAACGTAAAAGGCTTGCAGCCGGCCAGCTGATCCTGCGATGAGGCGTTGAATCTG‑GGCATTATTTCAGCGCCATTGCCCCACGTGCCTTGCGCGAGCTgc > 2:1105203/1‑150 (MQ=255) gCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTgcgc < 1:2317077/150‑1 (MQ=255) 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ccgccgAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTggagg > 2:2276266/1‑150 (MQ=255) ccgccgAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTggagg < 2:813762/150‑1 (MQ=255) ccgccgAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTggagg > 1:220943/1‑150 (MQ=255) gccgAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGAt < 2:220943/150‑1 (MQ=255) gccgAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGAt < 1:2381460/150‑1 (MQ=255) ccgAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGGGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGAtg > 1:87054/1‑150 (MQ=255) ccgAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGAtg > 1:132460/1‑150 (MQ=255) gCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGAtgctgc > 2:1631002/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTg > 1:2092964/1‑111 (MQ=255) gCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGCTGCTGCCGACCCTg > 1:1053211/1‑150 (MQ=255) 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ccATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTtggc > 1:1963377/1‑150 (MQ=255) gggTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTtggctggc > 1:309195/1‑150 (MQ=255) gggTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTtggctggc > 2:1695673/1‑150 (MQ=255) gggTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTtggctggc < 2:1632907/150‑1 (MQ=255) tCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCa < 1:1105203/150‑1 (MQ=255) aaGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAg < 2:2110914/150‑1 (MQ=255) aaGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAg < 2:617055/150‑1 (MQ=255) aaGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAg > 2:102531/1‑150 (MQ=255) aCGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCAcc > 1:2353151/1‑150 (MQ=255) gCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTgctggcgct < 1:902945/86‑1 (MQ=255) gCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTgctggcgct > 2:902945/1‑86 (MQ=255) gATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCg < 1:2154425/150‑1 (MQ=255) aTGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGccaa < 2:132460/150‑3 (MQ=255) cTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGt < 2:1447381/99‑1 (MQ=255) cTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGt > 1:1447381/1‑99 (MQ=255) cTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTtggc > 2:745060/1‑127 (MQ=255) cTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTAAGTGTCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTtggc < 1:745060/127‑1 (MQ=255) tt‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTg < 2:843062/150‑1 (MQ=255) cGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTgct < 1:1622052/150‑1 (MQ=255) gTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTgctg < 2:1954688/150‑1 (MQ=255) tCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCTCGAGCTGCTCCTGGAGGATTCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTgctgg < 1:361094/150‑1 (MQ=255) | GAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTGCTGG > NC_002947/261726‑262023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |