| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 261875 = | 116 (1.240) | 8 (0.090) | 7/250 | NT | 6.3% | coding (357/966 nt) | PP_0210 | phycobiliprotein |
| ? | NC_002947 | 261905 = | 121 (1.300) | coding (387/966 nt) | PP_0210 | phycobiliprotein | |||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
TGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTGCTGGCGCTGGCAGCGCTCGCCGAGACCGAGCCAGA > NC_002947/261760‑262054 | tgGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTgc > 1:1246866/1‑150 (MQ=255)tgGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCGCAGCGAACGTAAAAGGCTTGCAGCCGGCCAGCTGATCCTGCGATGAGGCGTTGAATCTG‑GGCATTATTTCAGCGCCATTGCCCCACGTGCCTTGCGCGAGCTgc > 2:1105203/1‑150 (MQ=255) gCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTgcgc < 1:2317077/150‑1 (MQ=255) gccggctggtgcttgagccagccaagaatgcccactgcctcacgccgtacggcggcggcgtcatcggccagcgccagcagcgcagggtcggcagcatcctccaggcgcagcCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCt > 2:2331303‑M1/112‑150 (MQ=255) aTGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGcc < 1:377089/147‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGcc > 2:377089/1‑147 (MQ=255) aTGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTgg > 2:1786538/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTgga < 2:976990/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGACGGGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCNgga < 2:1519956/150‑1 (MQ=255) gctggtgcttgagccagccaagaatgcccactgcctcacgccgtacggcggcggcgtcatcggccagcgccagcagcgcagggtcggcagcatcctccaggcgcagcCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTggag > 1:487885‑M1/108‑150 (MQ=255) ccgccgAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTggagg > 2:2276266/1‑150 (MQ=255) ccgccgAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTggagg < 2:813762/150‑1 (MQ=255) gccgAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGAt < 1:2381460/150‑1 (MQ=255) ccgAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGGGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGAtg > 1:87054/1‑150 (MQ=255) ccgAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGAtg > 1:132460/1‑150 (MQ=255) gCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGAtgctgc > 2:1631002/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGCTGCTGCCGACCCTg > 1:1053211/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTgcg < 1:1678047/150‑1 (MQ=255) 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agagCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTgctggcgctgg < 1:1321279/150‑1 (MQ=255) agagCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATACTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTgctggcgctgg < 2:436946/150‑1 (MQ=255) ccTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGa < 2:1989103/150‑1 (MQ=255) tcacgccgtacggcggcggcgtcatcggccagcgccagcagcgcagggtcggcagcatcctccaggcgcagcCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTggag > 2:1640295‑M1/73‑115 (MQ=255) tCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATTCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATg > 2:2268306/1‑150 (MQ=255) tCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATg > 2:587008/1‑150 (MQ=255) aGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGAc < 1:587008/150‑1 (MQ=255) aGCGAACTT‑AAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGAcg > 1:47995/1‑150 (MQ=255) gCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGAcg > 1:359426/1‑150 (MQ=255) gAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGAcgcc > 2:2225719/1‑150 (MQ=255) 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gCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCa < 1:2020897/150‑1 (MQ=255) aCGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCAcc > 1:2353151/1‑150 (MQ=255) gCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTgctggcgct > 2:902945/1‑86 (MQ=255) ctccaggcgcagctcgcgcaaggcacgtagggcactggcgcggGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGa < 1:1640295‑M2/72‑1 (MQ=255) cGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGcc > 1:1967036/1‑150 (MQ=255) aTGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCgg > 2:1445568/1‑150 (MQ=255) caggcgcagctcgcgcaaggcacgtagggcactggcgcggGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTgctgg < 2:309804‑M2/38‑1 (MQ=255) caggcgcagctcgcgcaaggcacgtagggcactggcgcggGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTgctgg > 1:309804‑M2/41‑78 (MQ=255) aggcgcagctcgcgcaaggcacgtagggcactggcgcggGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGc > 2:2331303‑M2/40‑150 (MQ=255) cTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGt > 1:1447381/1‑99 (MQ=255) cTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTtggc > 2:745060/1‑127 (MQ=255) cTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTAAGTGTCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTtggc < 1:745060/127‑1 (MQ=255) tt‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTg < 2:843062/150‑1 (MQ=255) cGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTgct < 1:1622052/150‑1 (MQ=255) tcgcgcaaggcacgtagggcactggcgcgaGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCTATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCATGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTgctggc > 2:1235403‑M2/31‑150 (MQ=255) cgcgCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTCGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTgctggcg < 2:1349147/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGATGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTgctggcgc > 2:2169795/1‑150 (MQ=255) gcCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTgctggcgctg < 2:1248019/150‑1 (MQ=255) ccTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTgctggcgctggc < 1:1251050/63‑1 (MQ=255) cTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTGCTGGCGCTGGCAGCGCTc > 2:464081/1‑150 (MQ=255) aCGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATTCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTGCTGGCGCTGGCAGCGCTCGc < 1:2268306/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCGGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTGCTGGAGCTGGCAGCGCTCGCCgaga > 1:1158007/1‑150 (MQ=255) cTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTGCTGGCGCTGGCAGCGCTCGCCgag > 1:7705/1‑148 (MQ=255) cgcgAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTGCTGGCGCTGGCAGCGCTCGCCGAGACCGAg < 2:1981183/150‑1 (MQ=255) gcgAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTGCTGGCGCTGGCAGCGCTCGCCGAGACCGAGc > 2:676873/1‑150 (MQ=255) gCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTGCTGGCGCTGGCAGCGCTCGCCGAGACCGAGCCAGa > 1:570358/1‑150 (MQ=255) | TGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGCGAACTTAAAAGCCTTGAAGCCGGCCAGCTGATCCTGCCATGGGTCAAGCACGCCGATGCCTT‑CGTCCGCGCCAGTGCCCTACGTGCCTTGCGCGAGCTGCGCCTGGAGGATGCTGCCGACCCTGCGCTGCTGGCGCTGGCCGATGACGCCGCCGCCGTACGGCGTGAGGCAGTGGGCATTCTTGGCTGGCTCAAGCACCAGCCGGCGTTGCTGGCGCTGGCAGCGCTCGCCGAGACCGAGCCAGA > NC_002947/261760‑262054 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |