| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 530833 = | 105 (1.130) | 5 (0.050) | 4/244 | NT | 5.0% | coding (744/960 nt) | birA | bifunctional biotin‑[acetyl‑CoA‑carboxylase] ligase/biotin operon repressor BirA |
| ? | NC_002947 | 530860 = | 87 (0.960) | coding (771/960 nt) | birA | bifunctional biotin‑[acetyl‑CoA‑carboxylase] ligase/biotin operon repressor BirA | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GTGGTGCTAGGCATTGGTATCAATGTAAACATGCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCG > NC_002947/530684‑530976 | tgaagctcttttccatcccgtccacctcaaggcgcaaaccaccctgcccgtcgacgccaagaaccacgccatcaatacgtgtactaccagcaaccagcgatacattgcgcccctgccacaagtgcgcctgctcccactcctcctggaatg < 1:2222068‑M1/1‑1 (MQ=255) tggtgCTAGGCATTGGTATCAATGTAAACATGCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGgcgc > 1:654489/1‑150 (MQ=255) gaagctcttttccatcccgtccacctcaaggcgcaaaccaccctgcccgtcgacgccaagaaccacgccatcaatacgtgtactaccagcaaccagcgatacattgcgcccctgccacaagtgcgcctgctcccactcctcctggaatGc > 1:1098222‑M1/149‑150 (MQ=255) aagctcttttccatcccgtccacctcaaggcgcaaaccaccctgcccgtcgacgccaagaaccacgccatcaatacgtgtactaccagcaaccagcgatacattgcgcccctgccacaagtgcgcctgctcccactcctcctggaatGCg > 1:1266303‑M1/148‑150 (MQ=255) tgCTAGGCATTGGTATCAATGTAAACATGCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTc > 2:595344/1‑150 (MQ=255) gctcttttccatcccgtccacctcaaggcgcaaaccaccctgcccgtcgacgccaagaaccacgccatcaatacgtgtactaccagcaaccagcgatacattgcgcccctgccacaagtgcgcctgctcccactcctcctggaatGCGTc < 2:477275‑M1/5‑1 (MQ=255) gCTAGGCATTGGTATCAATGTAAACATGCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCa > 1:1018924/1‑150 (MQ=255) tacgCATTGGTATCAATGTAAACCTGCAGGTGAATGAACAGGTCGTTCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATc < 2:1763212/147‑1 (MQ=255) tAGGCATTGGTATCAATGTAAACATGCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATc < 1:1892704/150‑1 (MQ=255) aGGCATTGGTATCAATGTAAACATGCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCGTAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATcg > 2:176237/1‑150 (MQ=255) cATTGGTATCAATGTAAACATGCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGCCTTATAAGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATcgccg > 2:1263814/1‑150 (MQ=255) aTTGGTATCAATGTAAACATGCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTTCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATcgccgc < 1:757705/150‑1 (MQ=255) aTTGGTATCAATGTAAACATGCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATcgccgc > 2:181559/1‑150 (MQ=255) tcccgtccacctcaaggcgcaaaccaccctgcccgtcgacgccaagaaccacgccatcaatacgtgtactaccagcaaccagcgatacattgcgcccctgccacaagtgcgcctgctcccactcctcctggaatGCg > 2:1772287‑M1/135‑137 (MQ=255) tcccgtccacctcaaggcgcaaaccaccctgcccgtcgacgccaagaaccacgccatcaatacgtgtactaccagcaaccagcgatacattgcgcccctgccacaagtgcgcctgctcccactcctcctggaatGCg < 1:1772287‑M1/3‑1 (MQ=255) tcccgtccacctcaaggcgcaaaccaccctgcccgtcgacgccaagaaccacgccatcaatacgtgtactaccagcaaccagcgatacattgcgcccctgccacaagtgcgcctgctcccactcctcctggaatGCGTCATCGCCGCTAc < 2:7686‑M1/16‑1 (MQ=255) aTCAATGTAAACATGCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGc > 2:470117/1‑150 (MQ=255) aTCAATGTAAACATGCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGc > 2:2332633/1‑150 (MQ=255) 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tGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCaggagg < 2:469125/150‑1 (MQ=255) aacgaacAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGgagg‑ag > 2:2071683/1‑150 (MQ=255) gaacAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTgg < 2:1111527/150‑1 (MQ=255) gaacAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTgg > 2:1949403/1‑150 (MQ=255) aacAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTggg < 1:239239/150‑1 (MQ=255) 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ttGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGc > 2:2414744/1‑150 (MQ=255) ggTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGt < 1:1347278/150‑1 (MQ=255) gTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTg > 1:1184742/1‑150 (MQ=255) cgcgCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCAc < 1:2150792/91‑1 (MQ=255) cgcgCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCAc > 2:2150792/1‑91 (MQ=255) gcgcTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTa < 1:1853633/111‑1 (MQ=255) gcgcTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTa > 2:1853633/1‑111 (MQ=255) ctgctCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCtt < 1:877857/150‑1 (MQ=255) tcagtccgCAGCTACAGCCCGAATTGGCGCGGCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑CGTGGGAGCCGGCGCACTTGTGGCAGGCGCCGTTTGCACGGCTGGCTGCGGGTGGGACACGTATTGATTGCGTGGTTCTTGGCg > 2:1105373/1‑150 (MQ=255) tcagCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGa > 1:1034824/1‑150 (MQ=255) agcagcTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTg > 1:129387/1‑141 (MQ=255) tACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCt < 1:2374073/97‑1 (MQ=255) tACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCt > 2:2374073/1‑97 (MQ=255) aCAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAggg < 1:1775881/150‑1 (MQ=255) aGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGggtg < 2:1912430/150‑1 (MQ=255) gAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCATGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTg > 2:600410/1‑150 (MQ=255) | GTGGTGCTAGGCATTGGTATCAATGTAAACATGCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTACGGCTTTGCCGCATT‑CCAGGAGG‑AGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCG > NC_002947/530684‑530976 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |