| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 530833 = | 105 (1.130) | 5 (0.050) | 4/244 | NT | 5.0% | coding (744/960 nt) | birA | bifunctional biotin‑[acetyl‑CoA‑carboxylase] ligase/biotin operon repressor BirA |
| ? | NC_002947 | 530860 = | 87 (0.960) | coding (771/960 nt) | birA | bifunctional biotin‑[acetyl‑CoA‑carboxylase] ligase/biotin operon repressor BirA | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGACGGGATGGAAAAGAGCTTCAG > NC_002947/530716‑531009 | cgcaaaccaccctgcccgtcgacgccaagaaccacgccatcaatacgtgtactaccagcaaccagcgatacattgcgcccctgccacaagtgcgcctgctcccactcctcctggaatGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCa > 1:477275‑M1/118‑150 (MQ=255) aGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCagg > 2:679286/1‑150 (MQ=255) ggTGAACGAACCGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCagga < 1:2332633/150‑1 (MQ=255) tGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCaggagg < 2:469125/150‑1 (MQ=255) gaacAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTgg > 2:1949403/1‑150 (MQ=255) gaacAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTgg < 2:1111527/150‑1 (MQ=255) cctgcccgtcgacgccaagaaccacgccatcaatacgtgtactaccagcaaccagcgatacattgcgcccctgccacaagtgcgcctgctcccactcctcctggaatgcgtcatcgccgctacggctttgccgcATTCCAGGAGGAGTgg < 1:7686‑M2/16‑1 (MQ=255) aacAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTggg < 1:239239/150‑1 (MQ=255) acAGGTCGATCAGCAGTGGACTTGTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCATTGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGa > 2:1194704/1‑150 (MQ=255) acAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGa < 1:1013854/150‑1 (MQ=255) ggTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGAGCa < 2:654489/150‑1 (MQ=255) gTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAg > 2:1526844/1‑150 (MQ=255) tCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAgg < 1:860359/150‑1 (MQ=255) 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cTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGa < 1:2132271/127‑1 (MQ=255) cggcgTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAAt < 1:165222/150‑1 (MQ=255) cggcgTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAAt < 1:470117/150‑1 (MQ=255) gcgTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGt < 1:1838840/150‑1 (MQ=255) gAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATc > 2:170513/1‑149 (MQ=255) 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ttGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGACGGGATGGAAAaga < 1:902931/150‑1 (MQ=255) gtGCCGCATTCCAGGGGGCGTGGGGGTAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCGTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGACGGGATGGAAAaga < 2:440356/149‑1 (MQ=255) gacgcATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGACGGGATGGAAAAGAGc < 2:477275‑M2/145‑1 (MQ=255) gCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGACGGGATGGAAAAGAGc < 1:2248500/150‑1 (MQ=255) cgcATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGACGGGa < 1:1772287‑M2/134‑1 (MQ=255) cgcATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGACGGGa > 2:1772287‑M2/4‑137 (MQ=255) cgcATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGACGGGATGGAAAAGAGCtt > 1:1266303‑M2/4‑150 (MQ=255) cgcATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCCGGTTGCTGGTAGTACACg < 1:2381149‑M2/72‑1 (MQ=255) cgcATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCCGGTTGCTGGTAGTACACg > 2:2381149‑M2/4‑75 (MQ=255) gcATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGACGGGATGGAAAAGAGCTTc > 1:1098222‑M2/3‑150 (MQ=255) cATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGACGGGATGGAAAAGAGCTTCa < 1:2222068‑M2/149‑1 (MQ=255) aTTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGAc > 2:2263999/1‑130 (MQ=255) aTTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGAc < 1:2263999/130‑1 (MQ=255) aTTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGACGGGATGGAAAAGAGCTTCAg > 1:587741/1‑150 (MQ=255) | GCAGGTGAACGAACAGGTCGATCAGCAGTGGACTTCTATGCGGCGTGAGGTTGGTGCAGCCATAGATCGCAATCACTTGGTCGCGCTGCTCAGTCAGCAGCTACAGCACGAATTGGCGCGTCATCGCCGCTA‑CGGCTTTGCCGCATTCCAGGAGGAGTGGGAGCAGGCGCACTTGTGGCAGGGGCGCAATGTATCGCTGGTTGCTGGTAGTACACGTATTGATGGCGTGGTTCTTGGCGTCGACGGGCAGGGTGGTTTGCGCCTTGAGGTGGACGGGATGGAAAAGAGCTTCAG > NC_002947/530716‑531009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |