| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 590706 | 87 (0.930) | 6 (0.070) | 7/238 | NT | 6.2% | coding (827/885 nt) | PP_0500 | dTDP‑4‑rhamnose reductase‑like protein |
| ? | NC_002947 | = 590722 | 98 (1.100) | coding (843/885 nt) | PP_0500 | dTDP‑4‑rhamnose reductase‑like protein | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GATCCTCGCCGAGGCCGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATTC > NC_002947/590560‑590853 | gATCCTCGCCGAGGCCGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCc‑gcg < 2:3301/150‑1 (MQ=255) aTCCTCGCCGAGGCCGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGt < 2:799983/150‑1 (MQ=255) aTCCTCGCCGAGGCCGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGt < 1:930397/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCGAGGCCGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGACTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGc > 1:982018/1‑150 (MQ=255) cTCGCCGAGGCCGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGcc > 1:1414733/1‑150 (MQ=255) tCGCCGAGGCCGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCCagcgcgcc > 2:1564370‑M1/1‑142 (MQ=255) gccggccAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCt > 2:1714977/1‑150 (MQ=255) cGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGTC‑GCGTGCCTGGCGCGCTgg < 1:2093468‑M2/150‑3 (MQ=255) cGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTgg > 1:1646822‑M2/1‑148 (MQ=255) ggCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggc > 2:179758‑M2/1‑147 (MQ=255) ggCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggc < 1:421407‑M2/150‑4 (MQ=255) ccAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggctt < 2:1377872‑M2/150‑6 (MQ=255) ccAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggctt < 2:1006972‑M2/150‑6 (MQ=255) aaTACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCCagcgcgccaggcacgcggcttga < 1:1564370‑M1/150‑24 (MQ=255) aaTACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGc < 1:1377872/150‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACctc > 1:807498/1‑150 (MQ=255) gCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACctc < 1:1374496/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACt < 2:807498/150‑1 (MQ=255) 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aGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTAATACCTTCGGTATCAAGCC‑GAGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATcc > 1:894704/1‑134 (MQ=255) aGCGAAGAACCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGc > 2:2447112/1‑150 (MQ=255) gCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCATGCCCGCACATCATACCTGCCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGcc < 2:2230881/150‑1 (MQ=255) gAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCgg < 2:2046423/150‑1 (MQ=255) aaGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGc < 2:1414733/150‑1 (MQ=255) 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ttCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGc > 1:1340282/1‑150 (MQ=255) ttCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGc > 2:419400/1‑150 (MQ=255) ttCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGc > 1:2303320/1‑150 (MQ=255) gTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCAt > 2:1895469/1‑104 (MQ=255) gTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCAt < 1:1895469/104‑1 (MQ=255) gTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTa > 2:329690/1‑150 (MQ=255) tATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTAc < 1:2446152/150‑1 (MQ=255) aTCAAGCCgcgtgcctggcgcgctggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtcccgcgtgctgtggctcttcgctg < 2:1190786‑M1/90‑83 (MQ=255) aTCAAGCCgcgtgcctggcgcgctggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctg > 1:1190786‑M1/1‑8 (MQ=255) tCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcatgggcctgcggcgtgggggcctgaacggccagctggcggtatt < 1:1564370‑M2/150‑128 (MQ=255) tCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcatgg < 1:483784‑M2/110‑88 (MQ=255) tCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcatgg > 2:483784‑M2/1‑23 (MQ=255) tCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGc > 1:516972/1‑150 (MQ=255) tCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACACCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACCAGGGGTACGCCGTACGc > 2:1317525/1‑150 (MQ=255) aaGCCagcgcgccaggcacgcggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcatgggcctgcggcgtgggggcctgaacggccagctggcggtattgg < 2:1377872‑M1/150‑146 (MQ=255) aaGCCagcgcgccaggcacgcggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcatgggcctgcggcgtgggggcctgaacggccagctggcggtattgg < 2:1006972‑M1/150‑146 (MQ=255) aaGCCagcgcgccaggcacgcggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcagaccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcatgggcctgcggcgtgggggcctgaacggccagctggcggtattgg > 2:851106‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCTGATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTTCCACCTGTGCTATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCAtt < 1:652995/150‑1 (MQ=255) aGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCAtt < 1:923449/150‑1 (MQ=255) gCCagcgcgccaggcacgcggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcatgggcctgcggcgtgggggcctgaacggccagctggcggtattggcc > 2:179758‑M1/1‑3 (MQ=255) gCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcat < 2:2278368‑M2/104‑86 (MQ=255) gCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcat > 1:2278368‑M2/1‑19 (MQ=255) gCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATtc < 2:327840/150‑1 (MQ=255) gCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATtc < 2:1340282/150‑1 (MQ=255) ccagcgcgccaggcacgcggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcatgggcctgcggcgtgggggcctgaacggccagctggcggtattggccg > 1:1646822‑M1/1‑2 (MQ=255) ccagcgcgccaggcacgcgacttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcatgggcctgcggcgtgggggcctgaacggccagctggcggtattggccg < 1:2093468‑M1/150‑149 (MQ=255) | GATCCTCGCCGAGGCCGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATTC > NC_002947/590560‑590853 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |