New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 590722 | 98 (1.100) | coding (843/885 nt) | PP_0500 | dTDP‑4‑rhamnose reductase‑like protein |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GCCGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATTCTCGACGACTTCTCCACCG > NC_002947/590573‑590871 | gccggccAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCt > 2:1714977/1‑150 (MQ=255) cGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGTC‑GCGTGCCTGGCGCGCTgg < 1:2093468‑M2/150‑3 (MQ=255) cGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTgg > 1:1646822‑M2/1‑148 (MQ=255) ggCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggc < 1:421407‑M2/150‑4 (MQ=255) ggCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggc > 2:179758‑M2/1‑147 (MQ=255) ccAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGTCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggctt > 2:851106‑M2/1‑145 (MQ=255) ccAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggctt < 2:1006972‑M2/150‑6 (MQ=255) ccAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggctt < 2:1377872‑M2/150‑6 (MQ=255) aaTACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGc < 1:1377872/150‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACctc > 1:807498/1‑150 (MQ=255) gCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACctc < 1:1374496/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACt < 2:807498/150‑1 (MQ=255) tGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTAATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTgg > 1:523476/1‑150 (MQ=255) ggCCGTTCCGGCCCACAGGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGa > 2:99286/1‑150 (MQ=255) cAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTc < 1:2234202/150‑1 (MQ=255) cAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGGGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTc > 1:2230881/1‑150 (MQ=255) aGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCt > 1:1797121/1‑150 (MQ=255) gCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTAc < 2:421407/150‑1 (MQ=255) 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ttCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGc > 1:2046905/1‑150 (MQ=255) gTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCAt > 2:1895469/1‑104 (MQ=255) gTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCAt < 1:1895469/104‑1 (MQ=255) gTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTa > 2:329690/1‑150 (MQ=255) tATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTAc < 1:2446152/150‑1 (MQ=255) aTCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACg > 1:2108963/1‑150 (MQ=255) tCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcatgg > 2:483784‑M2/1‑23 (MQ=255) tCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcatgg < 1:483784‑M2/110‑88 (MQ=255) aaGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCAt > 2:2398316/1‑150 (MQ=255) aGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCTGATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTTCCACCTGTGCTATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCAtt < 1:652995/150‑1 (MQ=255) aGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCAtt < 1:923449/150‑1 (MQ=255) gCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcat > 1:2278368‑M2/1‑19 (MQ=255) gCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcat < 2:2278368‑M2/104‑86 (MQ=255) gCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATtc < 2:327840/150‑1 (MQ=255) gCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATtc < 2:1340282/150‑1 (MQ=255) gttccTGGCGCGCTGGCCTGCCCACTACACTGGCCCGGTCTTACCGCGACGGCTGTCGCCCCCGTCCTTATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATTCTcgac < 2:982018/147‑1 (MQ=255) gCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATTCTcgacga > 2:1653350/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATtctc < 1:426692/143‑1 (MQ=255) cTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATtct < 2:1877699/142‑1 (MQ=255) cTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATtct > 1:1877699/1‑142 (MQ=255) tGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATTCTCGACGACtt > 1:1389119/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCTggcttgataccgaaggtatgaaggattttcttgcaggccagtaccgcgtgctgtggctcttcgctggcatccgggcgcgcggcatgggcctgcggcgtgggggcctgaacggccagctggcggtattggccggcctcggcga > 2:1564370‑M2/1‑8 (MQ=255) ggCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTCCCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCgttg < 2:1663292/111‑1 (MQ=255) ggCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCgttg > 1:1663292/1‑111 (MQ=255) cgcgcTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATTCTCGACGACTtctc < 1:2447112/150‑1 (MQ=255) tGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATTCTCGACGACTTCTCCAccg < 2:444134/150‑1 (MQ=255) | GCCGGCCAATACCGCCAGCTGGCCGTTCAGGCCCCCACGCCGCAGGCCCATGCCGCGCGCCCGGATGCCAGCGAAGAGCCACAGCACGCGGTACTGGCCTGCAAGAAAATCCTTCATACCTTCGGTATCAAGCC‑GCGTGCCTGGCGCGCTGGCTTGCCACCTCTACTGGACCGGTTCTACCGCCATGGCTGACGCCCCCATCCTGATCACCGGCGGTGCCGGCTTCATTGGCTCCCACCTGTGCGATGCGTTGTTGGACAAAGGCTACGCCGTACGCATTCTCGACGACTTCTCCACCG > NC_002947/590573‑590871 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |