New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1119638 = | 100 (1.070) | 11 (0.120) | 9/242 | NT | 10.5% | coding (626/1494 nt) | pepA | cytosol aminopeptidase |
? | NC_002947 | 1119667 = | 91 (1.010) | coding (597/1494 nt) | pepA | cytosol aminopeptidase |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CGGCCTTTTTGCCGCCCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGC > NC_002947/1119489‑1119787 | agccgcgcgcgctgaaaaaggtcaccctgctggccgacaaagccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccacccaa > 2:2259423‑M1/150‑150 (MQ=255) gccgcgcgcgctgaaaaaggtcaccctgctggccgacaaagccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccacccaAg < 2:1806600‑M1/2‑1 (MQ=255) tttttGCCGCCCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTcc > 2:2279839/1‑150 (MQ=255) ttttGCCGCCCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCt < 1:1822883/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCCCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTg < 2:1747589/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGAACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTgg < 1:1624650/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTGCTCGTCCAGCACTTCATCCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTgg < 2:1741827/150‑1 (MQ=255) gccgccCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGc < 2:1366395/150‑1 (MQ=255) gccgccCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCACCTTGCCCAGCTCCTTGGc < 2:2025388/150‑1 (MQ=255) gaaaaaggtcaccctgctggccgacaaagccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaatcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccaccccAGCTCACTGGCctc < 2:1316525‑M1/14‑2 (MQ=255) ccTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGtt < 2:2099218/150‑1 (MQ=255) aaTTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCa < 2:580628/150‑1 (MQ=255) aaTTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCa > 1:93430/1‑150 (MQ=255) 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1:1971652/131‑1 (MQ=255) ccTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCAt < 2:1859425/129‑1 (MQ=255) ccTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCAt > 1:1859425/1‑129 (MQ=255) ccTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCCGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACtt > 1:2342577/1‑150 (MQ=255) ccTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGACCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACtt > 1:2233208/1‑150 (MQ=255) ttGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCg > 1:1746786/1‑150 (MQ=255) ttGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCg < 1:1120618/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTg < 2:1746786/150‑1 (MQ=255) ccTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGc > 1:2089247/1‑150 (MQ=255) tgCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCt < 2:93430/150‑1 (MQ=255) tgCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCt < 2:139681/150‑1 (MQ=255) tttgccacccaAGCTACCTGGCC‑GAACAGGCCAAGGAGCTGGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCtt < 1:2063251‑M1/139‑1 (MQ=255) gcCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTg < 1:1501305/150‑1 (MQ=255) cTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTc > 2:249629/1‑150 (MQ=255) AGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCCGGTTGATGTGGTCGCGGGTGTTGAGCATTCTGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCcagc < 1:1485592‑M1/150‑1 (MQ=255) AGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCcagc < 2:1786317‑M1/150‑1 (MQ=255) | CGGCCTTTTTGCCGCCCTGGTAATTGAGCACGATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGC > NC_002947/1119489‑1119787 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |