New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1119638 = | 100 (1.070) | 11 (0.120) | 9/242 | NT | 10.5% | coding (626/1494 nt) | pepA | cytosol aminopeptidase |
? | NC_002947 | 1119667 = | 91 (1.010) | coding (597/1494 nt) | pepA | cytosol aminopeptidase |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTGACCTTTTTCAGCGCGCGCGGCT > NC_002947/1119520‑1119815 | gATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTgg > 2:1420502/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTggg > 2:610902/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTggg < 1:1359782/150‑1 (MQ=255) cgacaaagccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccaccccAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTg < 2:2063251‑M1/35‑1 (MQ=255) aagccggccaggccgaagtcgagcgtgcggtcaagcatgccagcgccatcgccagcggcatggccttcacccgcgacctcggcaacctgccgcccaacctttgccaccccagctccttggcctgttcggccaggtagctTGGGTGGCaaa < 1:2063251‑M2/11‑1 (MQ=255) ggcggcTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAgg > 2:2148334/1‑150 (MQ=255) gggcTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGtt < 2:1373400/149‑1 (MQ=255) cTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTggg < 1:333810/150‑1 (MQ=255) gCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGACTGAAC‑GATCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAg > 2:1380285/1‑150 (MQ=255) tGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAACGGTTGGGCGGCAGGt < 2:1001419/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGt > 1:441072/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGcc < 2:2309736/150‑1 (MQ=255) ggCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGa < 1:751492/150‑1 (MQ=255) ggCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGa < 1:455938/150‑1 (MQ=255) ccACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGt > 1:712860/1‑150 (MQ=255) gCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCgg < 2:739755/150‑1 (MQ=255) gCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCgg < 2:441072/150‑1 (MQ=255) aaCGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAg < 1:1420502/150‑1 (MQ=255) 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ccAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCca > 1:1153545/1‑150 (MQ=255) caagctacctggccgaacaggccaaggagctTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGAt > 2:484026‑M2/32‑94 (MQ=255) caagctacctggccgaacaggccaaggagctTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGAt < 1:484026‑M2/63‑1 (MQ=255) caagctacctggccgaacaggccaaggagctTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCca > 2:2067270‑M2/32‑150 (MQ=255) AGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCCGGTTGATGTGGTCGCGGGTGTTGAGCATTCTGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCcagc < 1:1485592‑M1/150‑1 (MQ=255) AGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCcagc < 2:1786317‑M1/150‑1 (MQ=255) gctacctggccgaacaggccaaggagctTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGAAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCcagca > 2:2169577‑M2/29‑150 (MQ=255) ctacctggccgaacaggccaaggagctTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCcagcag > 1:1015439‑M2/28‑150 (MQ=255) ctacctggccgaacaggccaaggagctTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGATTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCcagcag > 1:1316525‑M2/28‑150 (MQ=255) cTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTc < 1:1541827/114‑1 (MQ=255) cTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTc > 2:1541827/1‑114 (MQ=255) ttGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTg > 1:2354786/1‑150 (MQ=255) ccTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTGAcc < 2:1063998/149‑1 (MQ=255) ccTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTGAcc > 1:1063998/1‑149 (MQ=255) ccTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTGACCt > 1:576828/1‑150 (MQ=255) ccTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTGACCt > 2:1428296/1‑150 (MQ=255) cTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCgg < 1:1507230/58‑1 (MQ=255) cTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCgg > 2:1507230/1‑58 (MQ=255) cTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCCGCAGGGTGACCtt > 2:173647/1‑150 (MQ=255) cTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTGACCtt > 2:173660/1‑150 (MQ=255) cTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTGACCtt > 2:115683/1‑150 (MQ=255) tGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTGACCttt < 1:1362691/150‑1 (MQ=255) gTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGa < 2:2384985/96‑1 (MQ=255) gTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGa > 1:2384985/1‑96 (MQ=255) gaggccagtgagctGGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGATTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTGACCTTTTTc < 2:1316525‑M2/136‑1 (MQ=255) ccAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTGACCTTTTTCAgcg > 1:2102330/1‑150 (MQ=255) ctTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTGACCTTTTTCAGCGCGCGCGGc < 2:1806600‑M2/148‑1 (MQ=255) | GATCAGGCGTGGCGGCTGGTCGCTGCCCTGGCCCACGGCGTAGAACGCGCCCATGCCCAGGTCCTTGATCTTTTTCTCGTCCAGCACTTCAACCTTGAGGGCCTTGTGCGCCTTGCCCAGCTCCTTGGCCTGTTC‑GGCCAGGTAGCTTGGGTGGCAAAGGTTGGGCGGCAGGTTGCCGAGGTCGCGGGTGAAGGCCATGCCGCTGGCGATGGCGCTGGCATGCTTGACCGCACGCTCGACTTCGGCCTGGCCGGCTTTGTCGGCCAGCAGGGTGACCTTTTTCAGCGCGCGCGGCT > NC_002947/1119520‑1119815 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |