New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 3622266 | 86 (0.920) | 11 (0.130) | 11/226 | NT | 12.1% | intergenic (‑186/+40) | PP_3192/PP_3193 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3622288 | 82 (0.970) | intergenic (‑208/+18) | PP_3192/PP_3193 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TGGAGAATACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCC > NC_002947/3622122‑3622414 | tGGAGAATACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTcc < 2:838224/150‑1 (MQ=255) tGGAGAATACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTcc > 1:230009/1‑150 (MQ=255) aaTACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCaa < 2:425364/150‑1 (MQ=255) aTACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAAt < 1:2214295/150‑1 (MQ=255) tACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGCCCTGGCTATACCTGGACCCCCACAGCTGTGTTTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAAtt < 1:876573/150‑1 (MQ=255) tGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAAttgtt > 2:1584409/1‑150 (MQ=255) gggCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAAttgttg < 1:859655/150‑1 (MQ=255) ggCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGttccaccaacaattgg < 2:608813‑M1/149‑17 (MQ=255) ggCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtgg > 2:1467602/1‑150 (MQ=255) gCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtggt < 1:968438/150‑1 (MQ=255) gCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtggt < 1:1584409/150‑1 (MQ=255) cacaAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCTTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtggtg < 2:1949215/150‑1 (MQ=255) acaAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAAttgtt > 1:469415/1‑145 (MQ=255) acaAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAAttgtt < 2:469415/145‑1 (MQ=255) acaAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTtggtgg > 2:1063268/1‑150 (MQ=255) aaGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGaa < 2:1408885/150‑1 (MQ=255) aaGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGaa > 2:1826275/1‑150 (MQ=255) aCGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcag > 2:80168‑M2/1‑147 (MQ=255) 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cGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTg < 1:2060996/150‑1 (MQ=255) cGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTg < 2:230009/150‑1 (MQ=255) tCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTc < 1:1086508/150‑1 (MQ=255) cGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCa < 1:1253671/150‑1 (MQ=255) ggATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGttccaccaacaattggcggagccaggccaag > 2:1344450‑M1/1‑106 (MQ=255) ggATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGttccaccaacaattggcggagccaggccaag < 1:1344450‑M1/137‑32 (MQ=255) ggATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGc > 1:1914400/1‑108 (MQ=255) ggATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAgg < 1:1063268/150‑1 (MQ=255) ggATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAgg > 1:1195749/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAg > 2:634706/1‑150 (MQ=255) gCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCTCCGCt < 2:1108728/150‑1 (MQ=255) cGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CATCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAACAATAGGCTGGACAAGCCAAGTCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGcc > 1:2378938/1‑150 (MQ=255) gCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCg < 1:867203/150‑1 (MQ=255) cTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGa > 2:1711083/1‑150 (MQ=255) tCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGc < 2:1672316/88‑1 (MQ=255) tCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGc > 1:1672316/1‑88 (MQ=255) tCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggcc < 1:591087‑M2/109‑7 (MQ=255) 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cTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcc < 1:1344450‑M2/137‑107 (MQ=255) ttGGCCTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaaga < 2:397289‑M1/150‑143 (MQ=255) ggCCTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcga > 2:591087‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaa > 1:1643194‑M1/1‑5 (MQ=255) ccTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagatccg > 1:2278439‑M1/1‑4 (MQ=255) ccTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagatccg < 2:815473‑M2/150‑125 (MQ=255) cTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagatccgt > 1:1953888‑M1/1‑3 (MQ=255) cTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagatccgt > 2:80168‑M1/1‑3 (MQ=255) cTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagatccgt > 2:729440‑M1/1‑3 (MQ=255) cTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgac > 1:990973‑M1/1‑3 (MQ=255) cTGttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgac < 2:990973‑M1/87‑85 (MQ=255) cTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCACGGCGTTGGCGCAGGGGTGAGGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGcc > 2:868655/1‑150 (MQ=255) cTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGc < 1:1246737/109‑1 (MQ=255) tGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaat > 1:1090615‑M2/1‑24 (MQ=255) tGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaat < 2:1090615‑M2/94‑71 (MQ=255) tGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCa > 2:1824828/1‑111 (MQ=255) tGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGccc > 2:545179/1‑150 (MQ=255) gttccaccaacaattggcggagccaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgca < 1:445705‑M1/88‑88 (MQ=255) ggCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgc < 1:1742654‑M2/58‑36 (MQ=255) | TGGAGAATACTGGGCACAAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCC > NC_002947/3622122‑3622414 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |