New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 3622266 | 86 (0.920) | 11 (0.130) | 11/226 | NT | 12.1% | intergenic (‑186/+40) | PP_3192/PP_3193 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3622288 | 82 (0.970) | intergenic (‑208/+18) | PP_3192/PP_3193 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGACCTTCTGCATCGC > NC_002947/3622139‑3622436 | aaGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGaa > 2:1826275/1‑150 (MQ=255) aCGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcag > 1:1953888‑M2/1‑147 (MQ=255) aCGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcag > 2:729440‑M2/1‑147 (MQ=255) aCGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcag > 2:80168‑M2/1‑147 (MQ=255) cGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcagg > 1:2278439‑M2/1‑146 (MQ=255) tCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaa < 1:91012‑M2/150‑9 (MQ=255) tCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaa < 2:397289‑M2/150‑9 (MQ=255) gCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCAAGGCGCAACAGCAAC‑TTCGCCGATGCATACCCAGTGCTGTTTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGt < 1:1863405/150‑1 (MQ=255) ccGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGtt < 1:1653007/150‑1 (MQ=255) cGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTg < 2:230009/150‑1 (MQ=255) gggTCGGGATCAGGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCAATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTgg < 2:1553079/150‑1 (MQ=255) tCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTc < 1:1086508/150‑1 (MQ=255) cGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCa < 1:1253671/150‑1 (MQ=255) ggATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAgg > 1:1195749/1‑150 (MQ=255) ggATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAgg < 1:1063268/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGa < 2:1445715/150‑1 (MQ=255) gCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCTCCGCt < 2:1108728/150‑1 (MQ=255) gAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGt > 2:604083/1‑150 (MQ=255) 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tGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCa > 2:1824828/1‑111 (MQ=255) tGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGccc > 2:545179/1‑150 (MQ=255) ggCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgc > 2:1742654‑M2/1‑23 (MQ=255) ggCTCCGCCAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgc < 1:1742654‑M2/58‑36 (MQ=255) tCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGACGATGGCGCCcagca < 2:1616049/150‑1 (MQ=255) ccGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCcagcag < 2:2260418/150‑1 (MQ=255) ccGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCcagcag < 2:2254432/150‑1 (MQ=255) gCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACg > 1:174170/1‑131 (MQ=255) gCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGc > 1:1013140/1‑150 (MQ=255) gCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGc > 2:76221/1‑150 (MQ=255) ccAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagatccgtcttgtgcc < 2:608813‑M2/149‑134 (MQ=255) ccAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagatccgtcttgtgcc > 1:608813‑M2/1‑16 (MQ=255) ccAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCg > 2:1784705/1‑150 (MQ=255) ttgGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGACCTTCt > 1:1516353/1‑150 (MQ=255) tggtggAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGACCTTCTg < 1:2165424/150‑1 (MQ=255) gtggAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATg < 2:2096706/126‑1 (MQ=255) gtggAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATg > 1:2096706/1‑126 (MQ=255) gtggAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGACCTTCTGCa > 2:52717/1‑150 (MQ=255) ggAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGCTGGCGCCCAGCAGGCGACCTTCTGCATc < 1:1519840/150‑1 (MQ=255) aaCAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGACCTTCTGCATcgc > 2:1306375/1‑150 (MQ=255) aaCAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGACCTTCTGCATcgc > 2:920696/1‑150 (MQ=255) | AAGACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGA‑CCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGCCAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGACCTTCTGCATCGC > NC_002947/3622139‑3622436 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |