| New junction evidence | |||||||||||
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CGGTTGCGCCAATGTCGAAGTGCAAGGCGCCGAAGCCAGGCAACTGGGCCTGGCCGCTGGCCGGTTTCTGCGTATCCGCGTTGAAGACACCGGCATGGGCATGTCCAAAGCAGTGATGCAGCGCGCCCTTGAGCCCTTCTTCACCACCAAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGAAAGCATCGCCGCCGC > NC_002947/4018539‑4018835 | cGGTTGCGCCAATGTCGAAGTGCAAGGCGCCGAAGCCAGGCAACTGGGCCTGGCCGCTGGCCGGTTTCTGCGTATCCGCGTTGAAGACACCGGCATGGGCATGTCCAAAGCAGTGATGCAGCGCGCCCTTGAGCCCTTCTTCACCACCaa < 2:1780787/150‑1 (MQ=255) gcCAATGTCGAAGTGCAAGGCGCCGAAGCCAGGCAACTGGGCCTGGCCTCTGGCCGGTTTCTGCGTATCCGCGTTGAAGACACCGGCATGGGCATGTCCAAACCAGTGATGCAGCGCGCCCTTGAGCCCTTCTTCACCACCAAGCCGCTc > 1:1759081/1‑150 (MQ=255) ccAATGTCGAAGTGCAAGGCGCCGAAGCCAGGCAACTGTGCCTGGCCGCTGGCCGGTTTCTGCGTCGGTGGTGGGAAGACACCGGCATGGGCATGTCCAAAGCAGTGATGCAGCGCGCCCTTGAGCCCTTCTTCACCACCAAGCCGCTCg < 1:1001965/150‑1 (MQ=255) cAATGTCGAAGTGCAAGGCGCCGAAGCCAGGCAACTGGGTCTGGCCGCTGGCCGGTTTCTGCGTATCCGCGTTGAAGACACCGGCATGGGCATGTCCAAAGCAGTGATGCAGCGCGCCCTTGAGCCCTTCTTCACCACCAAGCCGCTCgg > 2:2322667/1‑150 (MQ=255) aaTGTCGAAGTGCAAGGCGCCGAAGCCAGGCAACTGGGCCTGGCCGCTGGCCGGTTTCTGCGTATCCGCGTTGAAGACACCGGCATGGGCATGTCCAAAGCAGTGATGCAGCGCGCCCTTGAGCCCTTCTTCACCACCAAGCCGCTCGGc > 2:873322/1‑150 (MQ=255) tCGAAGTGCAAGGCGCCGAAGCCAGGCAACTGGGCCTGGCCGCTGGCCGGTTTCTGCGTATCCGCGTTGAAGACACCGGCATGGGCATGTCCAAAGCAGTGATGCAGCGCGCCCTTGAGCCCTTCTTCACCACCAAGCCGCTCGGCCAgg < 2:1689446/150‑1 (MQ=255) tCGAAGTGCAAGGCGCCGAAGCCAGGCAACTGGGCCTGGCCGCTGGCCGGTTTCTGCGTATCCGCGTTGAAGACACCGGCATGGGCATGTCCAAAGCAGTGATGCAGCGCGCCCTTGAGCCCTTCTTCACCACCAAGCCGCTCGGCCAgg > 1:2392245/1‑150 (MQ=255) gAAGTGCAAGGCGCCGAAGCCAGGCAACTGGGCCTGGCCGCTGGCCGGTTTCTGCGTATCCGCGTTGAAGACACCGGCATGGGCATGTCCAAAGCAGTGATGCAGCGCGCCCTTGAGCCCTTCTTCACCACCAAGCCGCTCGGCCAGGGc > 1:628572/1‑150 (MQ=255) 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ttcttcACCACCAAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGAAAGc < 1:1346156/150‑1 (MQ=255) ttcttcACCACCAAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGAAAGc > 2:2446081/1‑150 (MQ=255) cttcACCACCAAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGAAAGCAt < 2:2392245/150‑1 (MQ=255) cttcACCACCAAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGAAAGCAt < 1:376230/150‑1 (MQ=255) ttcACCACCAAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGAAAGCATc < 1:1798213/150‑1 (MQ=255) ttcACCACCAAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGAAAGCATc < 1:2431992/150‑1 (MQ=255) caccacCAAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGaa < 1:1893515/142‑1 (MQ=255) caccacCAAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGaa > 2:1893515/1‑142 (MQ=255) accaccAAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGAAAGCATcgcc < 2:1486762/150‑1 (MQ=255) accaccAAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGAAAGCATcgcc > 1:2244867/1‑150 (MQ=255) caccaAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTgg > 1:1804769/1‑80 (MQ=255) caccaAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTgg < 2:1804769/80‑1 (MQ=255) accaAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGAAAGCATcgccgcc > 1:773886/1‑150 (MQ=255) caAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGAAAGCATcgccgccgc > 1:622715/1‑150 (MQ=255) | CGGTTGCGCCAATGTCGAAGTGCAAGGCGCCGAAGCCAGGCAACTGGGCCTGGCCGCTGGCCGGTTTCTGCGTATCCGCGTTGAAGACACCGGCATGGGCATGTCCAAAGCAGTGATGCAGCGCGCCCTTGAGCCCTTCTTCACCACCAAGCCGCTCGGCCAGGGCACTGGCCTTGGGCTGTCCATGGTCTACGGCTTTGTGCGGCAATCCGGTGGCCAGCTGGTCATCGATAGCACGCTTGGCCAGGGTACGGCCATCAACCTGTATCTCCCCTGCGATGAAAGCATCGCCGCCGC > NC_002947/4018539‑4018835 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |