| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 4819050 | 90 (1.010) | coding (12185/12954 nt) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CGATGCGATAGCCGCGAATCTTCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGC > NC_002947/4818880‑4819176 | cGATGCGATAGCCGCGAAAAACCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTgc < 1:1944878/150‑1 (MQ=255) gATGCGATAGCCGCGAATCTTCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTgcg > 1:2298779/1‑150 (MQ=255) tGCGATAGCCGCGAATCTTCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCa > 2:694188/1‑150 (MQ=255) tGCGATAGCCGCGAATCTTCACCTGATGGTCGATGCGCACGACGTACTCCAGCACACCGGCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCa > 2:868826/1‑150 (MQ=255) gATAGCCGCGAATCTTCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCg > 1:1188131/1‑150 (MQ=255) aTAGCCGCGAATCTTCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCgg < 1:460292/150‑1 (MQ=255) aTAGCCGCGAATCTTCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCgg < 2:1736227/150‑1 (MQ=255) aTAGCCGCGAATCTTCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCgg < 1:1811851/150‑1 (MQ=255) 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gcgAATCTTCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCAcc > 2:1361207/1‑150 (MQ=255) aaTCTTCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGAc > 2:134683/1‑150 (MQ=255) ttCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAg > 1:1532987/1‑150 (MQ=255) tCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGc > 1:553811/1‑150 (MQ=255) tCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCAGGACACGGCTCTTTGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGc < 2:1637978/150‑1 (MQ=255) 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aGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAgg > 1:1551677/1‑150 (MQ=255) gTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCcacggcactggcgttcattcctcacccttacggggcaccgggagagcgcctgtaccgtaccggtgacctcgcacggcagcgcctggacggtgtgctggagtacgtcgggcgcatcgacca < 1:2288692‑M2/150‑121 (MQ=255) gCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCcacggcactggcgttcattcctcacccttacggggcaccgggagagcgcctgtaccgtaccggtgacctcgcacggcagcgcctggacggtgtgctggagtacgtcgggcgcatcga > 1:1101524‑M2/1‑28 (MQ=255) ccGTGgctacgtcggtgacccggtgcgcacggcactggcgttcattcctcacccttacggggcaccgggagagcgcctgtaccgtaccggtgacctcgcacggcagcgcctggacggtgtgctggagtacgtcgggcgcatcgaccatca > 1:753044‑M1/1‑5 (MQ=255) cGTGgctacgtcggtgacccggtgcgcacggcactggcgttcattcctcacccttacggggcaccgggagagcgcctgtaccgtaccggtgacctcgcacggcagcgcctggacggtgtgctggagtacgtcgggcgcatcgaccatcag < 1:1884993‑M1/150‑147 (MQ=255) cGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCt < 1:132874/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGCGGGGCAGCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGc < 2:1195156/150‑1 (MQ=255) tGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGCACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGc > 1:207394/1‑150 (MQ=255) | CGATGCGATAGCCGCGAATCTTCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGC > NC_002947/4818880‑4819176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |