| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 4819050 | 90 (1.010) | coding (12185/12954 nt) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCG > NC_002947/4818901‑4819196 | tCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCAGGACACGGCTCTTTGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGc < 2:1637978/150‑1 (MQ=255) cTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCcacg < 1:1884993‑M2/150‑5 (MQ=255) tGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCcacgg > 1:753044‑M2/1‑145 (MQ=255) 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gATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTAcacc < 2:294559/150‑1 (MQ=255) tGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTAcacccg > 1:2076162/1‑150 (MQ=255) gcCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGAGATCGCGGCCTAcacccgcac > 1:722030/1‑150 (MQ=255) cGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCACCGTACGGGCGACGAGAGCGGAAGAGCGTCGTGCAGGGCAAGAGAGCGACGGAGCCACGGCCTAcacccgcacccg > 2:1105558/1‑150 (MQ=255) tACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAACGATGATTTCTGCACGCCAGTGCCGTTCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACg > 1:1861256/1‑150 (MQ=255) cTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGca > 1:2139193/1‑150 (MQ=255) tCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCATCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGATGAGGAATAAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCActccc > 1:437712/1‑146 (MQ=255) tCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACGGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGcac > 1:623932/1‑150 (MQ=255) tCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGcac > 1:394491/1‑150 (MQ=255) cAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACaa > 1:376080/1‑150 (MQ=255) 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gCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCcacggcactggcgttcattcctcacccttacggggcaccgggagagcgcctgtaccgtaccggtgacctcgcacggcagcgcctggacggtgtgctggagtacgtcgggcgcatcga > 1:1101524‑M2/1‑28 (MQ=255) cGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCt < 1:132874/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGCGGGGCAGCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGc < 2:1195156/150‑1 (MQ=255) tGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGCACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGc > 1:207394/1‑150 (MQ=255) aCCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTgg > 1:1877889/1‑150 (MQ=255) aCCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTgg < 1:2243837/150‑1 (MQ=255) aCCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTgg > 1:251973/1‑150 (MQ=255) ccGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTggg < 2:1551677/150‑1 (MQ=255) cGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCGTggtg < 2:1731714/150‑3 (MQ=255) gTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGa < 1:2144333/150‑1 (MQ=255) aCCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTa < 2:937239/132‑1 (MQ=255) aCCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTa > 1:937239/1‑132 (MQ=255) cGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAggcgg > 1:249722/1‑150 (MQ=255) cttAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCAt < 2:2298779/148‑1 (MQ=255) cGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTGGCTGCGTTGGGTCGAGTCGGCAt < 2:394491/150‑1 (MQ=255) tAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCTGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGGGGCGGCATCg > 1:156548/1‑150 (MQ=255) tAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCg > 2:212292/1‑150 (MQ=255) | TCACCTGATGGTCGATGCGCCCGACGTACTCCAGCACACCGTCCAGGCGCTGCCGTGCGAGGTCACCGGTACGGTACAGGCGCTCTCCCGGTGCCCCGTAAGGGTGAGGAATGAACGCCAGTGCCGTGCGCACCGGGTCACCGACGTAGCCACGGCCTACACCCGCACCCGCCACGCACAACTCGCCCACCGCCCCCAGCGGCACCAGCGCCTGGTCCTCGCCGAACAGGTACAGGCGGTTGTTATCGGTTGGCGTGCCGATTGGCAGGTAGCTGCCTTGGGTCGAGGCGGCATCG > NC_002947/4818901‑4819196 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |