New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 275497 = | 51 (1.180) | 3 (0.070) | 3/244 | NT | 5.6% | coding (451/1386 nt) | PP_0222 | DszA family monooxygenase |
? | NC_002947 | 275525 = | 52 (1.250) | coding (423/1386 nt) | PP_0222 | DszA family monooxygenase |
GCATAGACGCGATGCTCGCGGTCGGCGACCACTGCGTCATCGGCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTGGCGGTAAGGCCGAAACCCAGGTGACGG > NC_002947/275376‑275660 | gCATAGACGCGATGCTCGCGGTCGGCGACCACTGCGTCATCGGCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAgcg > 1:897043/1‑150 (MQ=255) aTAGACGCGATGCTCGCGGTCGGCGACCACTGCGTCATCGGCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCt > 1:221146/1‑150 (MQ=255) gACGCGATGCTCGCGGTCGGCGACCACTGCGTCATCGGCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGCACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTc < 1:639586/150‑1 (MQ=255) cgcgATGCTCGCGGTCGGCGACCACTGCGTCATCGGCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGa < 2:221146/150‑1 (MQ=255) cgcgATGCTCGCGGTCGGCGACCACTGCGTCATCGGCCCAGCTGCCT‑ACCAGGAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGa < 1:618190/150‑1 (MQ=255) gATGCTCGCGGTCGGCGACCACTGCGTCATCGCGTACGCTACGTCTGCTTCCAGTT‑TACAACACCTGCAGATGGTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCCCTGTCGAggc > 1:193438/1‑149 (MQ=255) accgccaacctcacctacgaggcgccgtacctgttcgcccggcgcctttccacactcgaccacctgagcaatggccgggtgggctggaacattgtcaccggctacctcgacagcgctgcgccaggcccatggcccgggcagcGCTGTCGa < 2:522086‑M2/8‑1 (MQ=255) aTGCTCGCGGTCGGCGACCACTGCGTCATCGGCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTa > 2:975313/1‑150 (MQ=255) tCGCGGTCGGCGACCACTGCGTCATCGGCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCg > 2:338599/1‑150 (MQ=255) cgGTCGGCGACCACTGCGTCATCGGCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTg < 2:637092/150‑1 (MQ=255) ggTCGGCGACCACTGCGTCATCGGCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCCGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGa < 1:1045171/150‑1 (MQ=255) cGACCACTGCGTCATCGGCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGt < 2:451579/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTCCCGCCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCa > 1:192390/1‑150 (MQ=255) gCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGACCGGGTTGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCa > 1:869175/1‑150 (MQ=255) ccAGCTACCT‑TCCAGCATCTTCTACAACACCTGCAGTTATTCATCCTCCTGGTCGTATCGGCCATCATGCTCCTGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGTTAACCGGTTACAATGTGCCAGCCCACCCGGCCAtt < 1:543430/150‑1 (MQ=255) cAGCTGCCT‑TCCCGAAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTg < 1:499946/150‑1 (MQ=255) t‑tCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAggtg > 1:196665/1‑150 (MQ=255) ttGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGtgtg < 2:995187/150‑1 (MQ=255) tACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGaa > 2:1109753/1‑150 (MQ=255) acaacaCCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGaaa < 2:666598/150‑1 (MQ=255) acaacaCCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGaaa < 1:1073306/150‑1 (MQ=255) aacaCCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGa < 2:183701/88‑1 (MQ=255) aacaCCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGa > 1:183701/1‑88 (MQ=255) acCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGAGTGGAAAGgcgc > 2:935784/1‑150 (MQ=255) tGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGt > 1:167028/1‑92 (MQ=255) tGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGt < 2:167028/92‑1 (MQ=255) cAGGTATTCATCGGCCTGGTCGGAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCA‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGc < 2:136248/150‑1 (MQ=255) tATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGtgtg > 2:417763/1‑132 (MQ=255) tATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGtgtg < 1:417763/132‑1 (MQ=255) cATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCTGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGt < 1:113712/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTa > 2:842516/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGGAGCCGATGACAATGTTCATGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGGGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTa > 1:685490/1‑150 (MQ=38) tCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTCGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAGGGCTCCTGGCGAACAGGTAc > 2:527054/1‑150 (MQ=255) tCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTAc > 1:513597/1‑150 (MQ=255) gTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGGACAGGTACGGCGCCTc < 1:975313/150‑1 (MQ=255) cGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCgg < 2:1098818/92‑1 (MQ=255) cGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCgg > 1:1098818/1‑92 (MQ=255) tCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTg > 2:500048/1‑150 (MQ=255) aTGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTa > 2:1111637/1‑138 (MQ=255) aTGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTa < 1:1111637/138‑1 (MQ=255) tGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTGGCg < 1:500048/150‑1 (MQ=255) tcgacagcGCTGC‑CCGGGCC‑ATGGGCCTGGCGCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTGGCGGt < 2:522086‑M1/142‑1 (MQ=255) cTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGc < 2:966490/68‑1 (MQ=255) cTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGc > 1:966490/1‑68 (MQ=255) tCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTGGCGGTa > 2:59315/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTGGCGGTaa < 1:842516/150‑1 (MQ=255) ggTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTGGCGGTAAgg < 2:212586/150‑1 (MQ=255) cccgggccatgggcctggcgcagcGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTg > 1:105691‑M2/25‑70 (MQ=255) cccgggccatgggcctggcgcagcGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTg < 2:105691‑M2/46‑1 (MQ=255) ccAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTGGCGGTAAGGCCGAAACCCa < 1:59315/150‑1 (MQ=255) cAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTGGCGGTAAGGCCGAAACCCAg < 1:1109753/150‑1 (MQ=255) aGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAg > 1:337181/1‑104 (MQ=255) aGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTGGCGGTAAGGCCGAAACCCAgg > 2:706805/1‑150 (MQ=255) aGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGCCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAg < 2:337181/104‑1 (MQ=255) ggCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTGGCGGTAAGGCCGAAACCCAGGt < 2:192390/150‑1 (MQ=255) ccATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGc > 1:110408/1‑94 (MQ=255) ccATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGc < 2:110408/94‑1 (MQ=255) aTGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTGGCGGTAAGGCCGAAACCCAGGTGACgg < 1:935784/150‑1 (MQ=255) | GCATAGACGCGATGCTCGCGGTCGGCGACCACTGCGTCATCGGCCCAGCTGCCT‑TCCAGCAGCTTGTACAACACCTGCAGGTATTCATCGGCCTGGTCGTAGCGGCGATCATGCTCCGGTTGCTGCGCCAGGCCCATGGCCC‑GG‑GCAGCGCTGTCGAGGTAGCCGGTGACAATGTTCCAGCCCACCCGGCCATTGCTCAGGTGGTCGAGTGTGGAAAGGCGCCGGGCGAACAGGTACGGCGCCTCGTAGGTGAGGTTGGCGGTAAGGCCGAAACCCAGGTGACGG > NC_002947/275376‑275660 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |