New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 728969 | 55 (1.050) | 6 (0.120) | 6/234 | NT | 10.2% | coding (455/963 nt) | rluD | 23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase |
? | NC_002947 | = 728995 | 53 (1.060) | coding (481/963 nt) | rluD | 23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase |
TGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGCCAGCGCATGGCTGTAACCG > NC_002947/728820‑729118 | tgtgCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCA < 2:1026152‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCCACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAg > 2:160527/1‑150 (MQ=255) ccGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAg > 2:918647/1‑150 (MQ=255) gggCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTg < 1:358071/150‑1 (MQ=255) gggCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTg < 2:1163483/150‑1 (MQ=255) ggCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTgg > 1:1127443/1‑150 (MQ=255) cATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTc < 2:1186164/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAtctgctcgaccagcttggtctg > 2:1333309‑M1/1‑128 (MQ=255) gCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAg < 1:203450/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGc > 2:1177538/1‑150 (MQ=255) cGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGAt > 1:160527‑M2/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGAtgcag > 1:945518‑M2/1‑145 (MQ=255) cccTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTACCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGAtgcagg < 1:604892‑M2/150‑7 (MQ=255) tGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAtctgctcgaccagcttggtctgcgcctgcagggtc < 1:1333309‑M1/150‑36 (MQ=255) aaCGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑CTGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAg > 2:966133/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAg > 1:1345693/1‑150 (MQ=255) aTGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACg > 2:286450/1‑150 (MQ=255) tgtgCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGa < 1:918647/150‑1 (MQ=255) ccAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAtctgctcgaccagcttggtctgcgcctgcagggtctt > 1:1172145‑M1/1‑89 (MQ=255) ccAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAtctgctcgaccagcttggtctgcgcctgcagggtctt < 2:1172145‑M1/126‑38 (MQ=255) ccAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAg > 1:24471/1‑129 (MQ=255) ccAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAg < 2:24471/129‑1 (MQ=255) ccAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGc > 1:534745/1‑150 (MQ=255) gTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGAtt < 1:286450/150‑1 (MQ=255) gTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGAtt > 1:786238/1‑150 (MQ=255) ctCAACGTGCCGCCCGTCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACAAGCCTGCCCGGCCGAGACCGTG‑GCCTTCAGGCGCAGATTAATCTGCCCGAGCAGATCGCGAAGTGGAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGAtt < 1:1033526/149‑1 (MQ=255) aaCGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGc > 2:942203/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCgtg < 2:1345693/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCgtgg < 1:914037/150‑1 (MQ=255) gCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCCCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCgtggt < 2:692548/150‑1 (MQ=255) cgcgcgCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGa < 1:180224/150‑1 (MQ=255) gcgcCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCACGCCAGACCAGCCACATCTACTAGTTCATCGTGATTGGCGTGGTGACTg > 1:1384465/1‑150 (MQ=255) ccGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCg < 2:786238/150‑1 (MQ=255) ccGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCg < 2:31032/150‑1 (MQ=255) gTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTg < 1:942203/150‑1 (MQ=255) gTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTg < 2:225510/150‑1 (MQ=255) gTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTg < 2:1265214/150‑1 (MQ=255) tCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCa > 2:261032/1‑150 (MQ=255) gggCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCaa < 2:1030368/147‑1 (MQ=255) gTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCaa > 1:1030368/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAg > 1:689395/1‑65 (MQ=255) aCCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAg < 2:689395/65‑1 (MQ=255) aCCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCg > 2:554256/1‑150 (MQ=255) cGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCgtg < 2:294022/126‑1 (MQ=255) cGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCgtg > 1:294022/1‑126 (MQ=255) ccTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGAcgc < 1:722886/150‑1 (MQ=255) tGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAg < 1:33297/86‑1 (MQ=255) tGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAg > 2:33297/1‑86 (MQ=255) tGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACgcgc > 1:1039060/1‑150 (MQ=255) ggACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCgtggt > 1:457384/1‑117 (MQ=255) ggACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCgtggt < 2:457384/117‑1 (MQ=255) acacCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGgcc < 2:1039060/150‑1 (MQ=255) acacCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGgcc < 1:554256/150‑1 (MQ=255) caccGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCa > 1:1299288/1‑150 (MQ=255) g‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGTTTCTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCAt < 1:13563/150‑1 (MQ=255) g‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGt < 1:1061348/112‑1 (MQ=255) g‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGt > 2:1061348/1‑112 (MQ=255) tggtggtggCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATgc > 1:150319/1‑150 (MQ=255) gtggtggCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGGGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATgcgc > 1:1348741/1‑150 (MQ=255) tggtggCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGcc < 1:966133/150‑1 (MQ=255) ccAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGCCAGCGCa > 2:898588/1‑150 (MQ=255) cAAGACCCTGCAtctgctcgaccagcttggtctgcgcctgcagggtcttg > 2:1196706‑M1/1‑12 (MQ=255) cAAGACCCTGCAtctgctcgaccagcttggtctgcgcctgcagggtcttg < 1:1196706‑M1/50‑39 (MQ=255) cAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGAtgcagggtcttg > 2:1196706‑M2/1‑38 (MQ=255) cAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGAtgcagggtcttg < 1:1196706‑M2/50‑13 (MQ=255) aaGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGAtgcagggtcttggccaccaccatcaggccggtggtgtccttgtccaggcggtgcacgataccggcgcgcggcacgttgacgatgtctgg > 1:1172145‑M2/1‑37 (MQ=255) aaGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGAtgcagggtcttggccaccaccatcaggccggtggtgtccttgtccaggcggtgcacgataccggcgcgcggcacgttgacgatgtctgg < 2:1172145‑M2/126‑90 (MQ=255) gACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGAtgcagggtcttggccaccaccatcaggccggtggtgtccttgtccaggcggtgcacgataccggcgcgcggcacgttgacgatgtctggcacatggtgcagcagcgcgttgagca < 1:1333309‑M2/150‑116 (MQ=255) gACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTg > 1:692982/1‑98 (MQ=255) gACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTg < 2:692982/98‑1 (MQ=255) ccTGCAtctgctcgaccagcttggtctgcgcctgcagggtcttggccaccaccatcaggccggtggtgtccttgtccaggcggtgcacgataccggcgcgcggcacgttgacgatgtctggtacatggtgcagcagcgcgttgagcaggg < 1:604892‑M1/150‑145 (MQ=255) cTGCAtctgctcgaccagcttggtctgcgcctgcagggtcttggccaccaccatcaggccggtggtgtccttgtccaggcggtgcacgataccggcgcgcggcacgttgacgatgtctggcacatggtgcagcagcgcgttgagcagggt > 1:945518‑M1/1‑5 (MQ=255) atctgctcgaccagcttggtctgcgcctgcagggtcttggccaccaccatcaggccggtggtgtccttgtccaggcggtgcacgataccggcgcgcggcacgttgacgatgtctggcacatggtgcagcagcgcgttgagcagggtgccg > 1:160527‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTG‑ATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGCCAGCGCATGGCTGTAACCG > NC_002947/728820‑729118 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |