| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1717406 | 51 (0.970) | 7 (0.140) | 7/234 | NT | 11.2% | coding (63/777 nt) | rsmJ | ribosomal RNA small subunit methyltransferase J |
| ? | NC_002947 | = 1717427 | 63 (1.260) | coding (84/777 nt) | rsmJ | ribosomal RNA small subunit methyltransferase J | |||||
TGGCAGAATAGCGGGATATTGCCTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCGTGTGGACTTCGTCGAAGGTCAGGCTGC > NC_002947/1717262‑1717555 | tgtcAGAATAGCGGGATATTGCCTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGc < 1:815775/147‑1 (MQ=255)tGGCAGAATAGCGGGATATTGCCTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGAGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGc > 1:1064393/1‑150 (MQ=255) gCAGAATAGCGGGATATTGCCTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGt > 1:43505/1‑150 (MQ=255) aGAATAGCGGGATATTGCCTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTgg < 2:43505/150‑1 (MQ=255) atatTGCCTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCt > 2:573437/1‑150 (MQ=255) aTTGCCTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGg > 1:872552‑M2/1‑149 (MQ=255) ttGCCTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCcaggcgttcagcccacgccctgg > 1:1099981‑M1/1‑127 (MQ=255) ccTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCcaggcgttcagcccacgccctggcct < 2:1099981‑M1/150‑27 (MQ=255) ccTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGggcct < 2:1279672‑M2/150‑6 (MQ=255) cTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGggcctg < 1:576879‑M2/150‑7 (MQ=255) cTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGggcctg < 1:127632‑M2/150‑7 (MQ=255) tGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTTGTGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATa > 2:879814/1‑150 (MQ=255) tGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCCAGGCGTTCAGCCCA‑CGCCCTggcctgttgcgcatactcagct > 2:751191‑M2/1‑128 (MQ=255) ccGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCGGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATAcc > 2:1096417/1‑150 (MQ=255) cGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCCAGGCGTTCAGCCCA‑CGCCCTggcctgttgcgcatactcagctgtc < 2:876517‑M2/150‑26 (MQ=255) cGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATAccg > 2:168328/1‑150 (MQ=255) cATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCCAGGCGTTCAGCCCA‑CGCCCTggcctgttgcgcatactcagctgtcatcgc > 1:876517‑M2/1‑120 (MQ=255) aGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTcgc > 1:842170/1‑150 (MQ=255) cTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTg < 1:23389/150‑1 (MQ=255) ttGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGc > 1:294535/1‑150 (MQ=255) tGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCa < 1:573437/150‑1 (MQ=255) tttGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGt > 1:1382223/1‑150 (MQ=255) tttGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGt > 1:1313742/1‑150 (MQ=255) tGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGtag > 2:1071357/1‑148 (MQ=255) tGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTgg < 1:993243/150‑1 (MQ=255) ttCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCg > 1:1164709/1‑150 (MQ=255) ggTGTGAACGATGGGAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGC‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACgg < 2:576879/150‑1 (MQ=255) gtgAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCtt > 1:1043210/1‑150 (MQ=255) tgAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGggcctgttgcgcatactcag < 1:1007805‑M2/110‑21 (MQ=255) tgAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGggcctgttgcgcatactcag > 2:1007805‑M2/1‑90 (MQ=255) aaCGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCa > 1:1025817/1‑150 (MQ=255) gATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCGGGGCCTGCCGCTGCAGGCCGATAACGCCGCCCTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCGGAt > 1:1384578/1‑150 (MQ=255) aaGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTgg > 2:1195862/1‑150 (MQ=255) ggCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGc < 2:1185626/150‑1 (MQ=255) gCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGc < 2:908499/128‑1 (MQ=255) gCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGc > 1:908499/1‑128 (MQ=255) aCGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCg > 1:663578/1‑150 (MQ=255) aCGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCg > 2:856828/1‑150 (MQ=255) gTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAgg > 1:122562/1‑150 (MQ=255) gggTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTgg < 2:378284/135‑1 (MQ=255) gggTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTgg > 1:378284/1‑135 (MQ=255) tCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGACCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGc > 1:629980/1‑150 (MQ=255) gAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGAtt < 1:238813/120‑1 (MQ=255) gAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGAtt > 2:238813/1‑120 (MQ=255) gCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCagggcgtgggctgaacgcctgggcctgttgcgcatactcagctgtcatcgcctcgaccctgatacccgtgccttgctcttccatcgttcacacccgaaaaatcaaaccaagcccttaatg > 1:876517‑M1/1‑30 (MQ=255) cGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGc < 1:516513/150‑1 (MQ=255) gATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCg > 2:641478/1‑150 (MQ=255) gATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCg > 2:1350504/1‑150 (MQ=255) tGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCgtg < 2:1382223/150‑1 (MQ=255) gACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCagggcgtgggctgaacgcctgggcctgttgcgcatactcagctgtcatcgcctcgaccctgatacccgtgccttgctcttccatcgttcacacccgaaaaatcaaaccaagcccttaatgaatcg < 2:876517‑M1/150‑126 (MQ=255) aGCTGAGTATGCGCAACAGGCCagggcgtgggctgaacgcctgggcctgttgcgcatactcagctgtcatcgcctcgaccctgatacccgtgccttgctcttccatcgttcacacccgaaaaatcaaaccaagcccttaatgaatcggca > 2:751191‑M1/1‑22 (MQ=255) aGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCgtgt < 1:1235358/147‑1 (MQ=255) aGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCgtgt > 2:1235380/1‑147 (MQ=255) aGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCgtgt < 1:1235380/147‑1 (MQ=255) aGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCgtgt > 2:1235358/1‑147 (MQ=255) cTGAGTATGCGCAACAGGCCcaggcgttcagcccacgccctggcctgttgcgcatactcagctgtcatcgcctcgaccctgatacccgtgccttgctcttccatcgttca > 2:1007805‑M1/1‑20 (MQ=255) cTGAGTATGCGCAACAGGCCcaggcgttcagcccacgccctggcctgttgcgcatactcagctgtcatcgcctcgaccctgatacccgtgccttgctcttccatcgttca < 1:1007805‑M1/110‑91 (MQ=255) tGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCGTGTGGACtt > 1:631903/1‑150 (MQ=255) aGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCGTGGGCCGGTTCGTGTGGACTtcg > 2:708367/1‑150 (MQ=255) aGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCGTGTGGACTtcg < 2:294535/150‑1 (MQ=255) tATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCGTGTGGACTtcgtc > 2:627630/1‑150 (MQ=255) gcgcAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGc < 1:1074915/111‑1 (MQ=255) gcgcAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGc > 2:1074915/1‑111 (MQ=255) gcgcAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTg > 1:581859/1‑124 (MQ=255) gcgcAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTg < 2:581859/124‑1 (MQ=255) gcgcAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCGTGTGGACTTCGTCGaa < 2:127632/150‑1 (MQ=255) gcgcAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCCACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCGTGTGGACTTCGTCGaa < 2:1022239/150‑1 (MQ=255) aaCAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCGTGTGGACTTCGTCGAAGGTc > 1:871450/1‑150 (MQ=255) aCAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCGTGTGGACTTCGTCGAAGGTCa > 2:791458/1‑150 (MQ=255) cAGGCCcaggcgttcagcccacgccctggcctgttgcgcatactcagctgtcatcgcctcgaccctgatacccgtgccttgctcttccatcgttcacacccgaaaaatcaaaccaagcccttaatgaatcggcagccacggccgatacag < 1:127632‑M1/150‑145 (MQ=255) cAGGCCcaggcgttcagcccacgccctggcctgttgcgcatactcagctgtcatcgcctcgaccctgatacccgtgccttgctcttccatcgttcacacccgaaaaatcaaaccaagcccttaatgaatcggcagccacggccgatacag < 1:576879‑M1/150‑145 (MQ=255) aGGCCcaggcgttcagcccacgccctggcctgttgcgcatactcagctgtcatcgcctcgaccctgatacccgtgccttgctcttccatcgttcacacccgaaaaatcaaaccaagcccttaatgaatcggcagccacggccgatacagg < 2:1279672‑M1/150‑146 (MQ=255) aGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGggcctgttgcgcatactcagctgtcatcgcctcgaccctgatacccgtgccttgctcttccatcgttcacacccgaaaaatcaaaccaagcccttaatgaatcggcagccacggccgatacagg < 2:1099981‑M2/150‑125 (MQ=255) ggCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCtt < 2:221066/84‑1 (MQ=255) ggCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCtt > 1:221066/1‑84 (MQ=255) gCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTgg < 2:702539/100‑1 (MQ=255) gCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTgg > 1:702539/1‑100 (MQ=255) ccAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGggcctgttgcgcatactcagctgtcatcgcctcgaccctgatacccgtgccttgctcttccatcgttcacacccgaaaaatcaaaccaagcccttaatgaatcggcagccacggccgatacaggcaa > 1:1099981‑M2/1‑23 (MQ=255) ccAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCgtgt < 1:896571/127‑1 (MQ=255) ccAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCgtgt > 2:896571/1‑127 (MQ=255) ccaggcgttcagcccacgccctggcctgttgcgcatactcagctgtcatcgcctcgaccctgatacccgtgccttgctcttccatcgttcacacccgaaaaatcaaaccaagcccttaatgaatcggcagccacggccgatacaggcaat > 1:872552‑M1/1‑1 (MQ=255) cAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCGTGTGGACTTCGTCGAAGGTCAGGCTgc > 2:707510/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCGTGTGGACTTCGTCGAAGGTCAGGCTgc < 2:1313742/150‑1 (MQ=255) | TGGCAGAATAGCGGGATATTGCCTGTATCGGCCGTGGCTGCCGATTCATTAAGGGCTTGGTTTGATTTTTCGGGTGTGAACGATGGAAGAGCAAGGCACGGGTATCAGGGTCGAGGCGATGACAGCTGAGTATGCGCAACAGGCCAGGGCGTGG‑GCTGAACGCCTGGGCCTGCCGCTGCAGGACGATACCGCCGCCTTCGCGGTGCAGGTGGGCGTCGACGGCTTGCAGATTCAGCAACTGGGCCCGCAGGCGCCTGGGCCGGTGCGTGTGGACTTCGTCGAAGGTCAGGCTGC > NC_002947/1717262‑1717555 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |