| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2056006 = | 72 (1.370) | 3 (0.070) | 3/214 | NT | 5.2% | intergenic (+12/‑131) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein |
| ? | NC_002947 | 2056112 = | 47 (1.030) | intergenic (+118/‑25) | aroC/PP_1831 | chorismate synthase/membrane protein | |||||
CACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTAC > NC_002947/2055857‑2056154 | cACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAAc > 1:936451/1‑150 (MQ=255) tgcgcgccggggaaaagcccaggtggtcgaagtacagcgccaggaacggtgcggtggagcccagcagggcgaaatagaacaggtagaagctggacaggcgccagtaggggatgggttgcatggggtggccttgtggggacctgggccggc > 1:464790‑M1/147‑150 (MQ=255) ggcgcgccggggaaaagcccaggtggtcgaagtacagcgccaggaacggtgcggtggagcccagcagggcgaaatagaacaggtagaagctggacaggcgccagtaggggatgggttgcatggggtggccttgtggggacctgggccggc > 2:231913‑M1/147‑150 (MQ=255) gACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATNATGGCCATTGCGTTGATGAACCACCGGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGCTGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTTCAACggt > 1:202974/1‑149 (MQ=255) gcgccggggaaaagcccaggtggtcgaagtacagcgccaggaacggtgcggtggagcccagcagggcgaaatagaacaggtagaagctggacaggcgccagtaggggatgggttgcatggggtggccttgtggggacctgggcCGGCctc > 1:424358‑M1/144‑150 (MQ=255) gcgccggggaaaagcccaggtggtcgaagtacagcgccaggaacggtgcggtggagcccagcagggcgaaatagaacaggtagaagctggacaggcgccagtaggggatgggttgcatggggtggccttgtggggacctgggcCGGCctc < 1:471770‑M1/7‑1 (MQ=255) ccGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCctc > 2:699211/1‑150 (MQ=255) cgtgcgtgGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCctct > 2:632389/1‑150 (MQ=255) tgcgtgGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTc < 2:1409619/150‑1 (MQ=255) cgtgGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTcgc < 1:991994/150‑1 (MQ=255) ggaaaagcccaggtggtcgaatgacagcgccaggaacggtgcggtggagcccagcagggcgaaatagaacaggtagaagctggacaggcgccagtaggggatgggttgcatggggtggccttgtggggacctgggcCGGCCTCTTCGCgg > 1:783840‑M1/137‑150 (MQ=255) gggCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCggg < 2:251317/150‑1 (MQ=255) gggCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCggg > 2:856601/1‑150 (MQ=255) gaaaagcccaggtggtcgaagtacagcgccaggaacggtgcggtggagcccagcagggcgaaatagaacaggtagaagctggacaggcgccagtaggggatgggttgcatggggtggccttgtggggacctgggcCGGCCTCTTCGCggg < 2:624158‑M1/15‑1 (MQ=255) aTCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGGaaa > 1:241754/1‑150 (MQ=255) tGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCTGGTAAACCCGc < 2:741014/150‑1 (MQ=255) ggCCACGAAGATTGCCTAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCAACCGTGAATAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:461754/149‑1 (MQ=255) ccACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:220873/1‑150 (MQ=255) cACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATGCCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 1:212701/150‑1 (MQ=255) cACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGAGGGTGAACCCGCTcc > 1:80838/1‑150 (MQ=255) aCGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACg > 2:582234/1‑124 (MQ=255) aCGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACg < 1:582234/124‑1 (MQ=255) aCGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 2:1193302/1‑150 (MQ=255) cGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 1:447583/150‑1 (MQ=255) gCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 1:775247/1‑150 (MQ=255) cGATTGCCGAGTCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAt < 2:1205413/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTggg < 2:1212271/150‑1 (MQ=255) gAGGGGACGACGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGatat < 2:441825/150‑1 (MQ=255) cGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATctat < 1:1342528/150‑4 (MQ=255) tgatgGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAGCCTCTCCTACATTGGGATATCACttgc > 1:298824/1‑147 (MQ=255) gCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAg < 2:1333088/150‑1 (MQ=255) gCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAg < 1:1193302/150‑1 (MQ=255) aTTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 2:664693/123‑1 (MQ=255) aTTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 1:664693/1‑123 (MQ=255) tGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCa < 1:1296931/150‑1 (MQ=255) gcttagATCGACCACCCGCTGGTCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGTGATATCACTGCCCTCAGGTGCAg < 2:790420/145‑1 (MQ=255) gCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCAGCTGTGCCAGTGAATTTCTCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAg < 1:1029177/150‑1 (MQ=255) tGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAgg < 2:167782/150‑1 (MQ=255) ccaccTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGa > 1:834230/1‑150 (MQ=255) ccaccTGCTCCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGa < 1:383047/150‑1 (MQ=255) caccTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACa < 2:419163/143‑1 (MQ=255) caccTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACa > 1:419163/1‑143 (MQ=255) ccTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAAt > 2:1197312/1‑150 (MQ=255) ctgctgCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATc < 2:834230/150‑1 (MQ=255) ctgctgCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATc > 2:921372/1‑150 (MQ=255) ctgcGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACTCTGCGATATCCCTGCCCTCAGGTGCAGTTCCAGGGTCAAATcgtc < 2:1124038/150‑4 (MQ=255) ctgcGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCcgc < 2:928423/150‑1 (MQ=255) ctgcGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCcgc < 1:220873/150‑1 (MQ=255) aatagaacaggtagaagctggacaggcgccagtaggggatgggttgcatggggtggccttgtggggacctgggcCGGCCTCTTCGCgg < 1:1285594‑M1/14‑1 (MQ=255) aatagaacaggtagaagctggacaggcgccagtaggggatgggttgcatggggtggccttgtggggacctgggcCGGCCTCTTCGCgg > 2:1285594‑M1/75‑88 (MQ=255) cgcCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:1389674/91‑1 (MQ=255) cgcCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 2:1389674/1‑91 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gcAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTc > 1:1375962/1‑150 (MQ=255) cAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCa < 1:1197312/150‑1 (MQ=255) gacaggcgccagtaggggatgggttgcatggggtggccttgtggggacctgggcCGGCCTCTTCGCgg > 1:702535‑M1/55‑68 (MQ=255) gacaggcgccagtaggggatgggttgcatggggtggccttgtggggacctgggcAGGCCTCTTCGCgg < 2:702535‑M1/14‑1 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGatat > 2:1353307/1‑91 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGatat < 1:1353307/91‑1 (MQ=255) cGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa > 1:535700/1‑150 (MQ=255) gATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAag > 2:1250095/1‑150 (MQ=255) ttgtgCAAGTGAATACCCCGGTGCGGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTCGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga < 2:202974/149‑1 (MQ=255) cAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccg > 1:813692/1‑150 (MQ=255) gAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCa < 1:1009300/150‑1 (MQ=255) aaTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAg < 2:241754/150‑1 (MQ=255) aaTACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAg < 1:632389/150‑1 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCgg < 2:804036/47‑1 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCgg > 1:804036/1‑47 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCACTTCGCGGNGAAACCCGCTCGTACACTGGGATATCACCGCCCTCAGGGGCAGGGACCGAACCAAAACCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCGGGCCCAGGGccc > 1:448207/1‑150 (MQ=255) cccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGCCCTCTTCGGGAGTATACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAAGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTccc > 1:1097569/1‑150 (MQ=39) cccGGTGCTGGGCCAGCGCCGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTccc < 2:936451/150‑1 (MQ=255) gttgcatggggtggccttgtggggacctgggcCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCggg > 2:537638‑M1/33‑119 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ccAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCAcc > 1:1246313/1‑150 (MQ=255) gcgcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCa > 1:624158/1‑150 (MQ=255) gcgcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCa > 2:548374/1‑150 (MQ=255) gcTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGAAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATg > 2:10427/1‑150 (MQ=255) tGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 1:996221/113‑1 (MQ=255) tGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa > 2:996221/1‑113 (MQ=255) gATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCaa > 1:546185/1‑150 (MQ=255) tCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAAcc < 2:1097569/150‑1 (MQ=255) tGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATccc < 2:546185/150‑1 (MQ=255) aaCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTa > 2:833722/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTa < 1:833722/150‑1 (MQ=255) aCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTAc < 1:699211/150‑1 (MQ=255) | CACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTAC > NC_002947/2055857‑2056154 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |