New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2340035 = | 40 (0.760) | 3 (0.060) | 3/232 | NT | 7.1% | coding (634/1308 nt) | dctA‑II | C4‑dicarboxylate transport protein |
? | NC_002947 | 2340072 = | 41 (0.830) | coding (671/1308 nt) | dctA‑II | C4‑dicarboxylate transport protein |
TCGTCGATGGGCGAAAAGGGCAAGCCGGTACTGGACGTGCTGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTG > NC_002947/2339888‑2340181 | gcggcagcaccggctcggtggaggaagtacccagcaccacgaggaactcttcgcggaaatagcgcagcaacttccacaggctgaagccatgggcgcggcagatgccaccgagcaccaccagcacgaagaaggcgcaggcgatgtacaACg < 1:543591‑M1/3‑1 (MQ=255) cagcaccggctcggtggaggaagtacccagcaccacgaggaactcttcgcggaaatagcgcagcaacttccacaggctgaagccatgggcgcggcagatgccaccgagcaccaccagcacgaagaaggcgcaggcgatgtacaACGTccc > 1:140118‑M1/144‑150 (MQ=255) cGAAAAGGGCAAGCCGGTACTGGACGTGCTGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGgcgc < 2:1318481/150‑1 (MQ=255) gctcggtggaggaagtacccagcaccacgaggaactcttcgcggaaatagcgcagcaacttccacaggctgaagccatgggcgcggcagatgccaccgagcaccaccagcacgaagaaggcgcaggcgatgtacaa > 1:682525‑M1/136‑136 (MQ=255) gctcggtggaggaagtacccagcaccacgaggaactcttcgcggaaatagcgcagcaacttccacaggctgaagccatgggcgcggcagatgccaccgagcaccaccagcacgaagaaggcgcaggcgatgtacaa < 2:682525‑M1/1‑1 (MQ=255) aaaaGGGCAAGCCGGTACTGGACGTGCTGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCGAGTACGGGATTCCGTCCCTTGtcgcgc > 1:657476/1‑150 (MQ=255) aaaaGGGCAAGCCGGTACTGGACGTGCTGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGgcgcgc > 2:653522/1‑150 (MQ=255) aGCCGGTACTGGACGTGCTGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGc < 2:1176924/150‑1 (MQ=255) ccGGTACGGGACGTGCTGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTg < 2:180692/150‑1 (MQ=255) gACGTGCTGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGTTTGGTTCGCACTGGCATTCACCGTGGGCAAGAAGAAGATTGCGGGCCTTTGCGCGCTGGCCAAACTGGTAGGGagg > 1:318930/1‑148 (MQ=255) ccacgaggaactcttcgcggaaatagcgcagcaacttccacaggctgaagccatgggcgcggcagatgccaccgagcaccaccagcacgaagaaggcgcaggcgatgtacaACTTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTg > 2:578458‑M1/112‑150 (MQ=255) tGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACa > 1:551732/1‑150 (MQ=255) tGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACa > 1:551951/1‑150 (MQ=255) ggAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACAt < 1:653522/150‑1 (MQ=255) ggCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTg > 1:381360/1‑150 (MQ=255) cATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCcttctt < 2:614113/150‑1 (MQ=255) aTGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGCCCCCCTCCCCTTCCCCCCCCCCCCCTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCttcttc > 1:530656/1‑150 (MQ=255) tttCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCtg < 1:1171892/150‑1 (MQ=255) gCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCtggtgg > 1:1282000/1‑150 (MQ=255) cTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTAAGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCt < 2:759906/150‑1 (MQ=255) tCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCTGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCg < 1:1079034/150‑1 (MQ=255) cTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTgcgc < 1:1140717/119‑1 (MQ=255) cTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTgcgc > 2:1140717/1‑119 (MQ=255) tGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGt < 1:71434/102‑1 (MQ=255) tGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGt > 2:71434/1‑102 (MQ=255) tGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGcc > 2:861354/1‑150 (MQ=255) catgggcgcggcagatgccaccgagcaccaccagcacgaagaaggcgcaggcgatgtacaACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGa < 2:160779‑M1/34‑1 (MQ=255) catgggcgcggcagatgccaccgagcaccaccagcacgaagaaggcgcaggcgatgtacaACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGa > 1:160779‑M1/61‑94 (MQ=255) cTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCgcgc < 2:1282000/150‑1 (MQ=255) cccGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTg > 2:548943/1‑131 (MQ=255) cccGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTg < 1:548943/131‑1 (MQ=255) ggCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGc < 1:789319/150‑1 (MQ=255) cgcTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCt > 2:1042488/1‑150 (MQ=255) aCTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGc < 1:32507/118‑1 (MQ=255) aCTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGc > 2:32507/1‑118 (MQ=255) tGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTg > 1:260657/1‑108 (MQ=255) tGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTg < 2:260657/108‑1 (MQ=255) aTTCACCGTGGGCGAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGACCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTa > 2:86704/1‑150 (MQ=255) aTTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTa > 1:1376606/1‑150 (MQ=255) aCCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTc > 2:392311/1‑150 (MQ=255) gTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGGGCGTTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCcgc < 2:579852/150‑1 (MQ=255) gggCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCa > 2:1091245/1‑111 (MQ=255) gggCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCa < 1:1091245/111‑1 (MQ=255) ggCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGaa < 1:1042488/150‑1 (MQ=255) ccAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGACACCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAaga > 2:543591/1‑150 (MQ=255) cAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAagag > 2:492344/1‑150 (MQ=255) tACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTc > 2:451915/1‑150 (MQ=255) gagtACGTCCCTTGGCGCGCTCGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACCTCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTTGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCgc < 2:318930/147‑2 (MQ=255) aTTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCgtg < 2:1258158/150‑1 (MQ=255) aTTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCgtg < 1:861354/150‑1 (MQ=255) | TCGTCGATGGGCGAAAAGGGCAAGCCGGTACTGGACGTGCTGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTG > NC_002947/2339888‑2340181 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |