New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2340035 = | 40 (0.760) | 3 (0.060) | 3/232 | NT | 7.1% | coding (634/1308 nt) | dctA‑II | C4‑dicarboxylate transport protein |
? | NC_002947 | 2340072 = | 41 (0.830) | coding (671/1308 nt) | dctA‑II | C4‑dicarboxylate transport protein |
GTGCTGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCTGGGTACTTCCTCCACCGAGCCGGTGCTGCCGC > NC_002947/2339924‑2340218 | ccacgaggaactcttcgcggaaatagcgcagcaacttccacaggctgaagccatgggcgcggcagatgccaccgagcaccaccagcacgaagaaggcgcaggcgatgtacaACTTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTg > 2:578458‑M1/112‑150 (MQ=255) tGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACa > 1:551951/1‑150 (MQ=255) tGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACa > 1:551732/1‑150 (MQ=255) ggAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACAt < 1:653522/150‑1 (MQ=255) ggCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTg > 1:381360/1‑150 (MQ=255) cATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCcttctt < 2:614113/150‑1 (MQ=255) aTGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGCCCCCCTCCCCTTCCCCCCCCCCCCCTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCttcttc > 1:530656/1‑150 (MQ=255) tttCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCtg < 1:1171892/150‑1 (MQ=255) gCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCtggtgg > 1:1282000/1‑150 (MQ=255) cTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTAAGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCt < 2:759906/150‑1 (MQ=255) tCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCTGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCg < 1:1079034/150‑1 (MQ=255) cTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTgcgc > 2:1140717/1‑119 (MQ=255) cTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTgcgc < 1:1140717/119‑1 (MQ=255) tGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGcc > 2:861354/1‑150 (MQ=255) cTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCgcgc < 2:1282000/150‑1 (MQ=255) cccGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTg < 1:548943/131‑1 (MQ=255) cccGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTg > 2:548943/1‑131 (MQ=255) ggCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGc < 1:789319/150‑1 (MQ=255) cgcTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCt > 2:1042488/1‑150 (MQ=255) aCTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGc < 1:32507/118‑1 (MQ=255) aCTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGc > 2:32507/1‑118 (MQ=255) tGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTg > 1:260657/1‑108 (MQ=255) tGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTg < 2:260657/108‑1 (MQ=255) aTTCACCGTGGGCGAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGACCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTa > 2:86704/1‑150 (MQ=255) aTTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTa > 1:1376606/1‑150 (MQ=255) aCCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTc > 2:392311/1‑150 (MQ=255) gTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGGGCGTTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCcgc < 2:579852/150‑1 (MQ=255) gggCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCa < 1:1091245/111‑1 (MQ=255) gggCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCa > 2:1091245/1‑111 (MQ=255) ggCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGaa < 1:1042488/150‑1 (MQ=255) ccAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGACACCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAaga > 2:543591/1‑150 (MQ=255) cAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAagag > 2:492344/1‑150 (MQ=255) tACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTc > 2:451915/1‑150 (MQ=255) gagtACGTCCCTTGGCGCGCTCGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACCTCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTTGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCgc < 2:318930/147‑2 (MQ=255) aTTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCgtg < 2:1258158/150‑1 (MQ=255) aTTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCgtg < 1:861354/150‑1 (MQ=255) caacgtcccgaccagcttggccagcgcgccaagggaagtTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCgtgg > 2:578458‑M2/40‑150 (MQ=255) GTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCt < 1:1375258‑M1/150‑1 (MQ=255) tcccgaccagcttggccagcgcgccaagggacgtTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATg < 2:160779‑M2/60‑1 (MQ=255) tcccgaccagcttggccagcgcgccaagggacgtTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATg > 1:160779‑M2/35‑94 (MQ=255) TCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCTg > 2:1375258‑M1/1‑150 (MQ=255) gtCTTGTCGCGCTGGCCAATCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTGTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCTgg > 2:657476‑M1/3‑150 (MQ=255) CCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCTggg > 1:451915‑M1/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCTGGGTACTtcc > 1:1049901/1‑150 (MQ=255) gCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCAGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTACTCGTGGTGCTGGGTACTTCCTCCAcc > 2:1183491/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTgg > 1:161731/1‑60 (MQ=255) cAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTgg < 2:161731/60‑1 (MQ=255) cAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCTGGGTACTTCCTCCACCGa > 2:742951/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCTGGGTACTTCCTCCACCGa < 1:742951/150‑1 (MQ=255) gggacgtTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCTGGGTACTTCCTCCACCGAGCCGGtgctg > 1:140118‑M2/8‑150 (MQ=255) cgtTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCTGGGTACTTCCTCCACCGAGCCGGTGCTGCcgc < 1:543591‑M2/147‑1 (MQ=255) tTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCTGGGTACTTCCTCCACCGAGc > 1:682525‑M2/2‑136 (MQ=255) tTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCTGGGTACTTCCTCCACCGAGc < 2:682525‑M2/135‑1 (MQ=255) | GTGCTGGAGTCGGCCTCGACCATGGTGTTTCGCATCTTCGGCTACCTGATGCGCTTTGCCCCGATCGGCGCTTTCGGCGCACTGGCATTCACCGTGGGCCAGTACGGGATTACGTCCCTTGGCGCGCTGGCCAAGCTGGTCGGGACGTTGTACATCGCCTGCGCCTTCTTCGTGCTGGTGGTGCTCGGTGGCATCTGCCGCGCCCATGGCTTCAGCCTGTGGAAGTTGCTGCGCTATTTCCGCGAAGAGTTCCTCGTGGTGCTGGGTACTTCCTCCACCGAGCCGGTGCTGCCGC > NC_002947/2339924‑2340218 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |