New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2410758 = | 50 (0.950) | 3 (0.060) | 3/232 | NT | 6.2% | coding (733/2742 nt) | acnA‑I | aconitate hydratase |
? | NC_002947 | 2410803 = | 44 (0.890) | coding (688/2742 nt) | acnA‑I | aconitate hydratase |
TCGGCCAGGCCGTCCCCGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCAC > NC_002947/2410610‑2410907 | tCGGCCAGGCCGTCCCCGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGc > 1:421786/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGGCCGTCCCCGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGc > 2:479966/1‑150 (MQ=255) ccaggtcaacctggaatacctgggccgcacggtgtggacccgtgaggccgacggccgcacctatgccttccccgataccttggtgggcacagactcgcacaccaccatgatcaacggcctgggcgtactcggctggggtgtcggcgGCAt < 1:982439‑M1/4‑1 (MQ=255) ccAGGCCGTCCCCGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCTCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCg > 1:313287/1‑150 (MQ=255) tcaacctggaatacctgggccgcacggtgtggacccgtgaggccgacggccgcacctatgccttccccgataccttggtgggcacagactcgcacaccaccatgatcaacggcctgggcgtactcggctggggtgtcggcgGCATCGATa < 1:580907‑M1/9‑1 (MQ=255) gCCGTCCCCGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATAc < 1:423598/150‑1 (MQ=255) cccGTCCCCGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATAc < 2:1012450/149‑1 (MQ=255) gTCCCCGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGACGGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCgg > 1:1381023/1‑150 (MQ=255) gccccGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGc > 2:978949/2‑150 (MQ=255) ccccGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCt > 2:1411885/1‑150 (MQ=255) ccGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACAGGCTga > 2:221/1‑149 (MQ=255) acgaACTTGCCCACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGcc > 2:806672/1‑150 (MQ=255) cTTGCCCACCCCGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCAACGAAGGAGTTGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGccgcttc < 2:1107674/150‑1 (MQ=255) cccACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGccgcttccgct < 2:421786/150‑1 (MQ=255) ccaccaCGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGccgcttccgctt > 1:35158/1‑150 (MQ=255) ccaccaCGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGccgcttccgctt > 2:965098/1‑150 (MQ=255) accacGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCAGATCACTTCGGGGATCAGCATCTATACCGGCTGGCCGAGCATGGGAGCTTCAGCTTCg > 2:944856/1‑150 (MQ=255) cacGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGAt < 1:965098/150‑1 (MQ=255) gCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATgcc > 2:512221/1‑150 (MQ=255) gaggccgacggccgcacctatgccttccccgataccttggtgggcacagactcgcacaccaccatgatcaacggcctgggcgtactcggctggggtgtcggcgGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATgccg > 2:580907‑M1/104‑150 (MQ=255) tttCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGa > 1:1110557/1‑143 (MQ=255) tttCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGa < 2:1110557/143‑1 (MQ=255) tCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGa < 1:944856/150‑1 (MQ=255) tCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCACCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGa < 1:95368/150‑1 (MQ=255) ttGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGaca > 1:257578/1‑150 (MQ=255) gcagcaTCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACAcccc > 1:793312/1‑150 (MQ=255) tCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGTCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCTGCCGACACCCCAGCCGa < 2:469226/150‑1 (MQ=255) tgtCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTAc < 1:479966/150‑1 (MQ=255) aCGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAg > 1:1002474/1‑80 (MQ=255) aCGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAg < 2:1002474/80‑1 (MQ=255) aCGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGccc < 1:1411885/150‑1 (MQ=255) ggacaaGGTCAGTGGCAGTGAGGCCCTCCCGGAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTGCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTCCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGt > 2:1155977/6‑150 (MQ=255) tCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCAtg < 2:35158/150‑1 (MQ=255) cAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCAtgg < 2:257578/150‑1 (MQ=255) aGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCAtggt > 2:916869/1‑150 (MQ=255) tGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCAtggtgg > 2:401332/1‑150 (MQ=255) cAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCTGCATACGTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGgtgt < 1:221/150‑1 (MQ=255) gATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTAAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACTGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGa < 1:1402135/150‑1 (MQ=255) tcgcacaccaccatgatcaacggcctgggcgtactcggctggggtgtcggcgGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCAt > 2:402220‑M1/53‑77 (MQ=255) tcgcacaccaccatgatcaacggcctgggcgtactcggctggggtgtcggcgGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCAt < 1:402220‑M1/25‑1 (MQ=255) ccTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCtg > 2:1028781/1‑150 (MQ=255) cTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCa < 2:781013/105‑1 (MQ=255) cTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCa > 1:781013/1‑105 (MQ=255) tCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACAccc < 2:547663/102‑1 (MQ=255) tCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACAccc > 1:547663/1‑102 (MQ=255) tCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCtgtg > 1:1200613/1‑150 (MQ=255) ccccGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCtgtg < 2:1289287/149‑1 (MQ=255) gCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCcca > 1:1286472/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAg > 1:1003974/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATTGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCggg < 1:1363992/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTCAATCATGGTGGTGTGCGAGTCCGTGCCCACCAAGGTATCGGGGaa > 1:1306033/1‑150 (MQ=255) gCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGGCCCATACTCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATa > 1:88351/1‑150 (MQ=255) gCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGa < 1:1243368/117‑1 (MQ=255) gCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGa > 2:1243368/1‑117 (MQ=255) gATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAATGTATCGGGTAAGGCATATGt < 2:1003974/150‑1 (MQ=255) gATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGaa < 2:1105254/141‑1 (MQ=255) gATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGaa > 1:1105254/1‑141 (MQ=255) tCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGc < 1:401332/150‑1 (MQ=255) ttCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGcc > 1:718472/1‑150 (MQ=255) gCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGAGCGCCTCGTTGGGGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGATATCGGGGCAGGTATCGGAAAGGCCGTCGGCCTCAc > 1:88165/1‑150 (MQ=255) | TCGGCCAGGCCGTCCCCGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCAC > NC_002947/2410610‑2410907 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |