New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2410758 = | 50 (0.950) | 3 (0.060) | 3/232 | NT | 6.2% | coding (733/2742 nt) | acnA‑I | aconitate hydratase |
? | NC_002947 | 2410803 = | 44 (0.890) | coding (688/2742 nt) | acnA‑I | aconitate hydratase |
GCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCACACCGTGCGGCCCAGGTATTCCAGGTTGACCTGG > NC_002947/2410654‑2410948 | gCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATgcc > 2:512221/1‑150 (MQ=255) gaggccgacggccgcacctatgccttccccgataccttggtgggcacagactcgcacaccaccatgatcaacggcctgggcgtactcggctggggtgtcggcgGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATgccg > 2:580907‑M1/104‑150 (MQ=255) tCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGa < 1:944856/150‑1 (MQ=255) tCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCACCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGa < 1:95368/150‑1 (MQ=255) ttGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGaca > 1:257578/1‑150 (MQ=255) gcagcaTCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACAcccc > 1:793312/1‑150 (MQ=255) tCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGTCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCTGCCGACACCCCAGCCGa < 2:469226/150‑1 (MQ=255) tgtCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTAc < 1:479966/150‑1 (MQ=255) aCGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGccc < 1:1411885/150‑1 (MQ=255) ggacaaGGTCAGTGGCAGTGAGGCCCTCCCGGAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTGCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTCCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGt > 2:1155977/6‑150 (MQ=255) tCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCAtg < 2:35158/150‑1 (MQ=255) cAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCAtgg < 2:257578/150‑1 (MQ=255) aGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCAtggt > 2:916869/1‑150 (MQ=255) tGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCAtggtgg > 2:401332/1‑150 (MQ=255) cAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCTGCATACGTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGgtgt < 1:221/150‑1 (MQ=255) gATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTAAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACTGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGa < 1:1402135/150‑1 (MQ=255) ccTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCtg > 2:1028781/1‑150 (MQ=255) cTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCa > 1:781013/1‑105 (MQ=255) cTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCa < 2:781013/105‑1 (MQ=255) tCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACAccc > 1:547663/1‑102 (MQ=255) tCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACAccc < 2:547663/102‑1 (MQ=255) tCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCtgtg > 1:1200613/1‑150 (MQ=255) ccccGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCtgtg < 2:1289287/149‑1 (MQ=255) gCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCcca > 1:1286472/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAg > 1:1003974/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATTGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCggg < 1:1363992/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTCAATCATGGTGGTGTGCGAGTCCGTGCCCACCAAGGTATCGGGGaa > 1:1306033/1‑150 (MQ=255) gCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGGCCCATACTCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATa > 1:88351/1‑150 (MQ=255) gCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGa > 2:1243368/1‑117 (MQ=255) gCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGa < 1:1243368/117‑1 (MQ=255) gATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAATGTATCGGGTAAGGCATATGt < 2:1003974/150‑1 (MQ=255) gATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGaa < 2:1105254/141‑1 (MQ=255) gATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGaa > 1:1105254/1‑141 (MQ=255) tCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGc < 1:401332/150‑1 (MQ=255) ttCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGcc > 1:718472/1‑150 (MQ=255) cggcatcgaagcggaagcggccatgctcggccagccggtatcgatgcCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTc > 2:580907‑M2/48‑150 (MQ=255) gCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGAGCGCCTCGTTGGGGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGATATCGGGGCAGGTATCGGAAAGGCCGTCGGCCTCAc > 1:88165/1‑150 (MQ=255) TCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGt < 2:523304‑M1/75‑1 (MQ=255) TCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGt > 1:523304‑M1/1‑75 (MQ=255) GATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTc > 2:793312‑M1/1‑150 (MQ=255) GATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCAGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTc > 2:1381023‑M1/1‑150 (MQ=255) GATACCGGCTGGCCCAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGCAGCGTGATCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTc > 1:87833‑M1/1‑150 (MQ=255) ATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCCTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCtgt > 2:1146428‑M1/1‑97 (MQ=255) ATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCCTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCtgt < 1:1146428‑M1/97‑1 (MQ=255) cGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCacac > 1:358592/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCNNTGCCGCCGACACCCNANCNGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGGCCACACCg > 1:994633/1‑150 (MQ=255) ggCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCACACCGTGc < 2:1286472/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCACACCGTGCg > 2:982439/1‑150 (MQ=255) ccGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCACACCGTGCgg < 2:994633/150‑1 (MQ=255) atgctcggccagccggtatcgatgcCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGa > 2:402220‑M2/26‑77 (MQ=255) atgctcggccagccggtatcgatgcCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGa < 1:402220‑M2/52‑1 (MQ=255) gCATGGCCGCCTCCGCTTACACGCACCCGCCAACCCAGCCGAGTAAGCAAAGCACGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCACACCGTGCGGCCCa < 2:654315/150‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCACACCGTGCGGCCCAGGTATTc > 2:1290388/1‑150 (MQ=255) gcttccgcttcGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCACACCGTGCGGCCCAGGTATTcc < 2:358592/150‑1 (MQ=255) gcttcagcttcGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCACACCGTGCGGCCCAGGTATTcc > 2:1157024/1‑150 (MQ=255) tccgcttcGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCACACCGTGCGGCCCAGGTATTCCAgg < 1:978949/150‑1 (MQ=255) tatcgatgcCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCACACCGTGCGGCCCAGGTATTCCAGGTTGa < 1:580907‑M2/141‑1 (MQ=255) atgcCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCACACCGTGCGGCCCAGGTATTCCAGGTTGACCtgg < 1:982439‑M2/146‑1 (MQ=255) cgccgACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCcca > 1:960/1‑63 (MQ=255) cgccgACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCcca < 2:960/63‑1 (MQ=255) | GCCTTTCTTGCGCAGCATCTGTGTCACGGTCAGCACCAGGTCAGTGGCAGTGATGCCCTCCCGCAGCTTGCCGGTCAGCTTGAAGCCGATCACTTCGGGGATCAGCATCGATACCGGCTGGCCGAGCATGGCCGCTTCCGCTTCGATGCCGCCGACACCCCAGCCGAGTACGCCCAGGCCGTTGATCATGGTGGTGTGCGAGTCTGTGCCCACCAAGGTATCGGGGAAGGCATAGGTGCGGCCGTCGGCCTCACGGGTCCACACCGTGCGGCCCAGGTATTCCAGGTTGACCTGG > NC_002947/2410654‑2410948 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |