| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2494230 = | 33 (0.630) | 3 (0.060) | 3/224 | NT | 9.4% | coding (451/864 nt) | PP_2187 | universal stress protein family protein |
| ? | NC_002947 | 2494274 = | 28 (0.590) | coding (407/864 nt) | PP_2187 | universal stress protein family protein | |||||
TTCACGGTAGCGCTTTTCGATCGTATCGCTCAGCTGGAACGCCGGGTCCGACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGG > NC_002947/2494081‑2494360 | ttCACGGTAGCGCTTTTCGATCGTATCGCTCAGCTGGAACGCCGGGTCCGACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGCTCGATGATGCTGGCATGCAg > 2:536645/1‑150 (MQ=255)ggctgcgaactggtgatcaaggaccaccgcccggacaatccgctgaaaaaggccctgctcacccccagcgactggaagctgctgcgccaatgtccgtgtgcggtgctgatggtcaagagcgagcggccatggaccgggggcaagatcctg > 1:418156‑M1/150‑150 (MQ=255) gctgcgaactggtgatcaaggaccaccgcccggacaatccgctgaaaaaggccctgctcacccccagcgactggaagctgctgcgccaatgtccgtgtgcggtgctgatggtcaagagcgagcggccatggaccgggggcaagatcctgg > 1:700353‑M1/149‑150 (MQ=255) cgaactggtgatcaaggaccaccgcccggacaatccgctgaaaaaggccctgctcacccccagcgactggaagctgctgcgccaatgtccgtgtgcggtgctgatggtcaagagcgagcggccatggaccgggggcaagatcctggcggc < 2:314180‑M1/6‑1 (MQ=255) ctggtgatcaaggaccaccgcccggacaatccgctgaaaaaggccctgctcacccccagcgactggaagctgctgcgccaatgtccgtgtgcggtgctgatggtcaagagcgagcggccatggaccgggggcaagatcctGGCGGCggtg > 1:390199‑M1/141‑150 (MQ=255) gcTTTTCGATCGTATCGCTCAGCTGGAACGCCGGGTCCGACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCggtggt > 2:246518/1‑150 (MQ=255) ttCGATCGTATCGCTCAGCTGGAACGCCGGGTCCGACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTc < 1:246518/150‑1 (MQ=255) ggaccaccgcccggacaatccgctgaaaaaggccctgctcacccccagcgactggaagctgctgcgccaatgtccgtgtgcggtgctgatggtcaagagcgagcggccatggaccgggggcaagatccaGGcggcgg > 2:769990‑M1/130‑137 (MQ=255) ggaccaccgcccggacaatccgctgaaaaaggccctgctcacccccagcgactggaagctgctgcgccaatgtccgtgtgcggtgctgatggtcaagagcgagcggccatggaccgggggcaagatccaGGcggcgg < 1:769990‑M1/8‑1 (MQ=255) gTATCGCTCAGCTGGAACGCCGGGTCCGACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTgg > 2:1048811/1‑150 (MQ=255) cGCTCAGCTGGAACGCCGGGTCCGACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGc < 2:771981/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGGAACGCCGGGTCCGACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCt < 2:438593/134‑1 (MQ=255) tCAGCTGGAACGCCGGGTCCGACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCt > 1:438593/1‑134 (MQ=255) gAACGCCGGGTCCGACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCAc > 2:814449/1‑150 (MQ=255) gggTCCGACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCgccgcc < 1:814449/150‑1 (MQ=255) gACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCAccgcc > 2:421236/1‑141 (MQ=255) gACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCAccgcc < 1:421236/141‑1 (MQ=255) ccctgctcacccccagcgactggaagctgctgcgccaatgtccgtgtgcggtgctgatggtcaagagcgagcggccatggaccgggggcaagatcctGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTg > 2:626164‑M1/98‑150 (MQ=255) ggaTCGGCGACGGGTGGTCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGGCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTGCCGGTTGCACACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCgg < 1:114057/148‑1 (MQ=255) cATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGt > 1:298238/1‑150 (MQ=255) cATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCGGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGGTCTTGCCCCCGGt > 1:314180/1‑150 (MQ=255) tCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTcc > 1:184535/1‑150 (MQ=255) ggCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGCTGATCGACTGAAGGCGGCGGTGCTCTTCGTCCTAGTTGCCCACGTCCACCTTTGTCAGGATCTTGCCCCCGGTCCAt < 2:1231447/150‑1 (MQ=255) ggCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCAt < 1:575901/150‑1 (MQ=255) ggCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCAt < 2:184535/150‑1 (MQ=255) ccagcgactggaagctgctgcgccaatgtccgtgtgcggtgctgatggtcaagagcgagcggccatggaccgggggcaagatcctGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCAcc < 2:339407‑M1/38‑1 (MQ=255) ccagcgactggaagctgctgcgccaatgtccgtgtgcggtgctgatggtcaagagcgagcggccatggaccgggggcaagatcctGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCAcc > 1:339407‑M1/86‑123 (MQ=255) gTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCcgctc < 2:207028/150‑1 (MQ=255) cACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGACGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGctct > 1:451361/1‑150 (MQ=255) tgaCGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCa < 1:1048811/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACg > 1:622611/1‑150 (MQ=255) tGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCgca < 2:622611/150‑1 (MQ=255) gCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGAACCGCACACGGACATTTGCgcagc > 1:68980/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTcaa > 1:420571/1‑148 (MQ=255) gCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAg > 2:159347/1‑72 (MQ=255) gCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAg < 1:159347/72‑1 (MQ=255) gTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTg < 1:1067858/129‑1 (MQ=255) gTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTg > 2:1067858/1‑129 (MQ=255) tGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTg > 2:229871/1‑150 (MQ=255) gatgatGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTgggg > 2:712701/1‑148 (MQ=255) gatgatGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTgggg < 1:712701/148‑1 (MQ=255) gatgCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGca > 1:981760/1‑109 (MQ=255) gatgCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGca < 2:981760/109‑1 (MQ=255) | TTCACGGTAGCGCTTTTCGATCGTATCGCTCAGCTGGAACGCCGGGTCCGACGCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGG > NC_002947/2494081‑2494360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |