New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2494230 = | 33 (0.630) | 3 (0.060) | 3/224 | NT | 9.4% | coding (451/864 nt) | PP_2187 | universal stress protein family protein |
? | NC_002947 | 2494274 = | 28 (0.590) | coding (407/864 nt) | PP_2187 | universal stress protein family protein |
GCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTCCTTGATCACCAGTTCGCAGCCT > NC_002947/2494133‑2494423 | ccctgctcacccccagcgactggaagctgctgcgccaatgtccgtgtgcggtgctgatggtcaagagcgagcggccatggaccgggggcaagatcctGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTg > 2:626164‑M1/98‑150 (MQ=255) ggaTCGGCGACGGGTGGTCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGGCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTGCCGGTTGCACACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCgg < 1:114057/148‑1 (MQ=255) cATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGt > 1:298238/1‑150 (MQ=255) cATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCGGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGGTCTTGCCCCCGGt > 1:314180/1‑150 (MQ=255) tCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTcc > 1:184535/1‑150 (MQ=255) ggCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGCTGATCGACTGAAGGCGGCGGTGCTCTTCGTCCTAGTTGCCCACGTCCACCTTTGTCAGGATCTTGCCCCCGGTCCAt < 2:1231447/150‑1 (MQ=255) ggCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCAt < 2:184535/150‑1 (MQ=255) ggCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCAt < 1:575901/150‑1 (MQ=255) gTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCcgctc < 2:207028/150‑1 (MQ=255) cACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGACGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGctct > 1:451361/1‑150 (MQ=255) tgaCGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCa < 1:1048811/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACg > 1:622611/1‑150 (MQ=255) tGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCgca < 2:622611/150‑1 (MQ=255) gCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGAACCGCACACGGACATTTGCgcagc > 1:68980/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTcaa > 1:420571/1‑148 (MQ=255) gCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAg > 2:159347/1‑72 (MQ=255) gCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAg < 1:159347/72‑1 (MQ=255) gTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTg > 2:1067858/1‑129 (MQ=255) gTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTg < 1:1067858/129‑1 (MQ=255) tGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTg > 2:229871/1‑150 (MQ=255) gatgatGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTgggg > 2:712701/1‑148 (MQ=255) gatgatGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTgggg < 1:712701/148‑1 (MQ=255) gatgCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGca < 2:981760/109‑1 (MQ=255) gatgCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGca > 1:981760/1‑109 (MQ=255) caagatcctggcggcggtggacgtgggcaaccaggacgaagaccaccgccgccAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAggg > 2:626164‑M2/54‑150 (MQ=255) ggtggacgtgggcaaccaggacgaagaccaccgccgccAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTgg > 1:339407‑M2/39‑123 (MQ=255) ggtggacgtgggcaaccaggacgaagaccaccgccgccAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTgg < 2:339407‑M2/85‑1 (MQ=255) GTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGca < 1:807450‑M1/85‑1 (MQ=255) GTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGca > 2:807450‑M1/1‑85 (MQ=255) cTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTgg < 2:199101/95‑1 (MQ=255) cTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTgg > 1:199101/1‑95 (MQ=255) tCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCgg > 2:316928/1‑150 (MQ=255) tGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCggtgg > 1:431622/1‑150 (MQ=255) ttGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTcc > 1:703953/1‑150 (MQ=255) tGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTCCt < 2:298238/150‑1 (MQ=255) ccACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGGCCTTGa > 1:59037/1‑150 (MQ=255) atctCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCGAGTCGCTGGGGTTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTCCTTGATc < 2:1194805/147‑1 (MQ=255) aCGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTCCTTGATc < 1:316928/150‑1 (MQ=255) caccgccgccAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTCCTTGATCACCAg > 1:390199‑M2/11‑150 (MQ=255) ccgccgccTGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTcc > 2:769990‑M2/9‑137 (MQ=255) ccgccgccTGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTcc < 1:769990‑M2/129‑1 (MQ=255) gccgccAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTCCTTGATCACCAGTTCg < 2:314180‑M2/144‑1 (MQ=255) ccAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTCCTTGATCACCAGTTCGCAGc > 1:700353‑M2/3‑150 (MQ=255) cAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTCCTTGATCACCAGTTCGCAGcc > 1:418156‑M2/2‑150 (MQ=255) aGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTCCTTGATCACCAGTTCGCAGCCt > 2:885730/1‑150 (MQ=255) | GCTGACAGCATCGGCGACGGGTGGGCACTGATGACGTGCAGTTCTCCCTTGGCCAGTTTGGCAATCTCGAAGCCGTGGTCGATGATGCTGGCATGCAGGCGGCGGTGGTCTTCGTCCTGGTTGCCCACGTCCACCGCCGCCAGGATCTTGCCCCCGGTCCATGGCCGCTCGCTCTTGACCATCAGCACCGCACACGGACATTGGCGCAGCAGCTTCCAGTCGCTGGGGGTGAGCAGGGCCTTTTTCAGCGGATTGTCCGGGCGGTGGTCCTTGATCACCAGTTCGCAGCCT > NC_002947/2494133‑2494423 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |