New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3100052 = | 40 (0.760) | 4 (0.080) | 4/232 | NT | 9.6% | coding (788/1470 nt) | PP_2709 | long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
? | NC_002947 | 3100119 = | 38 (0.770) | coding (855/1470 nt) | PP_2709 | long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
CAGCAGCAGTTGGGGATGGGAGGGGCAAGCCAGGTCGATTTCAAGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGAAGGTTACGGCTTGTCCGAGTGCGCCTCGGTAGTGGCGCTCAACCGCACAGGGGCTGTG > NC_002947/3099904‑3100200 | cagcagcagTTGGGGATGGGAGGGGCAAGCCAGGTCGATTTCAAGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTc < 2:427184/150‑1 (MQ=255) cagcagTTGGGGATGGGAGGGGCAAGCCAGGTCGATTTCAAGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGc > 1:1374029/1‑150 (MQ=255) gTTGGGGGTGAGAGGGGTCTTCCAGTTCGTTGTCAAGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACt < 2:1374029/150‑1 (MQ=255) gggCAAGCCAGGTCGATTTCAAGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCgg > 2:670699/1‑150 (MQ=255) aaGCCAGGTCGATTTCAAGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAgg > 1:1281809/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCGATTTCAAGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCGGAGCCGGATCCTTGTGCCACAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGGGGTAGGCgg > 1:811041/1‑150 (MQ=255) ggTCGATTTCAAGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGc > 1:446099/1‑150 (MQ=255) gTCGATTTCAAGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCt > 2:995378/1‑150 (MQ=255) gATTTCAAGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCgg > 1:371926/1‑150 (MQ=255) tttCAAGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGCGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGt > 2:494473/1‑150 (MQ=255) aaGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCggg < 2:8436/138‑1 (MQ=255) aaGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCggg > 1:8436/1‑138 (MQ=255) gcgcCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGcc > 2:808737/1‑150 (MQ=255) gcCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCaa < 1:17089/150‑1 (MQ=255) gcCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCaa < 1:670699/150‑1 (MQ=255) gcCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCaa > 1:547294/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCgg < 1:324042/138‑1 (MQ=255) cTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCgg > 2:324042/1‑138 (MQ=255) ccgacgctcccagggcgcacagcccctgtgcggttgagcgccactaccgaggcgcactcggacaagccgtaaccttcgaacaccggcaaaccgactgccTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGcc < 2:592031‑M1/51‑1 (MQ=255) gTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGGTGGTGACAGCGATCGAGCCCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCt > 2:754601/1‑150 (MQ=255) aaTCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTcgcgcg > 2:1158771/1‑150 (MQ=255) ggcgcacagcccctgtgcggttgagcgccactaccgaggcgcactcggacaagccgtaaccttcgaacaccggcaaaccgactgccTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGc > 1:592031‑M1/87‑150 (MQ=255) ccTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGa < 1:528726/150‑1 (MQ=255) cTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAg < 1:423243/150‑1 (MQ=255) tCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCAGAgg > 1:596859/1‑150 (MQ=255) tggtgCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGc > 2:492425/1‑131 (MQ=255) tggtgCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGc < 1:492425/131‑1 (MQ=255) tgCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCgg < 1:995378/150‑1 (MQ=255) cTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGGATCCGCCAGCCTGCTCGCGTGGGCCGGGAGAGTCGGtt > 2:640552/1‑150 (MQ=255) gcgccactaccgaggcgcactcggacaagccgtaaccttcgaacaccggcaaaccgactgccTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTcgcgcg > 1:357364‑M1/63‑123 (MQ=255) gcgccactaccgaggcgcactcggacaagccgtaaccttcgaacaccggcaaaccgactgccTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTcgcgcg < 2:357364‑M1/61‑1 (MQ=255) ccTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATc > 1:940340/1‑102 (MQ=255) ccTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATc < 2:940340/102‑1 (MQ=255) cTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGaa > 1:1284244/1‑150 (MQ=255) cTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGaa < 2:446099/150‑1 (MQ=255) ttGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGAAg < 2:1281809/150‑1 (MQ=255) ttGTGCCGCAGCTGCTGAAGGGATTGGTGCAAGAAATAGATCCCGCTATGATGTAGTGTTGCCCTCTTTGTTGGGTGGCGGTAGGCGGGGCGCGGGTATCCACCAGGCTGCTCAGGAGGCACGACGCAGTAGGTTTGCGGGTGTTCGAAg < 2:1379030/150‑1 (MQ=255) gCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGAAGGTTACgg < 2:547294/150‑1 (MQ=255) gCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCGGATGCGGTTCGGCCCACTGCGTTTGGGGGCGGTAGGCGGAAGCCGACCTTTGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTGCGTAGGTTACgg > 1:811809/1‑150 (MQ=255) ggTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGAAGGTTACGGCTTGTCCGAGTgcg > 2:627795/1‑150 (MQ=255) gCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGTCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGAAGGTTACGGCTTGTCCGAGTGCGCCTCGGTAGTg > 1:1227447/1‑150 (MQ=255) cgcgGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGAAGGTTACGGCTTGTCCGAGTGCGCCTCGGTAGTGGCGCTCAAc < 1:494473/150‑1 (MQ=255) cgGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGTCGCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGAAGGTTACGGCTTGTCCGAGTGCGCCTCGGTAGTGGCGCTCAACCg > 1:330412/1‑150 (MQ=255) aTGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGAAGGTTACGGCTTGTCCGAGTGCGCCTCGGTAGTGGCGCTCAACCGCACAggg > 2:869398/1‑150 (MQ=255) tGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGAAGGTTACGGCTTGTCCGAGTGCGCCTCGGTAGTGGCGCTCAACCGCACAgggg < 1:808737/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGAGCCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGAAGGTTACGGCTTGTCCGAGTGCGCCTCGGTAGTGGCGCTCAACCGCACAgggg < 1:13614/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGAAGGTTACGGCTTGTCCGAGTGCCCCTCGGTAGTGGCGCTCAACCGCACAGGGGCtgtg > 2:510234/1‑150 (MQ=255) | CAGCAGCAGTTGGGGATGGGAGGGGCAAGCCAGGTCGATTTCAAGCGCCTGTTGGGCGCAATCGCCCTCAGTGGTGCTCAGAGCCTGATCCTTGTGCCGCAGCTGCTGATGGGGTTGGTGACAGCGATCGAGCGCGGGCTGATGCGGGTCGGCCCACTGCGTTTGGTGGCGGTAGGCGGGGCTCGGGTATCGCCAAGCCTGCTCGCGCGGGCCGAGGCAGTCGGTTTGCCGGTGTTCGAAGGTTACGGCTTGTCCGAGTGCGCCTCGGTAGTGGCGCTCAACCGCACAGGGGCTGTG > NC_002947/3099904‑3100200 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |