New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4247709 | 35 (0.670) | 3 (0.060) | 3/232 | NT | 8.6% | coding (252/1608 nt) | aruI | 2‑ketoarginine decarboxylase AruI |
? | NC_002947 | = 4247747 | 31 (0.630) | coding (214/1608 nt) | aruI | 2‑ketoarginine decarboxylase AruI |
CAGAAAACGCCGTGATGGGCGCAGTCATGGCGCGCTGGTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAG > NC_002947/4247561‑4247858 | cAGAAAACGCCGTGATGGGCGCAGTCATGGCGCGCTGGTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTgg < 2:1297320/150‑1 (MQ=255) gCCGTGATGGGCGCAGTCATGGCGCGCTGGTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCAACAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTg < 1:747100/150‑1 (MQ=255) cGTGATGGGCGCAGTCATGGCGCGCTGGTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGt < 1:681121/150‑1 (MQ=255) gATGGGCGCAGTCATGGCGCGCTTGTCCTGTGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACGATCATCGGACCCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCAc < 2:630458/150‑1 (MQ=255) gATGGGCGCAGTCATGGCGCGCTGGTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCAc < 2:1314615/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCAGTCATGGCGCGCTGGTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGc < 1:584692/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGTCATGGCGCGCTGGTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCGAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTTTGGATGACGCTGGAAATCGCCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCGGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCt < 2:706342/150‑1 (MQ=255) gTCATGGCGCGCTGGTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCg < 2:1161176/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGCTGGTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGCCGTTGGTCACGCCTGCGCCGGtga > 2:567659/1‑150 (MQ=255) cgatgcgcTGGTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGtga > 2:110772/5‑150 (MQ=255) cTGGTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGaa > 1:79939/1‑150 (MQ=255) ggTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGCCCCCGCCTCGCCCTAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGACACGCCTGGGCCGGTAATGCCGAAGc < 2:595038/150‑1 (MQ=255) gTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGca > 2:1018595/1‑150 (MQ=255) gTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGca < 2:980005/150‑1 (MQ=255) tCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCAc < 1:1058970‑M2/150‑2 (MQ=255) tttCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTAGCCGATGGGGGTGtgcttcgtcatcaccggcctaggcgtgaccaacgtcgccaccc < 1:924097‑M1/147‑44 (MQ=255) tttCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTAGCCGATGGGGGTGtgcttcgtcatcaccggcctaggcgtgaccaacgtcgccaccc > 2:924097‑M1/1‑104 (MQ=255) cATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGtgcttcgtcatcaccggcccaggcgtgaccaacgtcgccacccccatcg < 2:427477‑M1/150‑50 (MQ=255) gcaggcagCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGc < 1:110772/150‑1 (MQ=255) gcagCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTg < 2:1061197/103‑1 (MQ=255) gcagCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTg > 1:1061197/1‑103 (MQ=255) cagccccagcccTTGCCCGGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCGGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTG > 2:1155286‑M1/1‑150 (MQ=255) cagcccTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTTGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGC > 1:1001804‑M1/1‑150 (MQ=255) aGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGACAAGCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGATGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCg < 1:1290348/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCa < 2:407638/150‑1 (MQ=255) gCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATg > 2:149104/1‑150 (MQ=255) tgGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCg < 2:840238/150‑1 (MQ=255) gTTGACGCTTGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATTAAGCCGgc < 2:1001804/150‑1 (MQ=255) ttGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGgcg > 1:1359576/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCCTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGccc < 1:1307702/150‑1 (MQ=255) tagAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGATTGGCCGAAGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACACCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCCCCCTGCt > 2:294961/3‑150 (MQ=255) tGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGAGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCt > 1:1103327/1‑150 (MQ=255) aaaTCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGt < 2:1365696/150‑1 (MQ=255) tCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACTTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGAGGAAGCACACTCCCGGCTTGCCACTGACCCGCTCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgc < 1:648531‑M2/150‑3 (MQ=255) aCCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcgg < 2:575680‑M2/150‑5 (MQ=255) aCCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcgg > 1:1018595‑M2/1‑146 (MQ=255) cATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCcacgagcagggcgccggcttcatggccgacggctacgcgcgggtcag < 1:367964‑M1/150‑48 (MQ=255) gCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACAt > 1:699780/1‑150 (MQ=255) gCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACAt < 2:1359576/150‑1 (MQ=255) cACCGGTTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTCGCGACGTTGGCCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACCCCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACAta < 2:648531/150‑2 (MQ=255) aCCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGaa > 2:159583/1‑116 (MQ=255) aCCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGaa < 1:159583/116‑1 (MQ=255) cAGAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACCCCCCCGGCTTGCCACGGACCCGCCCGCAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcgggtccgtggcaagcagggggtgt > 2:241197‑M2/1‑124 (MQ=255) aGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGc < 1:1344974/150‑1 (MQ=255) ggCTTGGCCGATGGGGGTGGCGATGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGcc < 1:1108757/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGAGGGGGGTGGCGACGTTAGCCACGCCTGGGCCGGTGATCCCGAATCACCCCCCGGGCGTGCCACTGTCCCGCGCGAAGCCGTCGGCCATGACGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGTTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCgg < 1:575680/150‑1 (MQ=255) ttGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCcacgagcagggcgccggcttcatggccgacggctacgcgcgg > 2:795736‑M1/1‑79 (MQ=255) ttGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCcacgagcagggcgccggcttcatggccgacggctacgcgcgg < 1:795736‑M1/121‑43 (MQ=255) gCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCCCGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAg < 2:281478/150‑1 (MQ=255) cGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCAcacccccatcggccaagcctatgccgactcggtgccgatgctggtgatttccagcgtcaaccacaccgccagcctgggcaagggctggggctgcctgcatg < 2:427477‑M2/150‑102 (MQ=255) gggTGGCGACGTTGGTCACGCCTAGGCCGGTGATGACGAAGCAcacccccatcggctaagcctatgccgactcggtgccgatgctggtgatttccagcgtcaaccacaccgccagcctgggcaagggctggggctgcctgcatgaaa < 1:924097‑M2/147‑105 (MQ=255) gggTGGCGACGTTGGTCACGCCTAGGCCGGTGATGACGAAGCAcacccccatcggctaagcctatgccgactcggtgccgatgctggtgatttccagcgtcaaccacaccgccagcctgggcaagggctggggctgcctgcatgaaa > 2:924097‑M2/1‑43 (MQ=255) gtgcttcgtcatcaccggcccaggcgtgaccaacgtcgccacccccatcggccaagcctatgccgactcggtgccgatgctggtgatttccagcgtcaaccacaccgccagcctgggcaagggctggggctgcctgcatgaaacccagga < 1:1058970‑M1/150‑150 (MQ=255) | CAGAAAACGCCGTGATGGGCGCAGTCATGGCGCGCTGGTCCTGGGTTTCATGCAGGCAGCCCCAGCCCTTGCCCAGGCTGGCGGTGTGGTTGACGCTGGAAATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAG > NC_002947/4247561‑4247858 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |