New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4726137 = | 44 (0.840) | 3 (0.060) | 3/236 | NT | 7.3% | coding (1291/1314 nt) | brnQ | branched‑chain amino acid transporter |
? | NC_002947 | 4726166 = | 34 (0.670) | coding (1262/1314 nt) | brnQ | branched‑chain amino acid transporter |
GCCGAAACAGGCAAACAGCAAAAAGCCCCGCATCCTTTCGGAGACGGGGCTCTCTTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCTGGCAACACGTGGGCAAGGCTGCTGCCCTTGATCGCATCGACCATGC > NC_002947/4725991‑4726286 | gtgatgctggtatcgctgttgttcggcatggtcgatgcgatcaagggcagcagccttgcccacgtgttgccagacttcatggcgcacctgccattgagtgatgccggcatggcctggctggtaccttcggtggtgaccctggtgggTGcc > 2:241096‑M1/147‑150 (MQ=255) tgatgctggtatcgctgttgttcggcatggtcgatgcgatcaagggcagcagccttgcccacgtgttgccagacttcatggcgcacctgccattgagtgatgccggcatggcctggctggtaccttcggtggtgaccctggtgggTGCCg > 2:105007‑M1/146‑150 (MQ=255) cGAAACAGGCAAACAGCAAAAAGCCCCGCATCCTTTCGGAGACGGGGCTCTCTTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGa < 1:1015197/150‑1 (MQ=255) aaaCAGGCAAACAGCAAAAAGCCCCGCATCCTTTCGGAGACGGGGCTCTCTTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGc < 1:176328/150‑1 (MQ=255) gCAAACAGCAAAAAGCCCCGCATCCTTTCGGAGACGGGGCTCTCTTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGa < 2:357777/142‑1 (MQ=255) gCAAACAGCAAAAAGCCCCGCATCCTTTCGGAGACGGGGCTCTCTTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGa > 1:357777/1‑142 (MQ=255) gCAAACAGCAAAAAGCCCCGCATCCTTTCGGAGACGGGGCTCTCTTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCACTCAGGCTCCAAATCTACATCGAAGGACAGCGGCGCGCGCGGCTGGCCGAGCATGCgg > 2:727037/1‑150 (MQ=255) aCAGCAAAAAGCCCCGCATCCTTTCGGAGACGGGGCTCTCTTGTGTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCACGCGGCTTGCCGAGCATGCGGgcgc > 1:134777/1‑150 (MQ=255) cAGCAAAAAGCCCCGCATCCTTTCGGAGACGGGGCTCTCTTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCACCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCa < 2:874022/150‑1 (MQ=255) aGCAAAAAGCCCCGCGTCCTTTCGGAGTCGGGGATTTCTTGTCTGTGGGCTGGGCTCTCTCCCTTCTGCTTGTTGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCAATCATGCGGTCGCAg < 2:312906/150‑1 (MQ=255) aGCAAAAAGCCCCGCATCCTTTCGGAGACGGGGCTCTCTTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAg < 1:1255097/150‑1 (MQ=255) gCAAAAAGCCCCGCATCCTTTCGGAGACGGGGCTCTCTTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAgg > 1:138700/1‑150 (MQ=255) tgcgatcaagggcagcagccttgcccacgtgttgccagacttcatggcgcacctgccattgagtgatgccggcatggcctggctggtaccttcggtggtgaccctggtgggTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAggg > 2:1322984‑M1/112‑150 (MQ=255) ggAGACGGGGCTCTCTTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTcac < 2:673627/150‑1 (MQ=255) gggCTCTCTTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGaa < 1:942712/150‑1 (MQ=255) ctctTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCAAAGGTAc < 2:740797/150‑1 (MQ=255) tctTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGCAGGTAcc > 1:596561/1‑150 (MQ=255) tctTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTAcc > 1:221337/1‑150 (MQ=255) ttGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGCTAccag > 1:1124825/1‑150 (MQ=255) ttGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGACGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGGCACCACCGAAGGTCccag > 1:2829/1‑150 (MQ=255) cccTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCAt < 2:40558/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAgg < 1:809184/120‑1 (MQ=255) ccTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAgg > 2:809184/1‑120 (MQ=255) ttCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAAt > 2:801307/1‑150 (MQ=255) ttCGGCTGGGGGCCGGTGCCGCCCTCATGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTGGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGGCACGGCACCGACCAGGGTCACCACCGGAGGTACCAGCCGGGCCATGCCGGCATCGCTCAAt < 2:2829/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGTGTGGCCGGTGCCGCCCTCATGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAAt > 2:1090694/1‑150 (MQ=255) ggCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGc < 2:266197/150‑1 (MQ=255) gCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCa < 1:801307/150‑1 (MQ=255) ttGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAgg > 2:120877/1‑150 (MQ=255) ttGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGCCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAgg > 1:1395749/1‑150 (MQ=255) gtgGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTg < 2:360293/150‑1 (MQ=255) cattgagtgatgccggcatggcctggctggtaccttcggtggtgaccctggtgggTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACgg > 1:814807‑M1/56‑82 (MQ=255) cattgagtgatgccggcatggcctggctggtaccttcggtggtgaccctggtgggTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACgg < 2:814807‑M1/27‑1 (MQ=255) gTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATg < 1:1090694/150‑1 (MQ=255) aGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCAc > 2:277855/1‑119 (MQ=255) aGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCAc < 1:277855/119‑1 (MQ=255) aGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCTGGCaa > 2:25792/1‑150 (MQ=255) cTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCAc > 1:1326051/1‑63 (MQ=255) cTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCAc < 2:1326051/63‑1 (MQ=255) cTTCAACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCt < 1:377186/142‑1 (MQ=255) cTTCAACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCt > 2:377186/1‑142 (MQ=255) ttGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCTGGCAACACGTggg < 2:575420/148‑1 (MQ=255) ttGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCTGGCAACACGTggg > 1:575420/1‑148 (MQ=255) gTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCTg > 2:410917/1‑134 (MQ=255) gTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCTg < 1:410917/134‑1 (MQ=255) cGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGt > 2:407061/1‑79 (MQ=255) cGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGt < 1:407061/79‑1 (MQ=255) ggTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCTGGCAACACGTGGGCAAGgctg < 1:120877/150‑1 (MQ=255) gcgcgGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCACGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAGGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCTGGCAACACGTGGGCAAGGCTGCTGCCCTTGATCGCATc < 2:402729/150‑1 (MQ=255) gggTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCTGGCAACACGTGGGCAAGGCTGCTGCCCtt > 1:123948‑M1/4‑136 (MQ=255) gggTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCTGGCAACACGTGGGCAAGGCTGCTGCCCtt < 2:123948‑M1/133‑1 (MQ=255) TGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCTGGCAACACGTGGGCAAGGCTGCTGCCCTTGATCGCATCGACCATGc > 2:717098‑M1/1‑150 (MQ=255) | GCCGAAACAGGCAAACAGCAAAAAGCCCCGCATCCTTTCGGAGACGGGGCTCTCTTGTTTTCACCCTTGGCGGGCACCCTTCGGCTTGTGGCCGGTGCCGCCCTCAGGCTTCCACTTGTCCGGTCAGGCCAGCGCCTCGCGCGGCTTGCCGAGCATGCGGTCGCAGGCCACGGCACCCACCAGGGTCACCACCGAAGGTACCAGCCAGGCCATGCCGGCATCACTCAATGGCAGGTGCGCCATGAAGTCTGGCAACACGTGGGCAAGGCTGCTGCCCTTGATCGCATCGACCATGC > NC_002947/4725991‑4726286 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |