| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5507448 | 61 (1.160) | 3 (0.060) | 3/236 | NT | 5.1% | coding (661/1407 nt) | cycA | D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease |
| ? | NC_002947 | = 5507479 | 54 (1.070) | coding (692/1407 nt) | cycA | D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease | |||||
GCTACCGGCCTGTACATGGTCATCACCGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGGCGCTGATCGCGATCATGGCCGTGACCCCGTGGCGCGAT > NC_002947/5507301‑5507597 | gCTACCGGCCTGTACATGGTCATCACCGGCTTCACCTCGCCCAGCTGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCAGTGTTCGCCTtcgtc < 1:1178185/150‑1 (MQ=255)gCTACCGGCCTGTACATGGTCATCACCGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCGTtcgtc > 1:241450/1‑150 (MQ=255) tACCGGCCTGTACATGGTCATCACCGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCgg > 2:939198/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTGTACATGGTCATCACCGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCa > 1:778662/1‑150 (MQ=255) ccTGTACATGGTCATCACCGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGAGCGTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGa < 1:958792/150‑1 (MQ=255) cATGGTCATCACCGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCtggt < 2:279358/150‑1 (MQ=255) gTCATCACCGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGTGCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGt < 1:95126/150‑1 (MQ=255) tcaCCGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGGCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTccca > 2:982851/1‑150 (MQ=255) tcaCCGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTacca > 2:983031/1‑150 (MQ=255) aCCGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTaccacc > 2:1035636/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCGTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCAccg > 1:1275760/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCAccg > 1:1181616/1‑150 (MQ=255) cGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCAccgc > 2:1350095/1‑150 (MQ=255) aCCTCTCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGgcggcggtggtacccaccagctcgatgccgacgaa < 1:697008‑M1/150‑36 (MQ=255) aCCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCcgaa > 1:1350095‑M2/1‑146 (MQ=255) aCCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGCATAGGCCGGCCTGTTTCCAGATCGCCGTGTTAGCATTAGCAGGCATTGACCTGTGGGGTACCACCGCCGCcgaa > 1:247498/1‑150 (MQ=255) cTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCcgaagc < 2:778662/150‑1 (MQ=255) cTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCcgaagc > 1:252363/1‑150 (MQ=255) tCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGgcggcggtggtacccaccagctcgatgccgacgaag > 2:1184956‑M1/1‑112 (MQ=255) tCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGgcggcggtggtacccaccagctcgatgccgacgaag < 1:1184956‑M1/148‑37 (MQ=255) gCCCAGCTGGCGCACCGTCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCcgaagcgaa < 2:452648/150‑1 (MQ=255) cgcACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGaa < 1:573420/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTg < 1:1057122/150‑1 (MQ=255) ccAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCggg < 2:1275760/150‑1 (MQ=255) cAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGc > 2:1205398/1‑150 (MQ=255) aCCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGa < 1:552710/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGAATGGTGGGGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGAt < 2:368861/150‑1 (MQ=255) cTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTGCGACCGCCGCCGAAGCGGAGAACCCGGACAGGACCCTGCggcgggcgcgt > 2:612737/1‑147 (MQ=255) gtgGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCaa < 1:939198/150‑1 (MQ=255) tgGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAAc < 1:612737/150‑1 (MQ=255) tgGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAAc < 2:252363/150‑1 (MQ=255) gAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTc > 1:817646/1‑150 (MQ=255) gAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTc > 2:125658/1‑150 (MQ=255) gcggcATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTcgatcccga < 2:1181616/150‑1 (MQ=255) cggcATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCa > 1:368711/1‑119 (MQ=255) cggcATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCa < 2:368711/119‑1 (MQ=255) ggcATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGAAGACAATCAACTcgatcccgatc > 1:73489/1‑150 (MQ=255) gaaTGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTcgatcccgatcc > 2:591290/3‑150 (MQ=255) ccccATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCa > 1:952157/1‑109 (MQ=255) ccccATGCCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCa < 2:952157/109‑1 (MQ=255) ccATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCgt < 2:627967/150‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCgtgt > 2:591478/1‑150 (MQ=255) cTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTAt > 2:288267/1‑150 (MQ=255) gATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTAtgt > 1:85663/1‑150 (MQ=255) aTGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTAtgtg < 1:7902/150‑1 (MQ=255) cttcttCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGgc < 2:85663/150‑1 (MQ=255) cttcGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGgcg > 2:1160930/1‑148 (MQ=255) cttcGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGgcg < 1:1160930/148‑1 (MQ=255) cttcGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGgcg < 1:1161464/148‑1 (MQ=255) cttcGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGgcg > 2:1161464/1‑148 (MQ=255) tcGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTAGCCTTGGACTGCACCGAGCTTGGGGGGACCACCGCGCCCGAAGCGAAGCAACACCCCCGTTTCCGCCCGCAGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCGAGATGCTGGCGCGGa > 1:1034010/1‑150 (MQ=255) gCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTa > 2:1328129/1‑134 (MQ=255) gCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTa < 1:1328129/134‑1 (MQ=255) gCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGGCGCTGATc < 1:1035636/150‑1 (MQ=255) ccGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTatca > 2:762733/1‑123 (MQ=255) ccGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTatca < 1:762733/123‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGGCGCTGATcgcg < 1:591478/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTGCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGGACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGGCGCTGATcgcg < 2:598270/150‑1 (MQ=255) gTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTg < 1:185423/137‑1 (MQ=255) gTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTg > 2:185423/1‑137 (MQ=255) aGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGGCGCTGATCGCGATCATgg > 2:1385219/1‑150 (MQ=255) ccGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGa > 1:932039/1‑84 (MQ=255) ccGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGa < 2:932039/84‑1 (MQ=255) ccGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGGCGCTGATCGCGATCATGGCCGTGa > 2:1153645/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGGCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGTTCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTgg < 2:990508/118‑1 (MQ=255) gCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTgg > 1:990508/1‑118 (MQ=255) gCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTgg > 1:990379/1‑118 (MQ=255) gCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTgg < 2:990379/118‑1 (MQ=255) cTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCcgaaggcgaacacggcgatctggaaaccggcgaagaagcccatcaggccatgggggaacatgccgccgtcattccacaggttggccagctgggcggtgcgcccgctgggcga > 2:1184956‑M2/1‑36 (MQ=255) cTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCcgaaggcgaacacggcgatctggaaaccggcgaagaagcccatcaggccatgggggaacatgccgccgtcattccacaggttggccagctgggcggtgcgcccgctgggcga < 1:1184956‑M2/148‑113 (MQ=255) cTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGGCGCTGATCGCGATCATGGCCGTGACCCCGTGgcg < 2:247498/150‑1 (MQ=255) ttCGgcggcggtggtacccaccagctcgatgccgacgaaggcgaacacggcgatctggaaaccggcgaagaagcccatcaggccatgggggaacatgccgccgtcattccacaggttggccagctgggcggtgcgcccgctgggcgaggt > 1:1350095‑M1/1‑4 (MQ=255) ttCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCcgaaggcgaacacggcgatctggaaaccggcgaagaagcccatcaggccatgggggaacatgccgccgtcattccacaggttggccagctgggcggtgcgcccgctgggagaggt < 1:697008‑M2/150‑116 (MQ=255) gtcgGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGGCGCTGATCGCGATCATGGCCGTGACCCCGTGGCGCGAt < 2:1165646/150‑1 (MQ=255) gtcgGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGGCGCTGATCGCGATCATGGCCGTGACCCCGTGGCGCGAt < 1:125658/150‑1 (MQ=255) | GCTACCGGCCTGTACATGGTCATCACCGGCTTCACCTCGCCCAGCGGGCGCACCGCCCAGCTGGCCAACCTGTGGAATGACGGCGGCATGTTCCCCCATGGCCTGATGGGCTTCTTCGCCGGTTTCCAGATCGCCGTGTTCGCCTTCGTCGGCATCGAGCTGGTGGGTACCACCGCCGCCGAAGCGAAGAACCCGGAACGCACCCTGCCGCGGGCGATCAACTCGATCCCGATCCGTATCATCGTGTTCTATGTGCTGGCGCTGATCGCGATCATGGCCGTGACCCCGTGGCGCGAT > NC_002947/5507301‑5507597 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |