| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5680661 | 69 (1.310) | 5 (0.100) | 4/234 | NT | 6.8% | coding (665/720 nt) | rsmE | 16S rRNA (uracil(1498)‑N(3))‑methyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 5680683 | 72 (1.440) | coding (687/720 nt) | rsmE | 16S rRNA (uracil(1498)‑N(3))‑methyltransferase | |||||
GTGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTG > NC_002947/5680513‑5680810 | gTGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCgag > 2:1101090/1‑150 (MQ=255) gggCTGAGCCGCTTATCAGCCATGACAAGCCCGCCACCCTGGCCATCAAAGA‑CGGTCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCgaga < 1:1156206/149‑1 (MQ=255) tGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGTCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACcgc > 1:612075/1‑150 (MQ=255) tGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACcgc > 1:53073/1‑150 (MQ=255) ccGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCCTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAcagcgccacc > 1:789896‑M1/1‑140 (MQ=255) aGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGA < 2:1227225‑M1/131‑1 (MQ=255) aGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGA > 1:1227225‑M1/1‑131 (MQ=255) cATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTg > 2:753495/1‑150 (MQ=255) aTGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGt < 1:699994‑M2/150‑2 (MQ=255) aaaaGCCCGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGtcgg < 1:51494‑M2/150‑5 (MQ=255) aaGCCCGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCCTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAcagcgccaccaccggcgcggtctcggtg < 2:789896‑M1/150‑29 (MQ=255) aGCCCGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTgg < 2:51494/150‑1 (MQ=255) cccGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAcagcgccaccaccggcgcggtctcggtgcgc < 2:858789‑M1/150‑32 (MQ=255) cGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGcaca > 1:345500/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGtt > 1:1269636/1‑150 (MQ=255) ccTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTggg < 1:1043701/150‑1 (MQ=255) cTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGGGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTgggg > 1:206970/1‑150 (MQ=255) ttCGT‑GAGCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTAGAGCAGGCCAACGCCGCCGGCTCCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTTAAAACGGATACTTCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTgggga < 1:260296/150‑2 (MQ=255) tCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACtttt < 2:585421/150‑1 (MQ=255) cGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTa < 2:206970/150‑1 (MQ=255) ggCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTaa < 2:1173854/150‑1 (MQ=255) gCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAAc > 2:512411/1‑150 (MQ=255) cccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCACCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTa > 2:123394/1‑150 (MQ=255) ccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGgtggtg > 1:842824/1‑107 (MQ=255) ccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGgtggtg < 2:842824/107‑1 (MQ=255) ccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGc > 1:792299/1‑137 (MQ=255) ccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGc < 2:792299/137‑1 (MQ=255) ccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACtt > 1:1321891/1‑142 (MQ=255) ccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACtt < 2:1321891/142‑1 (MQ=255) cGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTGACTAgc > 1:522401/1‑150 (MQ=255) aGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCa < 2:345500/150‑1 (MQ=255) gcggcCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACg > 1:866705/1‑150 (MQ=255) ccTTAGCGAAGTCGAGGTGCAGCAGGCGAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTaga < 1:1095034/150‑1 (MQ=255) gCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCTAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTaga > 2:1342221/1‑145 (MQ=255) gCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTaga < 1:1342221/145‑1 (MQ=255) aaGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTagag > 2:144334/1‑143 (MQ=255) aaGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTagag < 1:144334/143‑1 (MQ=255) aaGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACAcc < 1:1101090/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTggg < 2:220452/115‑1 (MQ=255) gCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTggg > 1:220452/1‑115 (MQ=255) gCCGAGGTCGAGCAGGCAAAAGCCGCGGACTACCCCGCAGCACTGCGTGTCCCTCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGc < 2:866705/150‑1 (MQ=255) cGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCACCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCa < 1:123394/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGaa < 1:753495/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTgggg < 1:1340534/107‑1 (MQ=255) gAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTgggg > 2:1340534/1‑107 (MQ=255) ggCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGca > 2:403239/1‑88 (MQ=255) ggCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGca < 1:403239/88‑1 (MQ=255) 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gagaCCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCt < 1:1059804/150‑1 (MQ=255) agaCCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTg < 1:1206740/150‑1 (MQ=255) acagcgccaccaccggcgcggtctcggtgcgcagcacgcgcgggccaaggcgtgctgcgtggaagccggcggctttggcctgctcgacctcggcttcgctaaggccgccttcggggccgatcacgaaggccagggtggcgggcttttcat < 1:699994‑M1/150‑150 (MQ=255) | GTGGCTGAGCCGCTTATCAGCCATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGT‑GATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTG > NC_002947/5680513‑5680810 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |