New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5680661 | 69 (1.310) | 5 (0.100) | 4/234 | NT | 6.8% | coding (665/720 nt) | rsmE | 16S rRNA (uracil(1498)‑N(3))‑methyltransferase |
? | NC_002947 | = 5680683 | 72 (1.440) | coding (687/720 nt) | rsmE | 16S rRNA (uracil(1498)‑N(3))‑methyltransferase |
CATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGC > NC_002947/5680534‑5680832 | cATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTg > 2:753495/1‑150 (MQ=255) aTGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGt < 1:699994‑M2/150‑2 (MQ=255) aaaaGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGtcgg < 1:51494‑M2/150‑5 (MQ=255) aGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTgg < 2:51494/150‑1 (MQ=255) cGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGcaca > 1:345500/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGtt > 1:1269636/1‑150 (MQ=255) ccTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTggg < 1:1043701/150‑1 (MQ=255) cTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGGGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTgggg > 1:206970/1‑150 (MQ=255) ttCGTGAGCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTAGAGCAGGCCAACGCCGCCGGCTCCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTTAAAACGGATACTTCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTgggga < 1:260296/150‑2 (MQ=255) tCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACtttt < 2:585421/150‑1 (MQ=255) cGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTa < 2:206970/150‑1 (MQ=255) ggCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTaa < 2:1173854/150‑1 (MQ=255) gCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAAc > 2:512411/1‑150 (MQ=255) cccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCACCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTa > 2:123394/1‑150 (MQ=255) ccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGc > 1:792299/1‑137 (MQ=255) ccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGc < 2:792299/137‑1 (MQ=255) ccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACtt < 2:1321891/142‑1 (MQ=255) ccGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACtt > 1:1321891/1‑142 (MQ=255) cGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTGACTAgc > 1:522401/1‑150 (MQ=255) aGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCa < 2:345500/150‑1 (MQ=255) gcggcCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACg > 1:866705/1‑150 (MQ=255) ccTTAGCGAAGTCGAGGTGCAGCAGGCGAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTaga < 1:1095034/150‑1 (MQ=255) gCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCTAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTaga > 2:1342221/1‑145 (MQ=255) gCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTaga < 1:1342221/145‑1 (MQ=255) aaGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTagag < 1:144334/143‑1 (MQ=255) aaGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTagag > 2:144334/1‑143 (MQ=255) aaGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACAcc < 1:1101090/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTggg > 1:220452/1‑115 (MQ=255) gCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTggg < 2:220452/115‑1 (MQ=255) gCCGAGGTCGAGCAGGCAAAAGCCGCGGACTACCCCGCAGCACTGCGTGTCCCTCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGc < 2:866705/150‑1 (MQ=255) cGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCACCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCa < 1:123394/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGaa < 1:753495/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTgggg > 2:1340534/1‑107 (MQ=255) gAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTgggg < 1:1340534/107‑1 (MQ=255) ggCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGca < 1:403239/88‑1 (MQ=255) ggCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGca > 2:403239/1‑88 (MQ=255) ggCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCa < 2:1269636/150‑1 (MQ=255) gcAAAGCCGCCGGCTTCCACCCAGCCCGCCTTGGGCCGCGCGTGCTGCGCCCCGAAGCCGCGGCGGTGGGGGCGCCGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGGGACCTTTAACTAGCGCACGTAGGGCGACCCCGCCCCGAAGTGCATCAgg > 2:810473/2‑150 (MQ=255) ccAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAgg > 2:64771/1‑150 (MQ=255) ccAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAgg < 1:810473/150‑1 (MQ=255) aaGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTg > 2:1172760/1‑150 (MQ=255) gccgGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGc < 2:353616/150‑1 (MQ=255) cgGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGa > 2:424246/1‑150 (MQ=255) cgGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGa < 1:1172760/150‑1 (MQ=255) ttCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGAc < 2:53073/150‑1 (MQ=255) cACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGaa > 2:52584/1‑150 (MQ=255) aCGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGAAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCAAGGAAGTGAATACGGCTGCCAGCGATgccaaaa > 2:1327516/1‑144 (MQ=255) gcaCGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTg > 2:1081913/1‑150 (MQ=255) gcaCGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTg < 1:166686/150‑1 (MQ=255) aCGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAg > 1:785010/1‑89 (MQ=255) aCGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAg < 2:785010/89‑1 (MQ=255) aCGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGcc > 2:284454/1‑150 (MQ=255) gCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGAt < 1:150262/134‑1 (MQ=255) gCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGAt > 2:150262/1‑134 (MQ=255) cTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGat > 2:671423/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGat > 1:1128374/1‑150 (MQ=255) gCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGTCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGatgcca < 1:1149843/150‑1 (MQ=255) gCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGATCGCATAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGACCGACACCCCCACTTTTTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGatgcca < 1:1327516/150‑1 (MQ=255) cccGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGatgccat < 1:52584/150‑1 (MQ=255) cgcgcgTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGatgccatgc > 1:1410981/1‑150 (MQ=255) cgTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGt < 1:523898/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTg < 1:1121799/150‑1 (MQ=255) gctgcGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGc < 1:992342/150‑1 (MQ=255) ctgcGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTg < 2:1098437/109‑1 (MQ=255) ctgcGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTg > 1:1098437/1‑109 (MQ=255) ctgcGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCg < 1:512411/150‑1 (MQ=255) gcgcACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGtcggtgcgcagcacgcgcgggccaaggcgtgctgcgtggaagccggcggctttggcctgctcgacctcggcttcgctaaggccgccttcggggccgatcacgaaggccagggtggcggg < 2:858789‑M2/150‑120 (MQ=255) gcACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGaaa < 1:284454/150‑1 (MQ=255) cACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGtcggtgcgcagcacgcgcgggccaaggcgtgctgcgtggaagccggcggctttggcctgctcgacctcggcttcgctagggccgccttcggggccgatcacgaaggccagggtggcgggctt < 2:789896‑M2/150‑123 (MQ=255) cACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGtcggtgcgcagcacgcgcgggccaaggcgtgctgcgtggaagccggcgg < 1:222337‑M2/77‑50 (MQ=255) cACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGtcggtgcgcagcacgcgcgggccaaggcgtgctgcgtggaagccggcgg > 2:222337‑M2/1‑28 (MQ=255) ccGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGAc > 1:475978/1‑113 (MQ=255) ccGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGAc < 2:475978/113‑1 (MQ=255) gagaCCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCt < 1:1059804/150‑1 (MQ=255) agaCCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTg < 1:1206740/150‑1 (MQ=255) gaCCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGt > 1:1203551/1‑150 (MQ=255) cgcgCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGCTGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGa > 2:955235/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGAt > 2:1075236/1‑102 (MQ=255) gcgcCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGAt < 1:1075236/102‑1 (MQ=255) gcgcCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGaa < 2:1128374/150‑1 (MQ=255) gcCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAgg < 1:671423/150‑1 (MQ=255) ggtggCGCTGtcggtgcgcagcacgcgcgggccaaggcgtgctgcgtggaagccggcggctttggcctgctcgacctcggcttcgctagggccgccttcggggccgatcacgaaggccagggtggcgggcttttcatggctgataagcgg > 1:789896‑M2/1‑10 (MQ=255) gcgcTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCt < 2:632374/132‑1 (MQ=255) gcgcTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCt > 1:632374/1‑132 (MQ=255) gcTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAatga < 1:424246/150‑1 (MQ=255) tGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAatgatg > 2:102400/1‑150 (MQ=255) gTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGc < 1:1081913/150‑1 (MQ=255) | CATGAAAAGCCCGCCACCCTGGCCTTCGTGATCGGCCCCGAAGGCGGCCTTAGCGAAGCCGAGGTCGAGCAGGCCAAAGCCGCCGGCTTCCACGCAGCACGCCTTGGCCCGCGCGTGCTGCGCACCGAGACCGCGCCGGTGGTGGCGCTGTCGGTGGCACAGCAGTTGTGGGGCGACTTTTAACTAGCGCACGTAGAGCGACACCGCCACGAAGTGCATCAGGCTGCCAGCGATGACGAACAGGTGCCAGATGCCATGCCAGTGGCGGAAACGGCTGTCGAAGGCGAAGAAAATGATGC > NC_002947/5680534‑5680832 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |