New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5981456 = | 47 (0.890) | 13 (0.270) | 12/222 | NT | 22.2% | coding (2045/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 5981491 = | 49 (1.030) | coding (2080/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
CAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATC > NC_002947/5981308‑5981600 | cAAGCGCTAGGCGTACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATc > 2:132203/1‑150 (MQ=255) cAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGCTTGGTGCCGCTTATGCACTTACGGCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATc > 1:729055/1‑150 (MQ=255) ccGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGcc < 1:1266070/150‑1 (MQ=255) ccTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGcc > 1:1175683/1‑150 (MQ=255) ttGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAg > 2:551230/1‑150 (MQ=255) ttGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAg > 1:782418/1‑150 (MQ=255) aGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTg < 2:1175683/150‑1 (MQ=255) cTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACAGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGcc > 2:1231303/1‑150 (MQ=255) cgcgtgcgcatgatgcggcttcgcgtaaaagctgcaggaacgcttcgcagtcatccgctgcaaacccgcaggggctggcgcgttgtagctggctggcgagctcgaacaacacctcgtgcgtTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCa > 1:444081‑M1/122‑150 (MQ=255) tGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAg < 1:106390/150‑1 (MQ=255) gATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTCGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAgg < 2:497586/150‑1 (MQ=255) cgtgcgcatgatgcggcttcgcgtaaaagctgcaggaacgcttcgcagtcatccgctgcaaacccgcaggggctggcgcgttgtagctggctggcgagctcgaacaacacctcgtgcgtTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAgg < 1:344001‑M1/31‑1 (MQ=255) gtgcgcatgatgcggcttcgcgtaaaagctgcaggaacgcttcgcagtcatccgctgcaaacccgcaggggctggcgcgttgtagctggctggcgagctcgaacaacacctcgtgcgtTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAggg > 2:344001‑M1/119‑150 (MQ=255) gtgcgcatgatgcggcttcgcgtaaaagctgcaggaacccttcgacgtcacccgctgcgaacctgcatgggctcgcgtgttgtagctggctggcgagctccaacaacaccgcgtgcgtTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAggg > 1:1387147‑M1/119‑150 (MQ=255) gcgcatgatgcggcttcgcgtaaaagctgcaggaacgcttcgcagtcatccgctgcaaacccgcaggggctggcgcgttgtagctggctggcgagctcgaacaacacctcgtgcgtTCg < 2:321763‑M1/3‑1 (MQ=255) gcgcatgatgcggcttcgcgtaaaagctgcaggaacgcttcgcagtcatccgctgcaaacccgcaggggctggcgcggtgtagctggctggcgagctcgaacaacacctcgtgcgtTCg > 1:321763‑M1/117‑119 (MQ=255) gcTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATCAACGTATCGCACTCGCCATTCTCCTTGCTTGGCCAGGGCGAAcc > 2:373801/1‑149 (MQ=255) gCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACg > 1:951447/1‑150 (MQ=255) ggcttcgcgtaaaagctgcaggaacgcttcgcagtcatccgctgcaaacccgcaggggctggcgcgttgtagctggctggcgagctcgaacaacacctcgtgcgtTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAgg < 2:508343‑M1/31‑1 (MQ=255) ggcttcgcgtaaaagctgcaggaacgcttcgcagtcatccgctgcaaacccgcaggggctggcgcgttgtagctggctggcgagctcgaacaacacctcgtgcgtTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAgg > 1:508343‑M1/106‑136 (MQ=255) ccTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGgt < 2:782418/150‑1 (MQ=255) cTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGgtg > 2:394740/1‑150 (MQ=255) cTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGgtg < 1:551230/150‑1 (MQ=255) aaCCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCCCGCTGCAGGCAGGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGtgttgt < 2:194958/150‑1 (MQ=255) aCCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTgttgtt < 1:394740/150‑1 (MQ=255) gcaggaacgcttcgcagtcatccgctgcaaacccgcaggggctggcgcgttgtagctggctggcgagctcgaacaacacctcgctgcatgcacgtaTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCg > 1:741199‑M1/97‑150 (MQ=255) ggCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAg < 1:1231303/150‑1 (MQ=255) cAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTc > 2:218707/1‑150 (MQ=255) aCGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCgcca < 2:259601/150‑1 (MQ=255) ttGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTGACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGccagccag < 2:1026468/150‑1 (MQ=255) cTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACa > 1:697620/1‑150 (MQ=255) ttCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACaa > 1:971452/1‑150 (MQ=255) ttCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACaa > 1:971474/1‑150 (MQ=255) cACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAAcg > 1:794052/1‑150 (MQ=255) gACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAAcgc < 1:308512/144‑1 (MQ=255) gACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAAcgc > 2:308512/1‑144 (MQ=255) ccGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGccc > 1:626474/1‑150 (MQ=255) cGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGa > 1:1267109/1‑119 (MQ=255) cGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGa < 2:1267109/119‑1 (MQ=255) ggTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTg > 2:1099882/1‑150 (MQ=255) gATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGACAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCgg > 1:380662/1‑150 (MQ=255) aTGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCggg < 1:1099882/150‑1 (MQ=255) gAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGGTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGttt > 1:1335359/1‑150 (MQ=255) ccGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAg > 2:133344/1‑150 (MQ=255) gCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCg > 1:248666/1‑150 (MQ=255) cTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCgg > 2:255543/1‑150 (MQ=255) ttATGCACTCACGCCCTTGCACCAGCGCGCGTCGCTGGATGCACGTATCGCCCTGGGCATGCGCCAAGTTTGGCCAGGGCGAACGGACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGTTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGa < 2:17519/150‑1 (MQ=255) tGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCGGCGGATGa > 1:1192444/1‑150 (MQ=255) cTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACtac < 2:951447/150‑3 (MQ=255) tCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCg > 2:1233357/1‑150 (MQ=255) aCGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGaa > 1:1104511/1‑150 (MQ=255) ccGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGt > 1:778338/1‑150 (MQ=255) ggctggcgagctcgaacaacacctcgtgcgtTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAg > 2:1277505‑M1/32‑61 (MQ=255) ggctggcgagctcgaacaacacctcgtgcgtTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAg < 1:1277505‑M1/30‑1 (MQ=255) gTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTc < 1:132203/150‑1 (MQ=255) gCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCt < 2:248666/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCt > 2:664392/1‑150 (MQ=255) tcgaacaacacctcgtgcgaTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCgg < 1:1363868‑M1/91‑1 (MQ=255) tcgaacaacacctcgtgcgaTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCgg > 2:1363868‑M1/21‑111 (MQ=255) aacaacacctcgtgcgtTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGc > 2:744448‑M1/18‑44 (MQ=255) aacaacacctcgtgcgtTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGc < 1:744448‑M1/27‑1 (MQ=255) cTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGaa < 1:1120535/150‑1 (MQ=255) cTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGaa < 2:925709/150‑1 (MQ=255) atgcaCGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCg > 2:251820/1‑150 (MQ=255) tgcaCGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGc > 2:377633/1‑150 (MQ=255) aCGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCGCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGACGcatg > 2:689260/1‑149 (MQ=255) cGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGc < 2:193609/114‑1 (MQ=255) cGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCGTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGc > 1:193609/1‑114 (MQ=255) TCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCgg < 2:269924‑M1/91‑1 (MQ=255) TCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCgg > 1:269924‑M1/1‑91 (MQ=255) | CAACCGCCAGGCGAACCCTTGAAAGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATC > NC_002947/5981308‑5981600 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |