New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5981456 = | 47 (0.890) | 13 (0.270) | 12/222 | NT | 22.2% | coding (2045/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 5981491 = | 49 (1.030) | coding (2080/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
GCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCGGGCACCTTCGA > NC_002947/5981344‑5981627 | gcTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATCAACGTATCGCACTCGCCATTCTCCTTGCTTGGCCAGGGCGAAcc > 2:373801/1‑149 (MQ=255) gCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑Cg > 1:951447/1‑150 (MQ=255) ccTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGgt < 2:782418/150‑1 (MQ=255) cTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGgtg > 2:394740/1‑150 (MQ=255) cTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGgtg < 1:551230/150‑1 (MQ=255) aaCCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCCCGCTGCAGGCAGGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGtgttgt < 2:194958/150‑1 (MQ=255) aCCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTgttgtt < 1:394740/150‑1 (MQ=255) gcaggaacgcttcgcagtcatccgctgcaaacccgcaggggctggcgcgttgtagctggctggcgagctcgaacaacacctcgctgcatgcacgtaTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCg > 1:741199‑M1/97‑150 (MQ=255) ggCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAg < 1:1231303/150‑1 (MQ=255) cAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTc > 2:218707/1‑150 (MQ=255) aCGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCgcca < 2:259601/150‑1 (MQ=255) ttGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTGACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGccagccag < 2:1026468/150‑1 (MQ=255) cTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACa > 1:697620/1‑150 (MQ=255) ttCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACaa > 1:971452/1‑150 (MQ=255) ttCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACaa > 1:971474/1‑150 (MQ=255) cACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAAcg > 1:794052/1‑150 (MQ=255) gACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAAcgc > 2:308512/1‑144 (MQ=255) gACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAAcgc < 1:308512/144‑1 (MQ=255) ccGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGccc > 1:626474/1‑150 (MQ=255) cGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGa > 1:1267109/1‑119 (MQ=255) cGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGa < 2:1267109/119‑1 (MQ=255) ggTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTg > 2:1099882/1‑150 (MQ=255) gATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGACAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCgg > 1:380662/1‑150 (MQ=255) aTGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCggg < 1:1099882/150‑1 (MQ=255) ccgcaggggctggcgcgttgtagctggctggcgagctcgaacaacacctcgtgcgttcgccctggccaagcctggcgcatggccagggcgaTC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGa > 2:1363868‑M2/92‑111 (MQ=255) ccgcaggggctggcgcgttgtagctggctggcgagctcgaacaacacctcgtgcgttcgccctggccaagcctggcgcatggccagggcgaTC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGa < 1:1363868‑M2/20‑1 (MQ=255) gAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGGTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGttt > 1:1335359/1‑150 (MQ=255) ccGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAg > 2:133344/1‑150 (MQ=255) gCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCg > 1:248666/1‑150 (MQ=255) cTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCgg > 2:255543/1‑150 (MQ=255) ttATGCACTCACGCCCTTGCACCAGCGCGCGTCGCTGGATGCACGTATCGCCCTGGGCATGCGCCAAGTTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GGA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGTTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGa < 2:17519/150‑1 (MQ=255) tGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCGGCGGATGa > 1:1192444/1‑150 (MQ=255) cTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACtac < 2:951447/150‑3 (MQ=255) tCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCg > 2:1233357/1‑150 (MQ=255) aCGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGaa > 1:1104511/1‑150 (MQ=255) ccGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGt > 1:778338/1‑150 (MQ=255) gTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTc < 1:132203/150‑1 (MQ=255) gCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCt < 2:248666/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCt > 2:664392/1‑150 (MQ=255) tcgaacaacacctcgtgcgaTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCgg < 1:1363868‑M1/91‑1 (MQ=255) tcgaacaacacctcgtgcgaTCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCgg > 2:1363868‑M1/21‑111 (MQ=255) cgaacaacacctcgtgcgttcgccctggccaagcctggcgcatggccagggcgatACGTGCATGCAGCGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGc > 1:741199‑M2/56‑150 (MQ=255) cTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGaa < 2:925709/150‑1 (MQ=255) cTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGaa < 1:1120535/150‑1 (MQ=255) atgcaCGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCg > 2:251820/1‑150 (MQ=255) tgcaCGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGc > 2:377633/1‑150 (MQ=255) aCGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCGCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGACGcatg > 2:689260/1‑149 (MQ=255) cGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGc < 2:193609/114‑1 (MQ=255) cGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCGTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGc > 1:193609/1‑114 (MQ=255) TCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCgg < 2:269924‑M1/91‑1 (MQ=255) TCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCgg > 1:269924‑M1/1‑91 (MQ=255) GCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGcat > 2:707261‑M1/1‑142 (MQ=255) GCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGcat < 1:707261‑M1/142‑1 (MQ=255) ccctggccaagcctggcgcatggccagggcgaAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGCGGTGTTGTTGGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACACGCGAGCCCATGCAGGTTCGCAGCGGGTGACGTCGAAGGGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCac > 1:1387147‑M2/33‑150 (MQ=255) ccctggccaagcctggcgcatggccagggcgaAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCac > 2:344001‑M2/33‑150 (MQ=255) CCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCac < 1:62288‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCac < 2:100079‑M1/150‑1 (MQ=255) cctggccaagcctggcgcatggccagggcgaAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGcc > 1:508343‑M2/32‑136 (MQ=255) cctggccaagcctggcgcatggccagggcgaAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGcc < 2:508343‑M2/105‑1 (MQ=255) cctggccaagcctggcgcatggccagggcgaAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCacg < 1:344001‑M2/119‑1 (MQ=255) CCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCacg < 1:21627‑M1/150‑1 (MQ=255) ctggccaagcctggcgcatggccagggcgaAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCgccagcc > 2:1277505‑M2/31‑61 (MQ=255) ctggccaagcctggcgcatggccagggcgaAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCgccagcc < 1:1277505‑M2/31‑1 (MQ=255) tggccaagcctggcgcatggccagggcgaAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCacgcg > 1:444081‑M2/30‑150 (MQ=255) gccaagcctggcgcatggccagggcgaAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTgttgtt < 1:744448‑M2/17‑1 (MQ=255) gccaagcctggcgcatggccagggcgaAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTgttgtt > 2:744448‑M2/28‑44 (MQ=255) tGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCgg < 1:377633/150‑1 (MQ=255) tGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCgg < 2:21627/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCGGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCGTGCGCACGCGACGCggg < 2:1192444/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCggg > 1:519011/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCggg < 1:218707/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTGGGTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCGGGCAc > 1:963826/1‑150 (MQ=255) cAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCGGGCAcc > 1:1060102/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GTA‑TGTTGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCGGGCACCTTCGa < 2:1327290/150‑1 (MQ=255) ttGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGAACCGGGAACCTTCGa < 2:380662/150‑1 (MQ=255) cgaAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACACCGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATgcgc > 1:321763‑M2/4‑119 (MQ=255) cgaAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATgcgc < 2:321763‑M2/116‑1 (MQ=255) aC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTg > 1:1183315/1‑74 (MQ=255) aC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTg < 2:1183315/74‑1 (MQ=255) | GCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCACCAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAAC‑‑‑‑‑‑GCA‑CGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCGGGCACCTTCGA > NC_002947/5981344‑5981627 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |