| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5983519 | 56 (1.070) | 3 (0.060) | 3/238 | NT | 4.9% | coding (4108/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | = 5983556 | 62 (1.220) | coding (4145/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGCTGCACGTGAGCATGGACAACTGCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAG > NC_002947/5983379‑5983665 | ggCTGCACGTGAGCATGGACAACTGCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGgcgc < 2:231378/150‑1 (MQ=255) tcatcATGGACAACTGCCAGAAGTTCATGACCCAAGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCTCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAAGGCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGccc < 1:690820/146‑1 (MQ=255) aaCTGCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCtg > 1:705975/1‑150 (MQ=255) aatGCCAAAAGATCGTGACCCATGCATCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCtgt < 2:80125/148‑1 (MQ=255) gCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAACCCGCTGGAGCTCGGCGATGTCCTCAGTGAGTTCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGtgcc < 1:173614/150‑1 (MQ=255) ccAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGtgcct > 1:904403/1‑150 (MQ=255) cAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAg < 2:307706/120‑1 (MQ=255) cAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAg > 1:307706/1‑120 (MQ=255) ttCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctg > 2:459517‑M2/1‑146 (MQ=255) ttCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctg > 2:565888‑M2/1‑146 (MQ=255) ttCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctg > 2:793109‑M2/1‑146 (MQ=255) cATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcgcgcctgcagctgtt < 2:951750‑M1/150‑44 (MQ=255) aCCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGt > 2:1288626/1‑150 (MQ=255) aCCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGt < 2:1425801/150‑1 (MQ=255) cGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTg < 2:1259056/119‑1 (MQ=255) cGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTg > 1:1259056/1‑119 (MQ=255) ggTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTgg < 1:181647/128‑1 (MQ=255) ggTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTgg > 2:181647/1‑128 (MQ=255) gTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGc < 1:1288626/150‑1 (MQ=255) caACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCCTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGgt < 1:1036066/150‑1 (MQ=255) acacCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAggg > 2:787718/1‑130 (MQ=255) acacCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAggg < 1:787718/130‑1 (MQ=255) acacCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGgtgt > 1:743851/1‑150 (MQ=255) caccaTGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCt > 1:371754/1‑150 (MQ=255) ccaTGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTgg < 2:1173560/150‑1 (MQ=255) caTGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGa > 1:1344853/1‑150 (MQ=255) tGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGTCGTGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGaaa > 1:674462/1‑150 (MQ=255) cgcACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAAc < 2:248882/150‑1 (MQ=255) gcACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAAcc > 2:1419763/1‑150 (MQ=255) ccGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTg > 1:476729/1‑139 (MQ=255) ccGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTg < 2:476729/139‑1 (MQ=255) ccGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGcc < 2:34858/149‑1 (MQ=255) ccGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGcc > 1:34858/1‑149 (MQ=255) ccGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCt > 1:1130443/1‑150 (MQ=255) gCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATc > 1:387884/1‑107 (MQ=255) gCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATc < 2:387884/107‑1 (MQ=255) cTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAAc < 2:320278/150‑1 (MQ=255) gTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGTAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCCACCTg > 1:477510/1‑150 (MQ=255) gCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCg < 1:1103929/132‑1 (MQ=255) gCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCg > 2:1103929/1‑132 (MQ=255) cAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCgg < 2:282215/150‑1 (MQ=255) aaCGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGc > 2:911154/1‑150 (MQ=255) aCGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCa < 2:937403/150‑1 (MQ=255) aCGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCa < 1:1419763/150‑1 (MQ=255) ccTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcgcgcctgcag < 1:515230‑M1/73‑39 (MQ=255) ccTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcgcgcctgcag > 2:515230‑M1/1‑35 (MQ=255) cTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTg > 2:965359/1‑111 (MQ=255) cTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTg < 1:965359/111‑1 (MQ=255) cTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCGCAACGCGTTCGGCAGTCAgcgc > 2:125239/1‑150 (MQ=255) agtgagtgCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTg > 2:21205/1‑150 (MQ=255) tgagtgCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAgg < 2:371123/80‑1 (MQ=255) tgagtgCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAgg > 1:371123/1‑80 (MQ=255) gtgCCCGGAGTGCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCTTGCGGATCGGCCTGGTGTACGTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCAt > 2:920727/1‑150 (MQ=255) ccGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTg > 2:919257/1‑150 (MQ=255) cGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTgg < 2:705975/150‑1 (MQ=255) cGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGACTGGGTTACCTGTAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTgg < 2:904403/150‑1 (MQ=255) aGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGaaa < 2:947827/150‑1 (MQ=255) cTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAACcct > 1:596848/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcctc > 1:642306/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcctc > 1:8928/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGATGGAAATcctc > 1:63892/1‑150 (MQ=255) ccGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcctcgc < 2:517227/150‑1 (MQ=255) ccAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcctcgcctc < 2:8928/150‑1 (MQ=255) cAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGAGCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcctcgcctcg > 2:1268638/1‑150 (MQ=255) aaCAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgcgggtgcgcatggtggtgttgatgaccgacaacggtgcctgggtcatg < 2:951750‑M2/150‑108 (MQ=255) aCAGCTGTAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCgca < 2:477510/150‑1 (MQ=255) aCAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcc > 2:1263543/1‑140 (MQ=255) aCAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcc < 1:1263543/140‑1 (MQ=255) cAGCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcgcgcctgcagctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgcgggtgcgcatggtggtgttgatgaccgacaacggtgcctgggtcatgaa > 2:793109‑M1/1‑4 (MQ=255) cAGCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcgcgcctgcagctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgcgggtgcgcatggtggtgttgatgaccgacaacggtgcctgggtcatgaa > 2:565888‑M1/1‑4 (MQ=255) cAGCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcgcgcctgcagctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgcgggtgcgcatggtggtgttgatgaccgacaacggtgcctgggtcatgaa > 2:459517‑M1/1‑4 (MQ=255) cTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagg < 1:515230‑M2/73‑36 (MQ=255) cTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagg > 2:515230‑M2/1‑38 (MQ=255) | GGCTGCACGTGAGCATGGACAACTGCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAG > NC_002947/5983379‑5983665 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |