New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2651868 = | 64 (1.220) | 4 (0.080) | 4/238 | NT | 5.5% | coding (593/1113 nt) | aroF‑I | tyr‑sensitive phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
? | NC_002947 | 2651914 = | 75 (1.480) | coding (547/1113 nt) | aroF‑I | tyr‑sensitive phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
ACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCAGGCCGTCCT > NC_002947/2651769‑2652063 | acGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTTCGAt > 2:334139/1‑150 (MQ=255) acGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTTCGAt > 2:1303028/1‑150 (MQ=255) acGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTATGTTTGCgct > 1:1308494/1‑148 (MQ=255) gccgccTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTc > 1:422988/1‑150 (MQ=255) gccgccTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGAACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTc > 2:1181765/1‑150 (MQ=255) ccgccTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCg > 1:205751/1‑150 (MQ=255) cgccTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGTCTGCCATCGGTGCCGTTCTTGAAACCCACCGCCGCGCACAGGCACGAGCCCATCTCGCGGAGTGTTTTCGATTCgg > 2:558972/1‑150 (MQ=255) cTTCCTGGTTGATGCTCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGCCACCGACCGCAGGTCATTGATGGCAACTGTCAGGCCTCCATCGGTACCGGTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCggtgg > 2:374752/1‑150 (MQ=255) ccTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTCCCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCggtg > 2:599639/1‑146 (MQ=255) ccTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCggtg < 1:599639/146‑1 (MQ=255) tGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCgg > 2:918337/1‑150 (MQ=255) ggTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCggg < 1:918337/150‑1 (MQ=255) gaagcgctcgacccgatttcgccgcagtacctgcaagacctgatcagctggtcggccatcggtgcccgcaccaccgaatcgcAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTc > 1:1166266‑M1/83‑135 (MQ=255) gaagcgctcgacccgatttcgccgcagtacctgcaagacctgatcagctggtcggccatcggtgcccgcaccaccgaatcgcAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTc < 2:1166266‑M1/53‑1 (MQ=255) tGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGa > 2:501381/1‑150 (MQ=255) cccAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGCCTGCAGGGAATTGATGCCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATg < 2:311309/150‑1 (MQ=255) ccAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATgg > 2:1394684/1‑150 (MQ=255) aGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGcc > 2:362300/1‑150 (MQ=255) aGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGcc > 2:493969/1‑150 (MQ=255) aGGAAGCGGGGCGGCTTGGACACCGTCTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGcc < 1:1136426/150‑1 (MQ=255) aaGCGGCGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGAc < 2:35942/150‑1 (MQ=255) cGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAg > 2:626803/1‑150 (MQ=255) cGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAg < 2:1419370/150‑1 (MQ=255) gCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCa < 1:262572/150‑1 (MQ=255) cTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAg < 2:1076775/150‑1 (MQ=255) gACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCt > 2:1263126/1‑150 (MQ=255) acacCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCtt > 1:396125/1‑150 (MQ=255) cacCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTg > 1:627454/1‑150 (MQ=255) acCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGc < 1:732029/150‑1 (MQ=255) gACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAgg > 2:1189356/1‑150 (MQ=255) gACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAgg < 2:592771/150‑1 (MQ=255) ggCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTgcgg > 1:64210/1‑150 (MQ=255) ggCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTgcgg < 1:1345630/150‑1 (MQ=255) gCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTgcggc < 2:396125/150‑1 (MQ=255) tGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGaaa > 2:1241397/1‑150 (MQ=255) tGGCAACGGTCAGACCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCg > 2:414730/1‑150 (MQ=255) ggCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCgg < 2:64210/150‑1 (MQ=255) tcAACGCTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCTGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCggg < 1:1213581/149‑1 (MQ=255) 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cgGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGc < 1:1189356/150‑1 (MQ=255) gtgtgtTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCAg > 1:251198/1‑150 (MQ=255) tgtgtTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCAgg < 2:251198/150‑1 (MQ=255) tttGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCgg < 1:929450‑M2/70‑1 (MQ=255) tttGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCgg > 2:929450‑M2/4‑73 (MQ=255) gCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGACCCTTGCGGCCGATGTGCAGGCCGTCCt < 1:903098/150‑1 (MQ=255) | ACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCAGGCCGTCCT > NC_002947/2651769‑2652063 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |