| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2832716 = | 69 (1.310) | 10 (0.200) | 8/232 | NT | 14.1% | intergenic (‑21/+46) | PP_2485/PP_2486 | hypothetical protein/Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | 2832764 = | 57 (1.150) | coding (1123/1125 nt) | PP_2486 | Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase | |||||
CCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTC > NC_002947/2832615‑2832911 | cgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTa > 1:437296‑M1/102‑150 (MQ=255)cgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTa > 1:832145‑M1/102‑150 (MQ=255)cccAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTa < 2:570032/150‑1 (MQ=255)cccAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTa < 1:480263/150‑1 (MQ=255) gctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAg > 1:407592‑M1/101‑150 (MQ=255) gctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAg > 2:736777‑M1/101‑150 (MQ=255) ccAAGGCTTAGAGGTCCCTGCGTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAg < 2:227519/150‑1 (MQ=255) taaGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAgg > 2:272934/2‑150 (MQ=255) tcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGa > 1:1419131‑M1/99‑150 (MQ=255) gCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGAttt < 1:272934/150‑1 (MQ=255) gACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCg < 2:487928/150‑1 (MQ=255) cccTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCggg < 1:160020/150‑1 (MQ=255) cctgAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGAAAACGCTGAGCCACAACTCTGAGTTATGTGTAGTCGGATTTAGCGTTAAGGAGTTGTAAGTGGGGTAGTc > 2:447683/1‑150 (MQ=255) ctgAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCg < 2:1155610/150‑1 (MQ=255) ctgAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCAGCAAGTCg > 2:360616/1‑150 (MQ=255) tgAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTa > 2:950669/1‑127 (MQ=255) tgAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTa < 1:950669/127‑1 (MQ=255) tgAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCgg < 1:429047/150‑1 (MQ=255) gAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGgt < 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gATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTgg > 2:281389/1‑150 (MQ=255) tGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCggg < 2:145233/101‑1 (MQ=255) tGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCggg > 1:145233/1‑101 (MQ=255) gCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAAc < 1:281389/150‑1 (MQ=255) gCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACACCCGAAAGTTTTAGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAAc > 2:904386/1‑150 (MQ=255) tCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTGGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGAt > 2:697766/1‑144 (MQ=255) 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ctaaacgctcaatgccacgccccataactcaggggcgtggctcagcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGc > 1:407592‑M2/51‑150 (MQ=255) taaacgctcaatgccacgccccataactcaggggcgtggctcagcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCg > 1:437296‑M2/50‑150 (MQ=255) taaacgctcaatgccacgccccataactcaggggcgtggctcagcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCg > 1:832145‑M2/50‑150 (MQ=255) GCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTgg > 1:1199009‑M1/1‑134 (MQ=255) GCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTgg < 2:1199009‑M1/134‑1 (MQ=255) aatgccacgccccataactcaggggcgtggcattgagcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGa < 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ggggCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGGTCGCAATGAAGGGGc > 1:40078/1‑150 (MQ=255) caggggcgtggctcagcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGc < 2:407592‑M2/129‑1 (MQ=255) ggCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGa < 2:1258145/150‑1 (MQ=255) gCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGAc < 1:1024902/150‑1 (MQ=255) gCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCTACCaaaa < 1:904386/150‑1 (MQ=255) cATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAg < 2:461573/150‑1 (MQ=255) aTTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGc > 1:1321464/1‑150 (MQ=255) gcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCa < 2:1216359‑M2/144‑1 (MQ=255) gcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCa < 2:832145‑M2/144‑1 (MQ=255) gcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCa < 1:1098499‑M2/144‑1 (MQ=255) gtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCggg < 1:787559‑M2/112‑1 (MQ=255) gtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCggg > 2:787559‑M2/5‑116 (MQ=255) ttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTGATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGGTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGTTTCGCAATGCAGGGGCTACCAAAAGCGATCAGGTc < 2:559981‑M2/148‑1 (MQ=255) | CCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTG‑CTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTC > NC_002947/2832615‑2832911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |