New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3078868 = | 49 (0.930) | 3 (0.060) | 3/226 | NT | 6.3% | coding (441/1410 nt) | PP_2688 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3078940 = | 44 (0.910) | coding (369/1410 nt) | PP_2688 | hypothetical protein |
TTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGTTGAATGCAGCCACGCTCGACCGTGCGCCATTCG > NC_002947/3078793‑3079075 | ttCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATTGCGCGCTGGTAGcc > 2:1150718/1‑150 (MQ=255) tCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGccc < 1:1150718/150‑1 (MQ=255) aTGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTg < 2:567146/150‑1 (MQ=255) aTGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTg > 2:448040/1‑150 (MQ=255) aTGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTg > 1:445087/1‑150 (MQ=255) aGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCa < 2:810131/150‑1 (MQ=255) aGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCa < 2:445087/150‑1 (MQ=255) gggggTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTgg < 1:1072733/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCggta < 1:524528/150‑3 (MQ=255) gcAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGgatga > 2:631870/1‑150 (MQ=255) ccAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAATGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTgt > 2:91824/1‑149 (MQ=255) cAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTgag > 2:425074/1‑150 (MQ=255) cACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAAt < 1:631870/150‑1 (MQ=255) cACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAAt < 2:598102/150‑1 (MQ=255) aaGTAGCTGCCAACGCCGTCACGTACCAGAGCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCACGCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGt < 1:91824/150‑1 (MQ=255) ccATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTgg > 1:1372554/1‑150 (MQ=255) tCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAg > 1:473665/1‑150 (MQ=255) gTCACGTACCAGATCGACACCGGCCATATGCGCATACAGCCCACGGTGGAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGTGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGtc > 1:470932/1‑150 (MQ=255) tCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGtcc > 2:11850/1‑150 (MQ=255) aCGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGtcctc < 1:767143/150‑1 (MQ=255) taccagatcgccatgcagggcctggaccttcaccgtgggctgtatgcgcatattgccggtgtcgatctggtaGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCg < 2:1406007‑M2/54‑1 (MQ=255) taccagatcgccatgcagggcctggaccttcaccgtgggctgtatgcgcatattgccggtgtcgatctggtaGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCg > 1:1406007‑M2/73‑126 (MQ=255) TCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAgg > 1:425074‑M1/1‑150 (MQ=255) ccatgcagggcctggaccttcaccgtgggctgtatgcgcatattgccggtgtcgatctggtaGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTc > 1:1144657‑M2/63‑150 (MQ=255) acCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAg > 2:191083/1‑150 (MQ=255) acCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAg > 2:914142/1‑150 (MQ=255) acCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGGAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAg > 2:1301540/1‑150 (MQ=255) cGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAgcg > 2:1303505/1‑150 (MQ=255) gCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAg < 1:1024863/140‑1 (MQ=255) gCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAg > 2:1024863/1‑140 (MQ=255) cATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGtt < 1:11850/150‑1 (MQ=255) cATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCACGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGtt < 1:1405271/150‑1 (MQ=255) tACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTgg < 1:459812/108‑1 (MQ=255) tACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTgg > 2:459812/1‑108 (MQ=255) tACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACACGTTCAGCGCCTGTACCCGTTGa > 2:662719/1‑150 (MQ=255) cAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGTTGAAt < 2:720854/150‑1 (MQ=255) cccACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCTTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGAt < 1:548219/108‑1 (MQ=255) cccACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGAt > 2:548219/1‑108 (MQ=255) ccACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGTTGAATGCAg > 1:166323/1‑150 (MQ=255) cACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGtcctc < 1:1322677/112‑1 (MQ=255) cACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGtcctc > 2:1322677/1‑112 (MQ=255) tGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGTTGAATGCAGCCACGc < 1:1303505/150‑1 (MQ=255) tGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGTTGAATGCAGCCACGc < 2:473665/150‑1 (MQ=255) gAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTg > 2:434158/1‑94 (MQ=255) gAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTg < 1:434158/94‑1 (MQ=255) gTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGTTGAATGCAGCCACGCt < 2:640619/146‑1 (MQ=255) gTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGTTGAATGCAGCCACGCt > 1:640619/1‑146 (MQ=255) ccTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGTTGAATGCAGCCACGCTCGACCGTGCGcc > 1:130081/1‑150 (MQ=255) cTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGtt > 2:699818/1‑122 (MQ=255) cTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGtt < 1:699818/122‑1 (MQ=255) cATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGtcctcc > 1:1390074/1‑91 (MQ=255) cATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGtcctcc < 2:1390074/91‑1 (MQ=255) aTGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGTTGAATGCAGCCACGCTCGACCGTGCGCCATTCg > 2:524162/1‑150 (MQ=255) gtaGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCTGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGa < 2:902289‑M2/68‑1 (MQ=255) gtaGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCTGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGa > 1:902289‑M2/4‑71 (MQ=255) gtaGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGtt > 2:1291493‑M2/4‑107 (MQ=255) gtaGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGtt < 1:1291493‑M2/104‑1 (MQ=255) | TTCGAGCATGTAGCTGACGCCGCTGGGGGTGCGCAGGTTGTCTTCCAGCACGAAGTAGCTGCCATCGCCGTCACGTACCAGATCGACACCGGCAATATGCGCATACAGCCCACGGTGAAGGTCCAGGCCCTGCATGGCGATCTGGTAGCCCTCGTTGGCCAGCACTTGCTCTGGCGGGATGATGCCGGCCTTGAGAATGCGTTGGTCGTGGTAGATGTCCTCCAGGAACAGGTTCAGCGCCTGTACCCGTTGAATGCAGCCACGCTCGACCGTGCGCCATTCG > NC_002947/3078793‑3079075 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |