New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4294641 | 31 (0.590) | 3 (0.060) | 3/238 | NT | 7.9% | coding (776/1302 nt) | opdN | outer‑membrane porin D |
? | NC_002947 | = 4294679 | 40 (0.790) | coding (738/1302 nt) | opdN | outer‑membrane porin D |
TGTAGCCAAGCATGCCGCTGAAGGCGCGATGGTCGATTTCGCCCGCACGGGCATTGCCGATGTCATCACTCTTGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCTTGCAGTGCACGCGGATGTCCTGG > NC_002947/4294534‑4294823 | tGTAGCCAAGCATGCCGCTGAAGGCGCGATGGTCGATTTCGCCCGCACGGGCATTGCCGATGTCATCACTCTTGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGcggt < 2:1408566‑M2/150‑5 (MQ=255) tGCCGCTGAAGGCGCGATGGTCGATTTCGCCCGCACGGGCATTGCCGATGTCATCACTCTTGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCa < 1:918443/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGAAGGCGCGATGGTCGATTTCGCCCGCACGGGCATTGCCGATGTCATCACTCTTGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAg < 1:694208/150‑1 (MQ=255) cGCTGAAGGCGCGATGGTCGATTTCGCCCGCACGGGCATTGCCGATGTCATCACTCTTGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCt > 1:852464/1‑150 (MQ=255) gATGGTCGATTTCGCCCGCACGGGCATTGCCGATGTCATCACTCTTGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGt > 1:1165426/1‑150 (MQ=255) gATGGTCGATTTCGCCCGCACGGGCATTGCCGATGTAATCACTCTTAGTCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGt > 2:984814/1‑150 (MQ=255) gCACGGGCATTGCCGATGTCATCACTCTTGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGc > 2:809468/1‑150 (MQ=255) gATGTCATCTCTTTTTATCAGTCGCATGTAAGCCGAAAGTCTGCACACCGGCAGCGGCTGTCTGCCTACCAGGCCGTGTAACTGCTTGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTAATGGGCGCCGAAACGCTCGTCGAAACGGTa < 2:79975/150‑1 (MQ=255) gATGTCATCACTTTTGATCAGGCGGATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTa < 2:329441/150‑1 (MQ=255) tcaCTCTTGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGaca > 2:686877/1‑150 (MQ=255) tcaCTCTTGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGaca > 1:417839/1‑150 (MQ=255) aCTCTTGATCAGGCGCATGTCGGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGgc > 2:1272433/1‑117 (MQ=255) aCTCTTGATCAGGCGCATGTCGGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGgc < 1:1272433/117‑1 (MQ=255) ttGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACgg < 2:548116/135‑1 (MQ=255) ttGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACgg > 1:548116/1‑135 (MQ=255) ttGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGcc > 2:1117149/1‑150 (MQ=255) gATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAg > 1:78254/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGt < 1:809468/150‑1 (MQ=255) gcgcATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGc > 1:203195‑M2/1‑67 (MQ=255) gcgcATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGc < 2:203195‑M2/68‑2 (MQ=255) gcgcATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGaa < 1:1117149/150‑1 (MQ=255) aGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGcggtgggcagcctgtcggctgacatgcgcctgatcaagagtgatgacatcggcaatgcccgtgcgggcgaaatcgaccatcgcgccttcagc < 2:597442‑M2/150‑93 (MQ=255) gACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCtggc < 1:984814/150‑4 (MQ=255) gACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACGTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCg < 1:992661/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTCACCGGCAGTGGCTTACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTAt < 1:92609/150‑1 (MQ=255) tGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCgg > 1:767526/1‑149 (MQ=255) cccACCGGCAGCGGCCGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAg < 1:1346716/150‑1 (MQ=255) ccACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGcggtgggcagcctgtcggctgacatgcgcctgatcaagagtgatgacatcggcaatgcccgtgcgggcgaaatcgaccatcgcgccttcagcggcatgcttggcta < 1:545406‑M2/150‑107 (MQ=255) cagcGGCAACGGCTGACTGGACACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGACCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGc > 2:413865/4‑150 (MQ=255) cACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAAc > 1:1016820/1‑89 (MQ=255) cACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAAc < 2:1016820/89‑1 (MQ=255) gCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGcggtgggcagcctgtcggctgacatgcgcctgatcaagagtgatgacatcggcaatgcccgtgcgggcgaaatcgaccatcgcgccttcagcggcatgcttggctacagcct < 2:1210312‑M2/150‑113 (MQ=255) cGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCtt < 1:586943/150‑1 (MQ=255) gCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGt < 1:1408566/150‑1 (MQ=255) tGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCCTGTTc > 1:842173/1‑150 (MQ=255) gACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCt > 1:683022/1‑150 (MQ=255) tGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCTTGc > 1:528818/1‑150 (MQ=255) tGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCTTGc > 2:1242679/1‑150 (MQ=255) tGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCTTGc > 1:39595/1‑150 (MQ=255) tGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCTTGc > 2:790584/1‑150 (MQ=255) gCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCTTGCAg > 2:815926/1‑150 (MQ=255) caccaGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCTTGCAGTg < 2:852464/150‑1 (MQ=255) accaGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCTTGCAGTGc > 1:286763/1‑150 (MQ=255) accaGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCTTGCAGTGc > 2:961272/1‑150 (MQ=255) cGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCTTGCAGTGCACGCGGa > 2:195630/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCTTGCAGTGCACGCGGATGTCCTgg < 2:767526/150‑1 (MQ=255) | TGTAGCCAAGCATGCCGCTGAAGGCGCGATGGTCGATTTCGCCCGCACGGGCATTGCCGATGTCATCACTCTTGATCAGGCGCATGTCAGCCGACAGGCTGCCCACCGGCAGCGGCTGACTGGCCACCAGGCCGAGGAAGTGCTGGCGGTAGATATTCTCCAGCTTGGCCACTTGGTACTGGGCGCTGAAACGCTCGTTGAAACGGTAGTCGACACCGGCCAGGTCGAAGTGGTCGGCTTCGGTATCGCAGGCATAACGCTTGTTCTTGCAGTGCACGCGGATGTCCTGG > NC_002947/4294534‑4294823 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |