New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4974042 = | 72 (1.370) | 5 (0.100) | 4/234 | NT | 7.1% | coding (1607/2043 nt) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
? | NC_002947 | 4974073 = | 63 (1.260) | coding (1576/2043 nt) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
CGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATC > NC_002947/4973927‑4974209 | cgcgtggtgttcgacgctgccagcggtggatcccagggctacaagctgttcgacgccaagggtacccagattggtaccggcagcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccaTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGa > 2:254664‑M1/116‑150 (MQ=255) ccTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATGCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGGATCGGCACGGCGATGGACa > 1:446714/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACaa > 1:1408596/1‑150 (MQ=255) ttGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAAc > 2:644559/1‑150 (MQ=255) ncGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCNGTCATTGGNCGCAGGGCTNCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATACAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAACATAGGCACGGGGATGGACAACtgg > 1:478836/2‑148 (MQ=255) gTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGAc > 1:1253919/1‑142 (MQ=255) gTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGAc < 2:1253919/142‑1 (MQ=255) gTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACttgtt > 2:894802/1‑150 (MQ=255) ggCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTc < 2:1408596/150‑1 (MQ=255) ggCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTc < 1:644559/150‑1 (MQ=255) ggCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTc < 1:1321611/150‑1 (MQ=255) ggCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACAAGTTGTc < 2:1030632/150‑1 (MQ=255) cATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACAAGTTGTcca < 1:1353901/150‑2 (MQ=255) cagcggtggctcccagggctacaagctgttcgacgccaagggtacccagattggtaccggcagcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccaTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGAt < 1:1291429‑M1/32‑1 (MQ=255) cagcggtggctcccagggctacaagctgttcgacgccaagggtacccagattggtaccggcagcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccaTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGAt > 2:1291429‑M1/96‑127 (MQ=255) cagcggtggctcccagggctacaagctgttcgacgccaagggtacccagattggtaccggcagcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccaTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATgg > 2:1081614‑M1/96‑129 (MQ=255) cagcggtggctcccagggctacaagctgttcgacgccaagggtacccagattggtaccggcagcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccaTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATgg < 1:1081614‑M1/34‑1 (MQ=255) aCGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAg < 1:911777/150‑1 (MQ=255) aCAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCt > 2:271162/1‑141 (MQ=255) aCAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCt < 1:271162/141‑1 (MQ=255) tAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACttgtt < 1:1032254/130‑1 (MQ=255) tAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACttgtt > 2:1032254/1‑130 (MQ=255) tAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGc < 1:455540/150‑1 (MQ=255) tAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGc > 2:640397/1‑150 (MQ=255) tCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTa > 1:203983/1‑150 (MQ=255) tCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTa < 1:640397/150‑1 (MQ=255) cATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTAc < 1:554737/150‑1 (MQ=255) cATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTAc < 2:1127753/150‑1 (MQ=255) aTTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATgc > 2:1279192/1‑109 (MQ=255) aTTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATgc < 1:1279192/110‑2 (MQ=255) aTTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCCCCACCCTGCCGGTAcc > 2:483938/1‑150 (MQ=255) aTTGGCCGCAGGGATGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTAcc > 2:1059442/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTgg < 1:894802/150‑1 (MQ=255) gggCTGCCACCGATTCTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGCTTCCTTGTATTATCCAGTATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGCACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTa < 2:37302/150‑1 (MQ=255) gCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCtt < 2:203983/150‑1 (MQ=255) ccACCGATTGTGGTCTCGGCGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTg > 1:321118/1‑150 (MQ=255) ccACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTg < 2:1104610/150‑1 (MQ=255) gtgGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAAc < 1:778122/150‑1 (MQ=255) tctcGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCt > 1:1412235/1‑126 (MQ=255) tctcGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCt < 2:1412235/126‑1 (MQ=255) ctcGACGGAAAAGGTTGGTGTTTTTCCTCTACCATCCAGAAGCGGGTCGCCGTCCGCATCTAGCATCGGCACTTCGATGGACAACTTGCTTTCCTTCTCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCtt < 2:275961/150‑1 (MQ=255) tcGACGTCAAAGGGACGCGGGTTACGGCTTGCATCCAGAGTCGGGTCTCCGGCCGCCTCCAGGACCGGCACGACTCTGGACAACTAGTTGTCCTGCCCAGGGACAACGCTGACGGTACCAACCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCttt > 2:239994/1‑149 (MQ=255) tcGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTg > 2:985372/1‑150 (MQ=255) gACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTa > 1:1008149/1‑150 (MQ=255) aCGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAg < 2:1202639/150‑1 (MQ=255) gCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCCACCAGCATGGGCACGGCCATGGGCAACATGTTGTCCTGCCAAGGGACCGCGCTGCCAGGACCAATCTGTGTCCCCTTGACGTCGATCAGCTTGTAGccc > 2:499618/1‑150 (MQ=255) aaaGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTg > 1:948519/1‑150 (MQ=255) ggTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGa > 2:1360130/1‑150 (MQ=255) gTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTa < 1:1321902/140‑1 (MQ=255) gTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTa > 2:1321902/1‑140 (MQ=255) gggTTACCGCTACCATCCAGAATCTGGTCGCCGGCAGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGGCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGGGCCACCg > 1:472869/1‑150 (MQ=255) ttACCGCTACCATCCAGCATCGGGCCGCCGGCAGCAACCCGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTg < 2:1008149/150‑1 (MQ=255) tACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGt > 2:1360335/1‑150 (MQ=255) aTCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTa < 2:578877/85‑1 (MQ=255) aTCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTa > 1:578877/1‑85 (MQ=255) tCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGaa < 2:408197/110‑1 (MQ=255) tCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGaa > 1:408197/1‑110 (MQ=255) tCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTCTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAac < 1:1360130/150‑1 (MQ=255) aGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATATGGGTCCCCGTGTCGTGGAACAGCTTGTAGCTCTGGGAGCCACCGCTGGCCGCGTCGAAcacc > 2:336992/1‑150 (MQ=255) aaTCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAAcaccac < 1:1059442/150‑1 (MQ=255) tccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgaTGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGATCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCAcgcg > 2:254664‑M2/36‑150 (MQ=255) ccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgaTGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTg < 1:1081614‑M2/95‑1 (MQ=255) ccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgaTGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTg > 2:1081614‑M2/35‑129 (MQ=255) atcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgaTGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTg > 2:1291429‑M2/33‑127 (MQ=255) atcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgaTGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTg < 1:1291429‑M2/95‑1 (MQ=255) CGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCg > 2:948519‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGACACCTCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGGCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCAt > 1:1155382‑M1/1‑150 (MQ=255) gccgCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATc > 1:517912/1‑150 (MQ=255) gccgCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTAGAACACCACGCGTACCGGCATc > 2:617654/1‑150 (MQ=255) cgCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTgg < 1:796256/73‑1 (MQ=255) cgCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTgg > 2:796256/1‑73 (MQ=255) gCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaa < 2:321118/150‑1 (MQ=255) cATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGaa < 2:516377/88‑1 (MQ=255) cATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGaa > 1:516377/1‑88 (MQ=255) cAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatcgcg < 1:1103369/150‑1 (MQ=255) aGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatcgcga > 1:1167469/1‑150 (MQ=255) gCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatcgcgaa > 1:1109276/1‑150 (MQ=255) cATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatcgcgaat < 1:617654/150‑1 (MQ=255) aTCGGAACGGAGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGATGCCGGTAGCAATCTGGGTCCCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATcgaatcgcgaatc < 2:293188/150‑1 (MQ=255) gCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGa < 2:717481/94‑1 (MQ=255) gCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGa > 1:717481/1‑94 (MQ=255) | CGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATGGACAACTTGTTGTCCTGCCCAGGCACCACGCTGCCGGTACCAATCTGGGTACCCTTGGCGTCGAACAGCTTGTAGCCCTGGGAGCCACCGCTGGCAGCGTCGAACACCACGCGTACCGGCATCGAATCGCGAATC > NC_002947/4973927‑4974209 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |