New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5295536 = | 67 (1.270) | 5 (0.100) | 5/232 | NT | 8.4% | intergenic (+19/+107) | PP_4668/PP_4669 | LysR family transcriptional regulator/OmpA family protein |
? | NC_002947 | 5295619 = | 46 (0.930) | intergenic (+102/+24) | PP_4668/PP_4669 | LysR family transcriptional regulator/OmpA family protein |
CCGTTGTTGATGGGGCAAACCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCACGGCTCTGAATGTTCTGTGCCTGCATGCCAA > NC_002947/5295470‑5295767 | ccGTTGTTGATGGGGCAAACCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTa > 2:316255/1‑150 (MQ=255) cGTTGTTGATGGGGCAAACCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTAt < 1:1104825/150‑1 (MQ=255) cGTTGTTGATGGGGCAAACCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTAt < 1:487069/150‑1 (MQ=255) cGTTGTTGATGGGGCAAACCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTAt < 1:1266432/150‑1 (MQ=255) gATGGGGCAAACCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTAtgt > 2:782861/1‑145 (MQ=255) gATGGGGCAAACCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTAtgt < 1:782861/145‑1 (MQ=255) aTGGGGCAAACCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGc < 1:44236/150‑1 (MQ=255) aTGGGGCAAACCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGc > 2:544500/1‑150 (MQ=255) aTGGGGCAAACCCGCGAGATACGCTTTGCCCAGGACTGATGGTCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGAGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGGTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGc > 2:448289/1‑150 (MQ=255) gggCAAACCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCACCATGTAGAAGAGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCTAATCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCg > 2:871626/1‑150 (MQ=39) aaaCCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACa > 2:1114005/1‑141 (MQ=255) aaaCCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACa < 1:1114005/141‑1 (MQ=255) gaTGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCa < 2:1326292/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGtg < 1:205860/150‑2 (MQ=255) cTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCTATCGGCGACGATCAGTAGGa < 2:204913/150‑1 (MQ=255) tGCCCAGCACTTTTGAGCCTGCGCTTTTCCGACCCCTCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCGGCGAACACCGGCGAACCCGCTGCCATACTCCGCGTTGCCCGCGCCTACAGTGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTATCACGc < 1:297586/150‑1 (MQ=255) cccAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTa > 1:496648/1‑150 (MQ=255) aGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTa < 2:628092/139‑1 (MQ=255) aGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTa > 1:628092/1‑139 (MQ=255) aTGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGa > 1:420730/1‑150 (MQ=255) gggCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGaca < 2:19946/150‑1 (MQ=255) gcgcATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGAc < 1:4692/150‑1 (MQ=255) gcgcATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGAc > 1:1387050/1‑150 (MQ=255) gcgcATTTCCGACCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCCTGGCCCGCGCCTACAGGGGGCTCTGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGGTGGACACCCGAc > 2:1271749/1‑150 (MQ=38) aTTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACg > 1:1114417/1‑147 (MQ=255) aTTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACg < 2:1114417/147‑1 (MQ=255) tCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTtctc < 1:544500/150‑1 (MQ=255) cccGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAATCGCGTCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTtctc < 1:448289/149‑1 (MQ=255) gAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGt > 2:926174/1‑150 (MQ=255) gccccctgtaggcgcgggcaacgcggtgtctggcaccggcttcgccggtgttcgcgggcaagcccgcttctacagggggctATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTa > 1:32943‑M2/82‑111 (MQ=255) gccccctgtaggcgcgggcaacgcggtgtctggcaccggcttcgccggtgttcgcgggcaagcccgcttctacagggggctATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTa < 2:32943‑M2/30‑1 (MQ=255) CCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCa > 2:649868‑M1/1‑122 (MQ=255) CCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCa < 1:649868‑M1/122‑1 (MQ=255) CCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGa > 1:828134‑M1/1‑125 (MQ=255) CCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGa < 2:828134‑M1/125‑1 (MQ=255) ccctgtaggcgcgggcaacgcggtgtatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggcaagcccgcttctacaggggggctATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGcc > 1:1328498‑M2/80‑150 (MQ=255) CCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGAc < 1:1334751‑M1/86‑1 (MQ=255) CCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGAc > 2:1334751‑M1/1‑86 (MQ=255) CCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGa < 1:752373‑M1/133‑1 (MQ=255) CCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGa > 2:752373‑M1/1‑133 (MQ=255) CCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGccc < 2:899527‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAgc < 1:495987‑M1/93‑1 (MQ=255) CCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAgc > 2:495987‑M1/1‑93 (MQ=255) taggcgcgggcaacgcggtgtctggcaccggcttcgccggtgttcgcgggcaagcccgcttctacaggggggctATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGa > 1:1137140‑M2/75‑122 (MQ=255) taggcgcgggcaacgcggtgtctggcaccggcttcgccggtgttcgcgggcaagcccgcttctacaggggggctATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGa < 2:1137140‑M2/48‑1 (MQ=255) tAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACCATCAGTAGGACCCTACCACGATGGACACCCGTCGGTTTTCGGTACGCCCGgcgc > 2:447869/1‑150 (MQ=255) gCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTg > 1:190733/1‑150 (MQ=255) cgcgAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGc > 1:578895/1‑150 (MQ=255) cGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAgcgg > 2:161251/1‑66 (MQ=255) cGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAgcgg < 1:161251/66‑1 (MQ=255) cGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGa < 2:726481/81‑1 (MQ=255) cGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGa > 1:726481/1‑81 (MQ=255) cGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGAAAAGAATAACGCGACGACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCggctg > 1:1241885/1‑150 (MQ=255) ggCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCggctgg > 2:1324229/1‑150 (MQ=255) gCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTa > 2:1368325/1‑47 (MQ=255) gCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTa < 1:1368325/47‑1 (MQ=255) ccAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCg < 2:950460/132‑1 (MQ=255) ccAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCg > 1:950460/1‑132 (MQ=255) ccAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGc < 1:871626/150‑1 (MQ=255) gACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCGACCGGCGGGCTGCGGCCCAGGCTAc > 2:662966/1‑150 (MQ=255) cacCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCACgg > 2:1422153/1‑150 (MQ=255) ccGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGacac > 1:724194/1‑78 (MQ=255) ccGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGacac < 2:724194/78‑1 (MQ=255) cgcgTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCAc < 1:777826/145‑1 (MQ=255) cgcgTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCAc > 2:777826/1‑145 (MQ=255) cgcgTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACAATGGACACCCGACAGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCACGGctc < 2:496648/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGAGGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCACGGCTCTGAAt < 2:224592/150‑1 (MQ=255) cgcgCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCACGGCTCTGAATGTTc > 1:1038472/1‑150 (MQ=255) gcgcCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCACGGCTCTGAATGTTCt < 2:1387050/150‑1 (MQ=255) gcCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCACGGCTCTGAATGTTCtgt > 2:808018/1‑150 (MQ=255) tACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCACGGCTCTGAATGTTCTGTGcc > 1:153413/1‑150 (MQ=255) aCAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCACGGCTCTGAATGTTCTGTGCCt < 2:578895/150‑1 (MQ=255) ggctATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCACGGCTCTGAATGTTCTGTGCCTGCATGc < 1:899527‑M2/146‑1 (MQ=255) tATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGc < 2:1326004‑M2/83‑1 (MQ=255) tATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGc > 1:1326004‑M2/2‑84 (MQ=255) tATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCACGGCTCTGAATGTTCTGTGCCTGCATGCCaa > 1:132784‑M2/2‑150 (MQ=255) | CCGTTGTTGATGGGGCAAACCCGCGAGATGCGCTTTGCCCAGGACTGATGGGCCTGCGCATTTCCGAGCCCCCCTGTAGAAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCAGACACCGCGTTGCCCGCGCCTACAGGGGGCTATGTGACAGCCCGAGCGGCGACGATCAGTAGGACGCTACCACGATGGACACCCGACGGTTCTCGGTACGCCCGGCGCTGGTGCGGTTGTCCGCCACCGGCTGGCTGCTGCCCAGGCCACGGCTCTGAATGTTCTGTGCCTGCATGCCAA > NC_002947/5295470‑5295767 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |