New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5583099 = | 47 (0.890) | 6 (0.120) | 6/240 | NT | 12.4% | coding (298/756 nt) | PP_4911 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5583142 = | 39 (0.760) | coding (255/756 nt) | PP_4911 | hypothetical protein |
ACGTCCGGGCTGAAGCCTGCGGTCGCCGGGGCCAGTACTACGCGTTGGCTGTCCAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACAGGGCAACCGGCTGATGCATGG > NC_002947/5582996‑5583287 | atcctggccagccgtcgcagagtgcgggcatggccgtggtactcggccctgtatcggtggccgattaccttcagcgtgagacattcctgcagcgtcaacctgatGGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATc > 1:615442‑M1/105‑150 (MQ=255) cGTCCGGGCTGAAGCCTGCGGTCGCCGGGGCCAGTACTACGCGTTGGCTGTCCAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAg < 2:511097/150‑1 (MQ=255) cGTCCGGGCTGAAGCCTGCGGTCGCCGGGGCCAGTACTACGCGTTGGCTGTCCAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAg < 1:245194/150‑1 (MQ=255) ctggccagccgtcgcagagtgcgtgcatggccgtggtactcggccctgtatcggtggccgattaccttcagcgtgagacattcctgcagcgtcaacctgatGGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAgg > 1:1304799‑M1/102‑150 (MQ=255) aaGCCTGCGGTCGCCGGGGCCAGTACTACGCGTTGGCTGTCCAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGc > 1:432948/1‑150 (MQ=255) gCCTGCGGTCGCCGGGGCCAGTACTACGCGTTGGCTGTCCAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAg < 1:402922/150‑1 (MQ=255) gCCGGGGCCAGTACTACGCGTTGGCTGTCCAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCa > 1:627089/1‑150 (MQ=255) ccAGTACTACGCGTTGGCTGTCCAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGaa < 2:738035/150‑1 (MQ=255) ccAGTACTACGCGTTGGCTGTCCAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCCGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGaa < 1:9942/150‑1 (MQ=255) ccgtggtactcggccctgtatcggtggccgattaccttcagcgtgagacattcctgcagcgtcaacctgatGGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCa > 1:464316‑M1/72‑118 (MQ=255) ccgtggtactcggccctgtatcggtggccgattaccttcagcgtgagacattcctgcagcgtcaacctgatGGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCa < 2:464316‑M1/47‑1 (MQ=255) gTACTACGCGTTGGCTGTCCAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGt > 1:934358/1‑150 (MQ=255) acGCGTTGGCTGTCCAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCg < 1:584619/150‑1 (MQ=255) acGCGTTGGCTGTACAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCTCTTCGTCGGTCACC‑TTGAAATGGTGGCCAGCCCCACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCg < 1:167700/150‑1 (MQ=255) cgTTGGCTGTCCAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGcc < 2:4926/150‑1 (MQ=255) cTGTACCGACGGCATGCCAGTTGACGCACCAGCAGCGGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCACTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACCCTGAAGGTAATCGGCCACCGAt < 2:325326/150‑1 (MQ=255) aGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAggg > 1:289568/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGcc < 2:559878/150‑1 (MQ=255) ggccagTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTAc < 2:390648/150‑1 (MQ=255) gTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACgg > 1:518473/1‑150 (MQ=255) ttGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCNGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGc < 2:247618/150‑1 (MQ=255) gCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGc > 2:318008/1‑150 (MQ=255) gCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCCCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGc > 1:634576/1‑150 (MQ=255) cagcagCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGc > 2:1158634/1‑150 (MQ=255) gcTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTAc > 2:95890/1‑130 (MQ=255) gcTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTAc < 1:95890/130‑1 (MQ=255) cTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTg > 1:646722/1‑150 (MQ=255) gTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGa > 1:807677/1‑150 (MQ=255) gTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCAAGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGa > 2:870124/1‑150 (MQ=255) atatCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGc > 1:238025/1‑150 (MQ=255) cctgatggcagcctgagcgcggcgaccgacggtcgttgggctggcagccATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCACGCACTCTGCGACGGCTGGCCAg > 1:1304799‑M2/50‑150 (MQ=255) tgatggcagcctgagcgcggcgaccgacggtcgttgggctggcagccATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACgg > 1:464316‑M2/48‑118 (MQ=255) tgatggcagcctgagcgcggcgaccgacggtcgttgggctggcagccATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACgg < 2:464316‑M2/71‑1 (MQ=255) gatggcagcctgagcgcggcgaccgacggtcgttgggctggcagccATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGAt > 1:615442‑M2/47‑150 (MQ=255) GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATcac > 2:289568‑M1/1‑150 (MQ=255) agcctgagcgcggcgaccgacggtcgttgggctcaggctgccATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATcacc > 2:753188‑M2/43‑150 (MQ=255) GCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATcacc < 2:853503‑M1/150‑1 (MQ=255) CTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATcacca > 1:1158634‑M1/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACt > 1:476196/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACt < 2:476196/149‑1 (MQ=255) cAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGc < 2:95166/120‑1 (MQ=255) cAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGc > 1:95166/1‑120 (MQ=255) cGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACa < 1:853503/150‑1 (MQ=255) gtcggtcgCCGCGCTCAGGCTGCCAACAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACAg > 2:411945/1‑150 (MQ=255) tcggtcgCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACAgg < 2:238025/150‑1 (MQ=255) tcggtcgCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACAgg < 2:807677/150‑1 (MQ=255) tcggtcgCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACAgg < 2:646722/150‑1 (MQ=255) cgacggtcgttgggctggcagccATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACAgg < 2:615442‑M2/127‑1 (MQ=255) ccgcGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGAt > 1:71096/1‑120 (MQ=255) ccgcGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGAt < 2:71096/120‑1 (MQ=255) ccgcGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACAGGGCAACCg > 1:605224/1‑150 (MQ=255) cgcTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACAGGGCAACCGGCt < 2:934358/150‑1 (MQ=255) tCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACAGGGCAACCGGc > 1:252746/1‑146 (MQ=255) tCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACAGGGCAACCGGc < 2:252746/146‑1 (MQ=255) tGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATca > 1:1203544/1‑110 (MQ=255) tGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATca < 2:1203544/110‑1 (MQ=255) tGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACAGGGCAACCGGCTGATGCATgg > 1:1347067/1‑150 (MQ=255) gccATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGa > 1:32555‑M2/4‑124 (MQ=255) gccATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGa < 2:32555‑M2/121‑1 (MQ=255) | ACGTCCGGGCTGAAGCCTGCGGTCGCCGGGGCCAGTACTACGCGTTGGCTGTCCAGACGCCAGGCCAGTTGACGCACCAGCAGCTGGTCGATATCCGATGAAA‑GGCTGCCAGCCCAACGACCGTCGGTCGCCGCGCTCAGGCTGCCATCAGGTTGACGCTGCAGGAATGTCTCACGCTGAAGGTAATCGGCCACCGATACAGGGCCGAGTACCACGGCCATGCCCGCACTCTGCGACGGCTGGCCAGGATCACCACTGTCGAGCTGATACAGGGCAACCGGCTGATGCATGG > NC_002947/5582996‑5583287 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |