| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1156352 | 23 (0.730) | 16 (0.630) | 13/198 | NT | 44.2% | intergenic (+49/‑167) | PP_1013/yihS | sensor histidine kinase/aldose‑ketose isomerase |
| ? | NC_002947 | = 1156375 | 22 (0.870) | intergenic (+72/‑144) | PP_1013/yihS | sensor histidine kinase/aldose‑ketose isomerase | |||||
CGCAACATCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGACCCCGCTGGCTAGAATTCGCAAACGACTGG > NC_002947/1156205‑1156500 | cgcAACATCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACaa < 2:24136/150‑1 (MQ=255) tctaCATCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAc < 2:408763/147‑1 (MQ=255) cATCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGACCCAGCGTGATGGCGGGCTGCGGGTGACCCGCTAGCTGCCGTGCGGTACTCTTGGGGGCTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAAACAGCACCTGCAACGaga > 1:408763/1‑148 (MQ=255) tCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGa < 1:767298/150‑1 (MQ=255) gggCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgt < 1:24635‑M1/150‑26 (MQ=255) ggagAGGTGAGCTTGCTGAACCTGGGGTGGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTa < 2:412629/147‑1 (MQ=255) gTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGt < 1:766379/129‑1 (MQ=255) gTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGt > 2:766379/1‑129 (MQ=255) tGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgg > 2:638458‑M2/1‑140 (MQ=255) gggctTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcggg < 2:606789‑M1/148‑35 (MQ=255) gAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcggg > 1:512075‑M2/1‑139 (MQ=255) ttGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtag > 2:572391‑M1/1‑112 (MQ=255) ttGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtag < 1:572391‑M1/139‑28 (MQ=255) tGCTGAACCTGCGGGAGGGCGCGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcac > 2:440115‑M2/1‑134 (MQ=255) ccTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaa > 1:35713‑M2/1‑127 (MQ=255) ccTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaa < 1:81746‑M2/150‑24 (MQ=255) cGGGAGGGCGTGCTGAGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAgg < 1:328244/150‑1 (MQ=255) gAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgg < 1:95248‑M1/130‑34 (MQ=255) gAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgg > 2:95248‑M1/1‑97 (MQ=255) ggcgggcTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGca > 2:675574/1‑150 (MQ=255) gcTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggt < 1:727609‑M2/124‑13 (MQ=255) gcTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggt > 2:727609‑M2/1‑112 (MQ=255) gcTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGc > 1:606401/1‑150 (MQ=255) ggTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaaga > 1:166362‑M2/1‑106 (MQ=255) ggTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaaga < 2:166362‑M2/131‑26 (MQ=255) ccTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagc > 2:522222‑M1/1‑77 (MQ=255) ccTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagc < 1:522222‑M1/108‑32 (MQ=255) ccTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTc > 1:823499/1‑150 (MQ=255) ccTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtagga < 2:514238‑M1/106‑30 (MQ=255) ccTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtagga > 1:514238‑M1/1‑77 (MQ=255) tCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGcc > 2:485582/1‑150 (MQ=255) ccGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgg > 1:218699‑M1/1‑67 (MQ=255) ccGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgg < 2:218699‑M1/100‑34 (MQ=255) gTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagc < 1:825653‑M1/91‑32 (MQ=255) gTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagc > 2:825653‑M1/1‑60 (MQ=255) gATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgggttc > 1:53239‑M1/1‑55 (MQ=255) gATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgggttc < 2:53239‑M1/92‑38 (MQ=255) gATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCcgtc < 1:485582/150‑1 (MQ=255) ttGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAcc < 1:674349/117‑1 (MQ=255) ttGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAcc > 2:674349/1‑117 (MQ=255) gTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCtt > 2:756391/1‑150 (MQ=255) gggCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCCACCGCGAAGAGGCCCGCACATGCACCCAACATGTCACTGCCCGATGCCAATCCCGTCGTCCTTCGTGAAATCAGCCATGAcc > 2:228095/1‑150 (MQ=255) gggCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGAcc > 1:793494/1‑150 (MQ=255) gggCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGAcc > 2:215297/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCGGGTGAACCCGCTCCGACAGCGACCGAGTAAGGTTGGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGACCCCGc < 2:390322/150‑1 (MQ=255) tcttcGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacc < 2:166362‑M1/131‑107 (MQ=255) tcttcGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacc > 1:166362‑M1/1‑25 (MQ=255) ttcGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagcccgccctcccgcagg < 1:81746‑M1/150‑128 (MQ=255) ttcGCGGGTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagcccgccctcccgcagg > 1:35713‑M1/1‑23 (MQ=255) ggTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGACCCCGCTGGCTAGaa < 2:606401/150‑1 (MQ=255) gTGAACCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagcgcgccctcccgcaggttcagca > 2:440115‑M1/1‑16 (MQ=255) tGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGACCCCGCTGGCTAGAAtt > 2:321068/1‑150 (MQ=255) gAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatc > 1:53239‑M2/1‑37 (MQ=255) gAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatc < 2:53239‑M2/92‑56 (MQ=255) gAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGACCCCGCTGGCTAGAATTc < 1:756391/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagc < 1:727609‑M1/124‑113 (MQ=255) aCCCGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagc > 2:727609‑M1/1‑12 (MQ=255) cccGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagcccgccctcccgcaggttcagcaagctc > 1:512075‑M1/1‑11 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagcccgccctcccgcaggttcagcaagccc < 2:606789‑M2/150‑117 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCcgtc < 1:547031/106‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCcgtc > 2:547031/1‑106 (MQ=255) ccGCTCCTACgacgcaaacctgactcggtcgttgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagcccgccctcccgcaggttcagcaagctca > 2:638458‑M1/1‑10 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagcccgccctc > 2:95248‑M2/1‑33 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagcccgccctc < 1:95248‑M2/130‑98 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcgg < 2:218699‑M2/100‑68 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcgg > 1:218699‑M2/1‑33 (MQ=255) cGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGACCCCGCTGGCTAGAATTCGCaaa < 1:215297/150‑1 (MQ=255) gCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccatac < 1:825653‑M2/91‑61 (MQ=255) gCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccatac > 2:825653‑M2/1‑31 (MQ=255) gCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagg > 2:522222‑M2/1‑31 (MQ=255) gCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagg < 1:522222‑M2/108‑78 (MQ=255) tCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagg < 2:514238‑M2/106‑78 (MQ=255) tCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagg > 1:514238‑M2/1‑29 (MQ=255) ccTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGACCCCGCTGGCTAGAATTCGCAAACGAc < 1:321068/150‑1 (MQ=255) cTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagcccgccctcccgcaggttcagcaa > 2:572391‑M2/1‑27 (MQ=255) cTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaagcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagcccgccctcccgcaggttcagcaa < 1:572391‑M2/139‑113 (MQ=255) aCAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggcaccccaaaaactcaatccataccccgcggcagatacagggtcacccgcagcccgccctcccgcaggttcagcaagctcacctcgccc < 1:24635‑M2/150‑126 (MQ=255) | CGCAACATCGCCCATAGCCATGGGGGCGAGGTGAGCTTGCTGAACCTGCGGGAGGGCGGGCTGCGGGTGACCCTGTATCTGCCGCGGGGTATGGATTGAGTTTTTGGGGTGCCTGTGCGGGCTTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGAGTCAGGTTTGCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCACCCAAAATGTCACTGCCCGGTGACAATCCCGTCGTCCTTCGTGACATCCGCCATGACCCCGCTGGCTAGAATTCGCAAACGACTGG > NC_002947/1156205‑1156500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |