New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1449446 = | 20 (0.630) | 7 (0.230) | 7/240 | NT | 24.8% | coding (243/468 nt) | yhaV | toxin antitoxin system SohB(PrlF)‑YhaV toxin endoribonuclease |
? | NC_002947 | 1449472 = | 23 (0.750) | coding (217/468 nt) | yhaV | toxin antitoxin system SohB(PrlF)‑YhaV toxin endoribonuclease |
AAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAGCCTTTTAAAGGTATTTCTTTTCGTATAACCCGTTGGGTCTTTGTCCCGTTGAGCCTCGAC > NC_002947/1449304‑1449592 | aaGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCaa < 2:763544/150‑1 (MQ=255) tttCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCaa > 2:417493/1‑135 (MQ=255) tttCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCaa < 1:417493/135‑1 (MQ=255) tcaagtcgaggctcaacgggacaaagacccaacgggttatacgaaaagaaatacctttaaaaggctggccgccatccggcggttggcgttcgatgtaatccctcaagacccgaccaaacccgaatACCg < 2:783818‑M1/4‑1 (MQ=255) tcaagtcgaggctcaacgggacaaagacccaacgggttatacgaaaagaaatacctttaaaaggctggccgccatccggcggttggcgttcgatgtaatccctcaagacccgaccaaacccgaatACCg > 1:783818‑M1/126‑129 (MQ=255) ccGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCggg > 2:576877/1‑150 (MQ=255) tCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCg < 1:465495/150‑1 (MQ=255) aTTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCgg > 1:774433/1‑131 (MQ=255) aTTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCgg < 2:774433/131‑1 (MQ=255) cagcagGATCATCGTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGaa > 2:816158/1‑150 (MQ=255) tacgaaaagaaatacctttaaaaggctggccgccatccggcggttggcgttcgatgtaatccctcaagacccgaccaaacccgaatACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGt > 1:852628‑M1/87‑120 (MQ=255) tacgaaaagaaatacctttaaaaggctggccgccatccggcggttggcgttcgatgtaatccctcaagacccgaccaaacccgaatACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGt < 2:852628‑M1/34‑1 (MQ=255) gaaaagaaatacctttaaaaggctggccgccatccggcggttggcgttcgatgtaatccctcaagacccgaccaaacccgaatACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCg < 1:731914‑M1/24‑1 (MQ=255) gaaaagaaatacctttaaaaggctggccgccatccggcggttggcgttcgatgtaatccctcaagacccgaccaaacccgaatACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCg > 2:731914‑M1/84‑107 (MQ=255) aacCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAg > 2:121829/1‑134 (MQ=255) aacCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAg < 1:121829/134‑1 (MQ=255) ggAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAGCCTTTTAAAGGTATTTCTTTTCGTATAAc < 1:816158/150‑1 (MQ=255) gaagaaCTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAGc > 1:152042/1‑121 (MQ=255) gaagaaCTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAGc < 2:152042/121‑1 (MQ=255) aagacccgaccaaacccgaatACCGGCAAGGGGCAACACTTGGCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACACCAACCGCCGGATGGCGGCCAGCCTTTTAAAGGTATTTCTTTTCGTATAACCCGTTGGGTCttt < 2:540490‑M1/129‑1 (MQ=255) tGAGCCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAGCCTTTTAAAGGTATTTCTTTTCGTATAACCCGTTGGGTCTTTGt > 2:33992/1‑150 (MQ=255) tGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATggc < 2:469972/100‑1 (MQ=255) tGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATggc > 1:469972/1‑100 (MQ=255) acccgaccaaacccgaatACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGc < 2:559037‑M1/22‑1 (MQ=255) acccgaccaaacccgaatACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGc > 1:559037‑M1/19‑40 (MQ=255) ccAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAGCCTTTTAAAGGTATTTGTTGTCGTATAACCCGTTGGGTCTTTGTCCCg > 1:181208/1‑150 (MQ=255) ccAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAGCCTTTTAAAGGTATTTCTTTTCGTATAACCCGTTgg < 1:86913/138‑1 (MQ=255) ccAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAGCCTTTTAAAGGTATTTCTTTTCGTATAACCCGTTgg > 2:86913/1‑138 (MQ=255) cAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAGCCTTTTAAAGGTATTTCTTTTCGTATAACCCGTTGGGTCTTTGTCCCGt > 2:485209/1‑150 (MQ=255) gTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAGCCTTTTAAAGGTATTTCTTTTCGTATAACCCGTTGGGTCTTTGTCCCGTTGAGCCTCGAc > 1:340952/1‑150 (MQ=255) | AAGCATCGTCGCTACTTTCATAGGCCCGCTTGCTCGACTCGTCATTGATCCAGGCCAGCACGATGATCCTGCTGGGGGTGTGGTAGCGGAAGAACAACCGGTACTGCTGGAAGAACTTTGCTCTGAACCAGTGCTTGTGGTCACCGCCAAGTGTTGCCCCTTGCCGGTATTCGGGTTTGGTCGGGTCTTGAGGGATTACATCGAACGCCAACCGCCGGATGGCGGCCAGCCTTTTAAAGGTATTTCTTTTCGTATAACCCGTTGGGTCTTTGTCCCGTTGAGCCTCGAC > NC_002947/1449304‑1449592 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |