New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1473183 = | 27 (0.850) | 5 (0.170) | 5/236 | NT | 13.6% | coding (1045/1317 nt) | algD | GDP‑mannose 6‑dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1473227 = | 38 (1.260) | coding (1001/1317 nt) | algD | GDP‑mannose 6‑dehydrogenase |
TTGCCGAGGACGATGATGTCGGCGTTGTCGATCACCTGCTGCAAGTTGGCGTTGAGCAGCGACGACACGTGCGGGATCTTCGACTCGATGTAGTCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCGATCAGCTCGAAGGCGTTCTGCACCTGC > NC_002947/1473035‑1473331 | tccgtgcaccgctgctcgactcgctgatgcgcagcaacgaatcgcaggtgcagaacgccttcgagctgatcgaagcccacgacaagcgcaaggtcgccctgctgggcctgagcttcaaggccggcaccgacgacctgcgcgaaagcccGc < 1:442219‑M1/2‑1 (MQ=255) tgcaccgctgctcgactcgctgatgcgcagcaacgaatcgcaggtgcagaacgccttcgagctgatcgaagcccacgacaagcgcaaggtcgccctgctgggcctgagcttcaaggccggcaccgacgacctgcgcgaaagcccGCTGGt > 1:94479‑M1/145‑150 (MQ=255) gatgatGTCGGCGTTGTCGATCACCTGCTGCAAGTTGGCGTTGAGCAGCGACGACACGTGCGGGATCTTCGACTCGATGTAGTCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCtt > 1:97591/1‑150 (MQ=255) gCGTTGTCGATCACCTGCTGCAAGTTGGCGTTGAGCAGCGACGACACGTGCGGGATCTTCGACTCGATGTAGTCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGACGATCAgg < 1:715468/150‑1 (MQ=255) gcAAGTTGGCGTTGAGCAGCGACGACACGTGCGGGATCTTCGATTCGCGATACTGCTGTGTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTGCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTccacca < 2:23151/150‑1 (MQ=255) gTTGAGCAGCGACGACACGTGCGGGATCTTCGACTCGATGTAGTCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGcc > 2:475202/1‑114 (MQ=255) gTTGAGCAGCGACGACACGTGCGGGATCTTCGACTCGATGTAGTCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGcc < 1:475202/114‑1 (MQ=255) gTTGAGCAGCGACGACACGTGCGGGATCTTCGACTCGATGTAGTCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGc > 1:15219/1‑113 (MQ=255) gTTGAGCAGCGACGACACGTGCGGGATCTTCGACTCGATGTAGTCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGc < 2:15219/113‑1 (MQ=255) cagaacgccttcgagctgatcgaagcccacgacaagcgcaaggtcgccctgctgggcctgagcttcaaggccggcaccgacgacctgcgcgaaagcccGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTc > 2:209225‑M1/99‑150 (MQ=255) agaacgccttcgagctgatcgaagcccacgacaagcgcaaggtcgccctgctgggcctgagcttcaaggccggcaccgacgacctgcgcgaaagcccGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTcc < 2:659531‑M1/38‑1 (MQ=255) agaacgccttcgagctgatcgaagcccacgacaagcgcaaggtcgccctgctgggcctgagcttcaaggccggcaccgacgacctgcgcgaaagcccGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTcc > 1:659531‑M1/98‑135 (MQ=255) aacgccttcgagctgatcgaagcccacgacaagcgcaaggtcgccctgctgggcctgagcttcaaggccggcaccgacgacctgcgcgaaagcccGc > 1:3134‑M1/96‑97 (MQ=255) aacgccttcgagctgatcgaagcccacgacaagcgcaaggtcgccctgctgggcctgagcttcaaggccggcaccgacgacctgcgcgaaagcccGc < 2:3134‑M1/2‑1 (MQ=255) aacgccttcgagctgatcgaagcccacgacaagcgcaaggtcgccctgctgggcctgagcttcaaggccggcaccgacgacctgcgcgaaagccaGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCgg < 2:67001‑M1/46‑1 (MQ=255) aacgccttcgagctgatcgaagcccacgacaagcgcaaggtcgccctgctgggcctgagcttcaaggccggcaccgacgacctgcgcgaaagccaGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCgg > 1:67001‑M1/96‑141 (MQ=255) gcagcGACGACACGTGCGGGATCTTCGACTCGATGTAGTCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCa > 2:71562/1‑150 (MQ=255) gcagcGACGACACGTGCGGGATCTTCGACTCGATGTAGTCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCa < 1:71562/150‑1 (MQ=255) cTTCGACTCGATGTAGTCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGaa < 1:110637/150‑1 (MQ=255) tCGATGTAGTCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAgg < 2:467866/150‑1 (MQ=255) tCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGgtcgt > 2:22158/1‑118 (MQ=255) tCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGgtcgt < 1:22158/118‑1 (MQ=255) tCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAgg > 2:772637/1‑150 (MQ=255) ccTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTAGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAggg > 1:363740/1‑150 (MQ=255) cTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCCGCTGGTAGCCCTTGCCGCTCAGGCGCTTGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGc < 2:97591/150‑1 (MQ=255) ttgGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGAcc > 1:18098/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCtt < 2:344241/150‑1 (MQ=255) aaCACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTc > 1:298876/1‑150 (MQ=255) acGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTg < 1:772637/150‑1 (MQ=255) tACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCg > 1:97242/1‑150 (MQ=255) gACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCGATCAg > 1:387261/1‑150 (MQ=255) gTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCGATCAGCTc > 2:761893/1‑150 (MQ=255) gTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCGATCAGCTc > 1:552740/1‑150 (MQ=255) gtcgtAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCGATCAGCTCGAAGGc > 1:422187/1‑150 (MQ=255) gtAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCGATCAGCTCGAAGGCGtt > 1:41406/1‑150 (MQ=255) gtAGATGTCCAGCAGGTGGCCCTTGCCGAGGAGGTTCTCGGCGCGTTCTGGGAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGGCGGTGCCGGCCGTGAAGCTCAGGCCCAGGAGGGGGACCTTGCGGTGGGCGTGGGCTTGGATCAGGTGGAAGGCggt > 2:672663/1‑148 (MQ=255) tCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCGATCAGCTCGAAGGCGTTCTGCAcc > 2:546246/1‑150 (MQ=255) cAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCGATCAGCTCGAAGGCGt > 1:428039/1‑140 (MQ=255) cAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCGATCAGCTCGAAGGCGt < 2:428039/140‑1 (MQ=255) aGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCt > 1:809713/1‑76 (MQ=255) aGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCt < 2:809713/76‑1 (MQ=255) aGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCGATCAGCTCGAAGGCGTTCTGCACCTGc < 2:387261/150‑1 (MQ=255) aGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCGATCAGCTCGAAGGCGTTCTGCACCTGc > 1:174032/1‑150 (MQ=255) | TTGCCGAGGACGATGATGTCGGCGTTGTCGATCACCTGCTGCAAGTTGGCGTTGAGCAGCGACGACACGTGCGGGATCTTCGACTCGATGTAGTCCTTGTTGGCGCCGTGAACACGGGCGTACTGGACGTTCTCGTCGTAGATGTCCAGCTGGTAGCCCTTGCCGATCAGGCGCTCGGCCAGTTCCACCAGCGGGCTTTCGCGCAGGTCGTCGGTGCCGGCCTTGAAGCTCAGGCCCAGCAGGGCGACCTTGCGCTTGTCGTGGGCTTCGATCAGCTCGAAGGCGTTCTGCACCTGC > NC_002947/1473035‑1473331 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |