New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1858873 | 28 (0.880) | 7 (0.230) | 6/242 | NT | 20.5% | coding (2010/2259 nt) | PP_1661 | dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 1858902 | 27 (0.870) | coding (2039/2259 nt) | PP_1661 | dehydrogenase |
GCGACCTGCTCAAGCGCACCGTGCAGGTGCAGGCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGT > NC_002947/1858731‑1859021 | gCGACCTGCTCAAGCGCACCGTGCAGGTGCAGGCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGcggcgg < 2:356500/150‑1 (MQ=255) gCGACCTGCTCAAGCGCACCGTGCAGGTGCAGGCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGcggcgg > 2:307790/1‑150 (MQ=255) tGCTCAAGCGCACCGTGCAGGTGCAGGCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATAGCCGGGCttggcgatcaac > 1:716284‑M1/1‑138 (MQ=255) aGCGCACCGTGCAGGTGCAGGCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGt < 1:307790/150‑1 (MQ=255) cccGGGCAGGGGCAGGAGAACCAGGCATGGCAGGGTACGGGGATGTAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATCCACGGACGGCCAGTGGACCGCGAACCCGGACACCGACAT‑GGTTGGAGAGCCGCGCAACCCAACGTTGAtt < 2:610323/149‑2 (MQ=255) aCCGTGCAGGTGCAGGCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATc > 2:414505/1‑150 (MQ=255) tgcaggtgcaggCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGAt < 1:288943/145‑1 (MQ=255) tgcaggtgcaggCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGAt > 2:288943/1‑145 (MQ=255) tcaccttgcaggCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTAGCGCCGCGGGCAACCCAAGGGTGATCGCCa > 2:200038/7‑150 (MQ=255) gtgcaggCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGccc > 2:376025/1‑150 (MQ=255) gCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTAt > 2:669269/1‑150 (MQ=255) cAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATAGCCGGGCttggcgatcaaccttgggttgcccgccgcgccaaccatgccgga < 2:716284‑M1/150‑45 (MQ=255) aGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATAGCCGGGCttggcgatcaaccttgggttgcccgccgcgccaaccatgccggtg < 1:68276‑M1/150‑46 (MQ=255) gggaTGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCaa < 2:152961/116‑1 (MQ=255) ggCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCaa > 1:152961/1‑119 (MQ=255) gCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTAtgccttgcct < 2:422535/150‑1 (MQ=255) aGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCttggcgatcaaccttgggttgcccgccgc < 2:548620‑M1/124‑30 (MQ=255) aGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCttggcgatcaaccttgggttgcccgccgc > 1:548620‑M1/1‑95 (MQ=255) aGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGAAGAGATGAACGATGGCGGTATTAACGGGCAAGCGGTGCACGGCGAGCCCGGCCTCCTCCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAATCCCGGCTATGCCTTGCCTTGTCAAc > 2:737586/1‑150 (MQ=255) cACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCaa < 1:680728/120‑1 (MQ=255) cACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCaa > 2:680728/1‑120 (MQ=255) aCGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGaa < 2:40355/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGt < 1:376025/150‑1 (MQ=255) aGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCttggcgatcaaccttgggttgcccgccgcgccaaccatg < 2:292551‑M1/119‑40 (MQ=255) aGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCttggcgatcaaccttgggttgcccgccgcgccaaccatg > 1:292551‑M1/1‑80 (MQ=255) aaTGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCggg > 2:88771/1‑150 (MQ=255) gggCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCaa < 1:734031/83‑1 (MQ=255) gggCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCaa > 2:734031/1‑83 (MQ=255) agagCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCg > 2:55853/1‑150 (MQ=255) ggCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATAATTGGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACa > 1:93414/1‑150 (MQ=255) cACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGTCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTGAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCt > 1:836784/1‑150 (MQ=255) ccGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCcg > 1:439232/1‑150 (MQ=255) cGGCCACCGGAAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCcgc < 2:430740/150‑1 (MQ=255) cACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAgcccggctatgccggtggccgggttcgccgtccactgcccgcccgtgcataccgccaactgccagctctgcccattgacctgcatgcccgtgccctgccatgcct < 1:68276‑M2/150‑106 (MQ=255) tccgGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAgcccggctatgccggtggccgggttcgccgtccactgcccgcccgtgcataccgccaactgccagctctgcccattgacctgcatgcccgtgccctgccatgcctg < 2:716284‑M2/149‑107 (MQ=255) gCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAATCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGc > 1:814771/1‑150 (MQ=255) cAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAgccaaccatgccggtggccgggttcgccgtccactgcccgcccgtgcataccgccaactgccagctctgcccattgacct < 2:292551‑M2/119‑81 (MQ=255) cAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAgccaaccatgccggtggccgggttcgccgtccactgcccgcccgtgcataccgccaactgccagctctgcccattgacct > 1:292551‑M2/1‑39 (MQ=255) gTTGGGGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGt < 2:83715/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGTCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACACCGGCGTGCAGTCCCTACTCGGCACCCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGa < 1:200038/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGa < 1:750702/150‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGt < 1:669269/150‑1 (MQ=255) | GCGACCTGCTCAAGCGCACCGTGCAGGTGCAGGCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCAT‑GGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGT > NC_002947/1858731‑1859021 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |