New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1858873 | 28 (0.880) | 7 (0.230) | 6/242 | NT | 20.5% | coding (2010/2259 nt) | PP_1661 | dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 1858902 | 27 (0.870) | coding (2039/2259 nt) | PP_1661 | dehydrogenase |
GTGCAGGCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACG > NC_002947/1858757‑1859051 | gtgcaggCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGccc > 2:376025/1‑150 (MQ=255) gCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTAt > 2:669269/1‑150 (MQ=255) gCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTAtgccttgcct < 2:422535/150‑1 (MQ=255) aGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGAAGAGATGAACGATGGCGGTATTAACGGGCAAGCGGTGCACGGCGAGCCCGGCCTCCTCCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAATCCCGGCTATGCCTTGCCTTGTCAAc > 2:737586/1‑150 (MQ=255) cACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCaa > 2:680728/1‑120 (MQ=255) cACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCaa < 1:680728/120‑1 (MQ=255) aCGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGaa < 2:40355/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGt < 1:376025/150‑1 (MQ=255) aaTGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCggg > 2:88771/1‑150 (MQ=255) agagCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCg > 2:55853/1‑150 (MQ=255) ggCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATAATTGGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACa > 1:93414/1‑150 (MQ=255) cACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGTCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTGAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCt > 1:836784/1‑150 (MQ=255) ccGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCcg > 1:439232/1‑150 (MQ=255) cGGCCACCGGAATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCcgc < 2:430740/150‑1 (MQ=255) cACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAgcccggctatgccggtggccgggttcgccgtccactgcccgcccgtgcataccgccaactgccagctctgcccattgacctgcatgcccgtgccctgccatgcct < 1:68276‑M2/150‑106 (MQ=255) tccgGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAgcccggctatgccggtggccgggttcgccgtccactgcccgcccgtgcataccgccaactgccagctctgcccattgacctgcatgcccgtgccctgccatgcctg < 2:716284‑M2/149‑107 (MQ=255) gCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAATCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGc > 1:814771/1‑150 (MQ=255) cATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAgccaaccatgccggtggccgggttcgccgtccactgcccgcccgtgcataccgccaactgccagctctgcccattgacct < 2:292551‑M2/119‑81 (MQ=255) cATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAgccaaccatgccggtggccgggttcgccgtccactgcccgcccgtgcataccgccaactgccagctctgcccattgacct > 1:292551‑M2/1‑39 (MQ=255) gTTGGGGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGt < 2:83715/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGTCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACACCGGCGTGCAGTCCCTACTCGGCACCCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGa < 1:200038/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGa < 1:750702/150‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGt < 1:669269/150‑1 (MQ=255) gcggcgGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAgccaaccatgccggtggccgggttcgccgtccactgcccgcccgtgcataccgccaactgccagctctgcccattgacctgcatgcccgtgccct > 1:548620‑M2/1‑29 (MQ=255) gcggcgGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAgccaaccatgccggtggccgggttcgccgtccactgcccgcccgtgcataccgccaactgccagctctgcccattgacctgcatgcccgtgccct < 2:548620‑M2/124‑96 (MQ=255) ggCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCaa < 2:485229/107‑1 (MQ=255) ggCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCATGGTCGGCaa > 1:485229/1‑107 (MQ=255) gcccAAGGTTGATCGCGGAGGGCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGACCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCa < 2:439232/149‑1 (MQ=255) aCCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCa < 1:414505/150‑1 (MQ=255) aGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAAt < 1:200711/150‑1 (MQ=255) gTTGATCGCCAAgcccggctatgccggtggccgggttcgccgtccactgcccgcccgtgcataccgccaactgccagctctgcccattgacctgcatgcccgtgccctgccatgcctggttggcctgcacctgcacggtgcgcttgagca > 1:716284‑M2/1‑12 (MQ=255) gTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGc < 2:662154/110‑1 (MQ=255) gTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGc > 1:662154/1‑110 (MQ=255) gTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATga < 1:279911/150‑1 (MQ=255) tCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCaac > 2:589535/1‑142 (MQ=255) tCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAAt < 1:589535/143‑1 (MQ=255) tCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGAcc > 2:563091/1‑150 (MQ=255) gCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTg < 2:836784/150‑1 (MQ=255) ccAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTgg > 1:788968/1‑150 (MQ=255) cAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGa > 1:401283/1‑150 (MQ=255) aaGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCATCCGTAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGAc > 1:240381/1‑150 (MQ=255) aGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACg > 2:60442/1‑150 (MQ=255) | GTGCAGGCCAACCAGGCATGGCAGGGCACGGGCATGCAGGTCAATGGGCAGAGCTGGCAGTTGGCGGTATGCACGGGCGGGCAGTGGACGGCGAACCCGGCCACCGGCATGGTTGGCGCGGCGGGCAACCCAAGGTTGATCGCCAAGCCCGGCTATGCCTTGCCTGGTCAACCGGAAGGGGCGTTGATCGGGCGTATCGGCAACAGCGGCGTGCCGTTCCTGGTCGGCAACCAGGTGCAATTGCCGCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACG > NC_002947/1858757‑1859051 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |