New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2447872 = | 31 (0.980) | 4 (0.130) | 4/238 | NT | 13.0% | coding (3254/3318 nt) | PP_2146 | SNF2/RAD54 family helicase |
? | NC_002947 | 2447915 = | 24 (0.790) | coding (3211/3318 nt) | PP_2146 | SNF2/RAD54 family helicase |
GGCGGGTGGAGATTGGTCGGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCGGGTAATCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCAC > NC_002947/2447734‑2448016 | ggcggGTGGAGATTGGTCGGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGcc > 1:197044/1‑150 (MQ=255) ggTCGGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCcag < 2:563538/150‑1 (MQ=255) tCGGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCcagca > 1:107359/1‑150 (MQ=255) gccggccCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTggcg < 1:398358/150‑1 (MQ=255) gctaccgaccgtgcctaccgcatcggccaggacaaaccggtgttcgtgttcaagctgattacccggggtacggtggaagagaagatccagttgttgcagcaggaaaaggcagCATTGGCCGCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTggc > 1:817982‑M1/113‑150 (MQ=255) cggccCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTggcggc < 1:508209/150‑1 (MQ=255) cccTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCaa > 1:64106/1‑150 (MQ=255) gaccgtgcctaccgcatcggccaggacaaaccggtgttcgtgttcaagctgattacccggggtacggtggaagagaagatccagttgttgcagcaggaaaaggcagCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAAtgc > 1:597724‑M1/107‑150 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCAAAagcgg > 2:607093/1‑148 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGcc > 2:576591/1‑150 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGTCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCttt < 2:391498/150‑1 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCttt > 2:148590/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGc > 2:825670/1‑109 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGc < 1:825670/109‑1 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCTCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTc < 1:746410/150‑1 (MQ=255) tCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGcaa < 2:64106/150‑1 (MQ=255) gccaggacaaaccggtgttcgtgttcaagctgattacccggggtacggtggaagagaagatccagttgttgcagcaggaaaaggcagCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGcc < 1:535504‑M1/48‑1 (MQ=255) gccaggacaaaccggtgttcgtgttcaagctgattacccggggtacggtggaagagaagatccagttgttgcagcaggaaaaggcagCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGcc > 2:535504‑M1/88‑135 (MQ=255) ccTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCca < 1:418390/97‑1 (MQ=255) ccTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCca > 2:418390/1‑97 (MQ=255) cTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGAtcttctctt < 1:148590/150‑1 (MQ=255) tACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTa > 1:745746/1‑150 (MQ=255) ccgcGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCgg < 1:591769/150‑1 (MQ=255) ccgcGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCgg < 1:576591/150‑1 (MQ=255) cgcgCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCggg < 1:357570/150‑1 (MQ=255) ttCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCGGGTAATc < 2:818380/150‑1 (MQ=255) tCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCgg > 2:291747/1‑143 (MQ=255) tCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCgg < 1:291747/143‑1 (MQ=255) cGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCGGGTAATCAGCt > 1:560156/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCGGGTAATCAGCTTgaaca < 2:107359/150‑1 (MQ=255) ggCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCGGGTAATCAGCTTgaacacg < 2:197044/150‑1 (MQ=255) cAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCGGGTAATCAGCTTGAACACGAACACCgg < 1:586729/150‑1 (MQ=255) ggCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCGGGTAATCAGCTTGAACACGAACACCGGttt < 2:745746/150‑1 (MQ=255) cttcATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCGATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCGGGTAATCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGa > 2:715246/1‑150 (MQ=255) ttcATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCGGGTAATCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGAt > 1:38924/1‑150 (MQ=255) gccgccATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCGGGTAATCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCAc < 1:607093/150‑1 (MQ=255) gccgccATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCGGGTAATCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCAc < 1:216361/150‑1 (MQ=255) | GGCGGGTGGAGATTGGTCGGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTG‑CC‑‑CAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCACCGTACCCCGGGTAATCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCAC > NC_002947/2447734‑2448016 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |