New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3632310 = | 27 (0.850) | 4 (0.130) | 4/238 | NT | 13.1% | coding (1161/1368 nt) | PP_5590 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3632380 = | 27 (0.890) | coding (1231/1368 nt) | PP_5590 | hypothetical protein |
GACGCCATCCGCTGGGAGCTGCACCGTGTGTGGGTGGTGGAGGCGACGCTGAAGAATGGCCAGCGCCATGTGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAA > NC_002947/3632161‑3632442 | gACGCCATCCGCTGGGAGCTGCACCGTGTGTGGGTGGTGGAGGCGACGCTGAAGAATGGCCAGCGCCATGTGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAg < 2:746597/150‑1 (MQ=255) cgcctgctcagcgcacgccctagccggccatggcgtcggcggtgaacaccgagtccttgtagggcggcacgatgcggtactgttcgttcttgcctgcgaacaggtcaccggcgaaccaggcaccggagagcaggtcgtagaagccGTTgg > 2:440557‑M1/146‑150 (MQ=255) cGCTGGGAGCTGCACCGTGTGTGGGTGGTGGAGGCGACGCTGAAGAATGGCCAGCGCCATGTGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAg < 1:158191/150‑1 (MQ=255) tGCACCGTGTGTGGGTGGTGGAGGCGACGCTGAAGAATGGCCAGCGCCATGTGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGa < 1:844541/150‑1 (MQ=255) cACCGTGTGTGGGCGGTGCAGGCGACGCTGAAGAATGGCCAGCGCCATGTGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGAcc > 2:762769/1‑150 (MQ=255) cGTGTGTGGGTGGTGGAGGCGACGCTGAAGAATGGCCAGCGCCATGTGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCaa > 2:818545/1‑134 (MQ=255) cGTGTGTGGGTGGTGGAGGCGACGCTGAAGAATGGCCAGCGCCATGTGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCaa < 1:818545/134‑1 (MQ=255) tgtttggtgcAGGCGACGCTGAAGAATGGCCAGCGCCATGTGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCggtg < 2:819803/146‑1 (MQ=255) tgggtggTGGAGGCGACGCTGAAGAATGGCCAGCGCCATGTGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCggtg < 2:424603/150‑1 (MQ=255) gtggtgGAGGCGACGCTGAAGAATGGCCAGCGCCATGTGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGgtggtg < 2:442335/150‑1 (MQ=255) caccgagtccttgtagggcggcacgatgcggtactgttcgttcttgcctgcgaacaggtcaccggcgaaccaggcaccggagagcaggtcgtagaagccGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCggg < 2:24510‑M1/51‑1 (MQ=255) gaTGGCTAGCGCCATGCGATGCGGCGTAGCACTCACTACCTCGACGAAGACACCGTGGCTGCCGTGCTGCGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCgtg < 2:127309/149‑1 (MQ=255) aTGGCCAGCGCCATGTGATGCCGCGTAGCACGTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCgtgg > 2:526593/1‑150 (MQ=255) gcCATGTGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGa < 1:571680/150‑1 (MQ=255) gcacgatgcggtactgttcgttcttgcctgcgaacaggtcaccggcgaaccaggcaccggagagcaggtcgtagaagccGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACg > 1:24510‑M1/80‑150 (MQ=255) cgcgTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCt > 1:537890/1‑150 (MQ=255) aGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGAc < 1:265020/150‑1 (MQ=255) tactacCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGa > 2:253019/1‑127 (MQ=255) tactacCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGa < 1:253019/127‑1 (MQ=255) actacCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCgtggt < 2:296745/118‑1 (MQ=255) actacCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCgtggt > 1:296745/1‑118 (MQ=255) ctacCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTc > 1:358849/1‑136 (MQ=255) ctacCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTc < 2:358849/136‑1 (MQ=255) acCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCg < 2:31250/150‑1 (MQ=255) aGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGtt < 2:537890/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGt < 2:628428/144‑1 (MQ=255) ccTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGt > 1:628428/1‑144 (MQ=255) ggcgaaccaggcaccggagagcaggtcgtagaagccGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAAc > 1:592049‑M1/37‑106 (MQ=255) ggcgaaccaggcaccggagagcaggtcgtagaagccGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAAc < 2:592049‑M1/70‑1 (MQ=255) gCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAGGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGc > 2:493254/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCa < 1:526593/150‑1 (MQ=255) tGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAg > 2:819333/1‑150 (MQ=255) tATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAgaacgaa > 2:703158/1‑150 (MQ=255) | GACGCCATCCGCTGGGAGCTGCACCGTGTGTGGGTGGTGGAGGCGACGCTGAAGAATGGCCAGCGCCATGTGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAA > NC_002947/3632161‑3632442 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |