New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3632310 = | 27 (0.850) | 4 (0.130) | 4/238 | NT | 13.1% | coding (1161/1368 nt) | PP_5590 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3632380 = | 27 (0.890) | coding (1231/1368 nt) | PP_5590 | hypothetical protein |
TGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTG > NC_002947/3632231‑3632529 | gcacgatgcggtactgttcgttcttgcctgcgaacaggtcaccggcgaaccaggcaccggagagcaggtcgtagaagccGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACg > 1:24510‑M1/80‑150 (MQ=255) cgcgTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCt > 1:537890/1‑150 (MQ=255) aGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGAc < 1:265020/150‑1 (MQ=255) ctacCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTc < 2:358849/136‑1 (MQ=255) ctacCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTc > 1:358849/1‑136 (MQ=255) acCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCg < 2:31250/150‑1 (MQ=255) aGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGtt < 2:537890/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGt < 2:628428/144‑1 (MQ=255) ccTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGt > 1:628428/1‑144 (MQ=255) gCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAGGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGc > 2:493254/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCa < 1:526593/150‑1 (MQ=255) tGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAg > 2:819333/1‑150 (MQ=255) tATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAgaacgaa > 2:703158/1‑150 (MQ=255) cgttggtcaaggtcaccacgcccggcaggtcaggcagcaccaccggcgaggtccagaccaccttggccaacGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTgc > 1:24510‑M2/72‑150 (MQ=255) gttggtcaaggtcaccacgcccggcaggtcaggcagcaccaccggcgaggtccagaccaccttggccaacGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGcc > 1:592049‑M2/71‑106 (MQ=255) gttggtcaaggtcaccacgcccggcaggtcaggcagcaccaccggcgaggtccagaccaccttggccaacGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGcc < 2:592049‑M2/36‑1 (MQ=255) GCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTgccgc > 1:64943‑M1/1‑148 (MQ=255) GCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTgccgc < 2:64943‑M1/148‑1 (MQ=255) cAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTa > 1:215500/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTAc > 1:228478/1‑150 (MQ=255) tggtCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAgg > 2:765789/1‑150 (MQ=255) cTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCg > 1:256835/1‑92 (MQ=255) cTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCg < 2:256835/92‑1 (MQ=255) ggACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGt < 2:222083/77‑1 (MQ=255) ggACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGt > 1:222083/1‑77 (MQ=255) cccggcaggtcaggcagcaccaccggcgaggtccagaccaccttggccaacGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGgtg < 2:24510‑M2/99‑1 (MQ=255) tgctgcCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACg > 1:798017/1‑150 (MQ=255) ctgcCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGcc > 1:672998/1‑150 (MQ=255) ccTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATg > 2:362713/1‑150 (MQ=255) tGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGc > 2:805610/1‑150 (MQ=255) cGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGg > 1:493254‑M2/1‑149 (MQ=255) gtgACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTgcgc > 2:255764/1‑150 (MQ=255) tgACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCt < 2:701301/150‑1 (MQ=255) gACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATc > 2:59310/1‑88 (MQ=255) gACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATc < 1:59310/88‑1 (MQ=255) ccaacGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCTAGGGCGTGCGCTGAGCAGgcg > 2:440557‑M2/6‑150 (MQ=255) ggCTTCTACGACCGGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCTCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCCTCGCC‑‑GGCCATGGCGTCggcggtgaacaccgagtccttgta > 1:762769‑M2/1‑126 (MQ=255) | TGATGCCGCGTAGCACCTACTACCTCGACGAAGACACCTGGGCTGCCGTGCTGGGCGAGCGCTATGACGCCCGCAACCAGTTGGCCAAGGTGGTCTGGACCTCGCCGGTGGTGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTG > NC_002947/3632231‑3632529 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |